MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.03

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019758	CTAA	2	8	20	27	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019758	CACT	2	8	527	534	25 %	25 %	0 %	50 %	434408148
3	NC_019758	TAGT	2	8	635	642	25 %	50 %	25 %	0 %	434408148
4	NC_019758	CAGC	2	8	1253	1260	25 %	0 %	25 %	50 %	434408148
5	NC_019758	GGAT	2	8	1817	1824	25 %	25 %	50 %	0 %	434408148
6	NC_019758	CAAC	2	8	2234	2241	50 %	0 %	0 %	50 %	434408148
7	NC_019758	GAGT	2	8	2307	2314	25 %	25 %	50 %	0 %	434408148
8	NC_019758	TCAC	2	8	2395	2402	25 %	25 %	0 %	50 %	434408149
9	NC_019758	GAAG	2	8	2659	2666	50 %	0 %	50 %	0 %	434408150
10	NC_019758	AATC	2	8	3798	3805	50 %	25 %	0 %	25 %	434408152
11	NC_019758	ACTC	2	8	3942	3949	25 %	25 %	0 %	50 %	434408152
12	NC_019758	ATTT	2	8	4096	4103	25 %	75 %	0 %	0 %	434408152
13	NC_019758	GAGT	2	8	4190	4197	25 %	25 %	50 %	0 %	434408152
14	NC_019758	TCAA	2	8	5993	6000	50 %	25 %	0 %	25 %	434408155
15	NC_019758	TCCA	2	8	6028	6035	25 %	25 %	0 %	50 %	434408155
16	NC_019758	AAAC	2	8	6353	6360	75 %	0 %	0 %	25 %	434408155
17	NC_019758	ATTA	2	8	6379	6386	50 %	50 %	0 %	0 %	434408155
18	NC_019758	TAAA	2	8	6568	6575	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019758	AATG	2	8	6747	6754	50 %	25 %	25 %	0 %	434408156
20	NC_019758	ACTA	2	8	6768	6775	50 %	25 %	0 %	25 %	434408156
21	NC_019758	ATAG	2	8	7353	7360	50 %	25 %	25 %	0 %	434408156
22	NC_019758	ATTA	2	8	7838	7845	50 %	50 %	0 %	0 %	434408156
23	NC_019758	AACC	2	8	8171	8178	50 %	0 %	0 %	50 %	434408156
24	NC_019758	CTCA	2	8	8344	8351	25 %	25 %	0 %	50 %	434408156
25	NC_019758	ACGG	2	8	8761	8768	25 %	0 %	50 %	25 %	434408157
26	NC_019758	GAAA	2	8	9015	9022	75 %	0 %	25 %	0 %	434408158
27	NC_019758	GATA	2	8	9346	9353	50 %	25 %	25 %	0 %	434408158
28	NC_019758	GTAG	2	8	9594	9601	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019758	AAAT	2	8	9863	9870	75 %	25 %	0 %	0 %	434408159
30	NC_019758	TGCC	2	8	10278	10285	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_019758	TACT	2	8	10987	10994	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_019758	CGGT	2	8	11296	11303	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_019758	CAGC	2	8	11419	11426	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_019758	GCTG	2	8	12719	12726	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_019758	GGCG	2	8	12817	12824	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_019758	CGGT	2	8	13428	13435	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019758	CATC	2	8	13644	13651	25 %	25 %	0 %	50 %	434408161
38	NC_019758	GTAG	2	8	14828	14835	25 %	25 %	50 %	0 %	434408161
39	NC_019758	AAAT	2	8	15108	15115	75 %	25 %	0 %	0 %	434408161
40	NC_019758	CAGA	2	8	15384	15391	50 %	0 %	25 %	25 %	434408161
41	NC_019758	ATCA	2	8	15577	15584	50 %	25 %	0 %	25 %	434408161
42	NC_019758	ATCA	2	8	16108	16115	50 %	25 %	0 %	25 %	434408161
43	NC_019758	TTTA	2	8	16120	16127	25 %	75 %	0 %	0 %	434408161
44	NC_019758	ACAA	2	8	16348	16355	75 %	0 %	0 %	25 %	434408161
45	NC_019758	TTGG	2	8	16716	16723	0 %	50 %	50 %	0 %	434408161
46	NC_019758	CATA	2	8	16812	16819	50 %	25 %	0 %	25 %	434408161
47	NC_019758	GGAA	2	8	19235	19242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019758	CAAT	2	8	19252	19259	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_019758	AATT	2	8	19451	19458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019758	AATC	2	8	20295	20302	50 %	25 %	0 %	25 %	434408167
51	NC_019758	AGGT	2	8	20541	20548	25 %	25 %	50 %	0 %	434408167

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.