MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.03

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019758	A	6	6	66	71	100 %	0 %	0 %	0 %	434408148
2	NC_019758	A	8	8	235	242	100 %	0 %	0 %	0 %	434408148
3	NC_019758	A	6	6	1708	1713	100 %	0 %	0 %	0 %	434408148
4	NC_019758	G	6	6	2207	2212	0 %	0 %	100 %	0 %	434408148
5	NC_019758	T	8	8	2384	2391	0 %	100 %	0 %	0 %	434408149
6	NC_019758	T	6	6	2430	2435	0 %	100 %	0 %	0 %	434408149
7	NC_019758	T	6	6	2687	2692	0 %	100 %	0 %	0 %	434408150
8	NC_019758	A	6	6	2780	2785	100 %	0 %	0 %	0 %	434408150
9	NC_019758	A	7	7	3163	3169	100 %	0 %	0 %	0 %	434408151
10	NC_019758	A	8	8	3254	3261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019758	T	6	6	3294	3299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019758	A	8	8	4967	4974	100 %	0 %	0 %	0 %	434408154
13	NC_019758	A	6	6	5063	5068	100 %	0 %	0 %	0 %	434408154
14	NC_019758	A	6	6	5372	5377	100 %	0 %	0 %	0 %	434408154
15	NC_019758	A	6	6	5484	5489	100 %	0 %	0 %	0 %	434408154
16	NC_019758	A	6	6	5719	5724	100 %	0 %	0 %	0 %	434408154
17	NC_019758	A	6	6	5769	5774	100 %	0 %	0 %	0 %	434408154
18	NC_019758	T	7	7	6228	6234	0 %	100 %	0 %	0 %	434408155
19	NC_019758	A	6	6	7191	7196	100 %	0 %	0 %	0 %	434408156
20	NC_019758	A	6	6	8200	8205	100 %	0 %	0 %	0 %	434408156
21	NC_019758	C	7	7	8812	8818	0 %	0 %	0 %	100 %	434408157
22	NC_019758	G	7	7	8831	8837	0 %	0 %	100 %	0 %	434408157
23	NC_019758	A	6	6	9192	9197	100 %	0 %	0 %	0 %	434408158
24	NC_019758	A	6	6	9232	9237	100 %	0 %	0 %	0 %	434408158
25	NC_019758	A	6	6	9267	9272	100 %	0 %	0 %	0 %	434408158
26	NC_019758	T	6	6	10511	10516	0 %	100 %	0 %	0 %	434408160
27	NC_019758	T	6	6	11003	11008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019758	A	6	6	11393	11398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019758	T	6	6	12747	12752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019758	T	6	6	13267	13272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019758	A	6	6	13403	13408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019758	A	6	6	14535	14540	100 %	0 %	0 %	0 %	434408161
33	NC_019758	T	6	6	14671	14676	0 %	100 %	0 %	0 %	434408161
34	NC_019758	T	6	6	15094	15099	0 %	100 %	0 %	0 %	434408161
35	NC_019758	A	6	6	15180	15185	100 %	0 %	0 %	0 %	434408161
36	NC_019758	T	7	7	15369	15375	0 %	100 %	0 %	0 %	434408161
37	NC_019758	T	6	6	15445	15450	0 %	100 %	0 %	0 %	434408161
38	NC_019758	T	6	6	15960	15965	0 %	100 %	0 %	0 %	434408161
39	NC_019758	T	6	6	16663	16668	0 %	100 %	0 %	0 %	434408161
40	NC_019758	T	7	7	17046	17052	0 %	100 %	0 %	0 %	434408161
41	NC_019758	A	6	6	17297	17302	100 %	0 %	0 %	0 %	434408161
42	NC_019758	T	7	7	17476	17482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019758	T	8	8	17582	17589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019758	T	7	7	17790	17796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019758	T	6	6	18142	18147	0 %	100 %	0 %	0 %	434408163
46	NC_019758	T	6	6	18336	18341	0 %	100 %	0 %	0 %	434408163
47	NC_019758	A	6	6	19160	19165	100 %	0 %	0 %	0 %	434408164
48	NC_019758	A	6	6	19398	19403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019758	T	6	6	20079	20084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.