MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417

Total Repeats: 3220

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019757	GTCCC	2	10	92	101	0 %	20 %	20 %	60 %	434402185
2	NC_019757	CTGGC	2	10	3493	3502	0 %	20 %	40 %	40 %	434402187
3	NC_019757	CACTC	2	10	4606	4615	20 %	20 %	0 %	60 %	434402187
4	NC_019757	GCCCA	2	10	4696	4705	20 %	0 %	20 %	60 %	434402187
5	NC_019757	TCACT	2	10	7445	7454	20 %	40 %	0 %	40 %	434402190
6	NC_019757	TACAC	2	10	7933	7942	40 %	20 %	0 %	40 %	434402190
7	NC_019757	TTCTG	2	10	13863	13872	0 %	60 %	20 %	20 %	434402196
8	NC_019757	GAGTT	2	10	13887	13896	20 %	40 %	40 %	0 %	434402196
9	NC_019757	CAATG	2	10	14912	14921	40 %	20 %	20 %	20 %	434402197
10	NC_019757	AGCCC	2	10	17306	17315	20 %	0 %	20 %	60 %	434402198
11	NC_019757	AATGT	2	10	20898	20907	40 %	40 %	20 %	0 %	434402201
12	NC_019757	TACAA	2	10	21131	21140	60 %	20 %	0 %	20 %	434402201
13	NC_019757	CCAAT	2	10	22078	22087	40 %	20 %	0 %	40 %	434402202
14	NC_019757	GACGC	2	10	25680	25689	20 %	0 %	40 %	40 %	434402204
15	NC_019757	CAGTC	2	10	36427	36436	20 %	20 %	20 %	40 %	434402209
16	NC_019757	AGCGT	2	10	37317	37326	20 %	20 %	40 %	20 %	434402211
17	NC_019757	ATAAC	2	10	38503	38512	60 %	20 %	0 %	20 %	434402213
18	NC_019757	GCCAA	2	10	39913	39922	40 %	0 %	20 %	40 %	434402214
19	NC_019757	TTTGC	2	10	42639	42648	0 %	60 %	20 %	20 %	434402215
20	NC_019757	CAAAA	2	10	47762	47771	80 %	0 %	0 %	20 %	434402218
21	NC_019757	TAAAA	2	10	48516	48525	80 %	20 %	0 %	0 %	434402218
22	NC_019757	TTTTA	2	10	48862	48871	20 %	80 %	0 %	0 %	434402218
23	NC_019757	AGGTG	2	10	50436	50445	20 %	20 %	60 %	0 %	434402219
24	NC_019757	CAAAT	2	10	54730	54739	60 %	20 %	0 %	20 %	434402224
25	NC_019757	CTGCG	2	10	56058	56067	0 %	20 %	40 %	40 %	434402228
26	NC_019757	AATTA	2	10	58943	58952	60 %	40 %	0 %	0 %	434402230
27	NC_019757	CTTTG	2	10	62272	62281	0 %	60 %	20 %	20 %	434402232
28	NC_019757	AATTA	2	10	65108	65117	60 %	40 %	0 %	0 %	434402234
29	NC_019757	TGATT	2	10	68736	68745	20 %	60 %	20 %	0 %	434402237
30	NC_019757	AAGTG	2	10	70918	70927	40 %	20 %	40 %	0 %	434402240
31	NC_019757	CTGGG	2	10	71922	71931	0 %	20 %	60 %	20 %	434402240
32	NC_019757	AGCCG	2	10	75480	75489	20 %	0 %	40 %	40 %	434402244
33	NC_019757	TCAAT	2	10	77169	77178	40 %	40 %	0 %	20 %	434402246
34	NC_019757	CAGAC	2	10	79718	79727	40 %	0 %	20 %	40 %	434402250
35	NC_019757	ATTTT	2	10	80058	80067	20 %	80 %	0 %	0 %	434402251
36	NC_019757	CCAAA	2	10	81335	81344	60 %	0 %	0 %	40 %	434402252
37	NC_019757	CAAGC	2	10	83192	83201	40 %	0 %	20 %	40 %	434402253
38	NC_019757	TAAAT	2	10	83461	83470	60 %	40 %	0 %	0 %	434402253
39	NC_019757	AGATG	2	10	83578	83587	40 %	20 %	40 %	0 %	434402253
40	NC_019757	CCATC	2	10	84250	84259	20 %	20 %	0 %	60 %	434402253
41	NC_019757	AGAAA	2	10	84673	84682	80 %	0 %	20 %	0 %	434402253
42	NC_019757	GCGGT	2	10	92559	92568	0 %	20 %	60 %	20 %	434402260
43	NC_019757	TGGCT	2	10	94839	94848	0 %	40 %	40 %	20 %	434402262
44	NC_019757	GATTT	2	10	98075	98084	20 %	60 %	20 %	0 %	434402267
45	NC_019757	TTGGT	2	10	100142	100151	0 %	60 %	40 %	0 %	434402271
46	NC_019757	GCAAT	2	10	100700	100709	40 %	20 %	20 %	20 %	434402272
47	NC_019757	TGTGG	2	10	103354	103363	0 %	40 %	60 %	0 %	434402274
48	NC_019757	AAATT	2	10	104826	104835	60 %	40 %	0 %	0 %	434402275
49	NC_019757	TGTAC	2	10	106445	106454	20 %	40 %	20 %	20 %	434402276
50	NC_019757	AAAAC	2	10	107384	107393	80 %	0 %	0 %	20 %	434402277
51	NC_019757	CCCAA	2	10	112589	112598	40 %	0 %	0 %	60 %	434402283
52	NC_019757	GTAGG	2	10	114027	114036	20 %	20 %	60 %	0 %	434402284
53	NC_019757	CAACC	2	10	114300	114309	40 %	0 %	0 %	60 %	434402284
54	NC_019757	GAGAT	2	10	115918	115927	40 %	20 %	40 %	0 %	434402286
55	NC_019757	AAAAT	2	10	117063	117072	80 %	20 %	0 %	0 %	434402287
56	NC_019757	GTTTA	2	10	118329	118338	20 %	60 %	20 %	0 %	434402288
57	NC_019757	TAAAT	2	10	121895	121904	60 %	40 %	0 %	0 %	434402292
58	NC_019757	GGATA	2	10	123306	123315	40 %	20 %	40 %	0 %	434402293
59	NC_019757	CCAAA	2	10	123562	123571	60 %	0 %	0 %	40 %	434402293
60	NC_019757	CATAG	2	10	127625	127634	40 %	20 %	20 %	20 %	434402298
61	NC_019757	TCCAA	2	10	132014	132023	40 %	20 %	0 %	40 %	434402301
62	NC_019757	TTACA	2	10	134148	134157	40 %	40 %	0 %	20 %	434402302
63	NC_019757	CATCA	2	10	138712	138721	40 %	20 %	0 %	40 %	434402308
64	NC_019757	ATTTT	2	10	138962	138971	20 %	80 %	0 %	0 %	434402308
65	NC_019757	TGATT	2	10	141923	141932	20 %	60 %	20 %	0 %	434402311
66	NC_019757	GAAAG	2	10	143913	143922	60 %	0 %	40 %	0 %	434402312
67	NC_019757	TGGGA	2	10	144284	144293	20 %	20 %	60 %	0 %	434402312
68	NC_019757	TTGGC	2	10	145995	146004	0 %	40 %	40 %	20 %	434402313
69	NC_019757	ATCCT	2	10	146404	146413	20 %	40 %	0 %	40 %	434402314
70	NC_019757	CAGTT	2	10	146468	146477	20 %	40 %	20 %	20 %	434402314
71	NC_019757	GTGAA	2	10	148675	148684	40 %	20 %	40 %	0 %	434402318
72	NC_019757	ATAAG	2	10	148976	148985	60 %	20 %	20 %	0 %	434402319
73	NC_019757	TTTGT	2	10	150297	150306	0 %	80 %	20 %	0 %	434402322
74	NC_019757	GTCTT	2	10	151767	151776	0 %	60 %	20 %	20 %	434402323
75	NC_019757	TTGGA	2	10	156879	156888	20 %	40 %	40 %	0 %	434402326
76	NC_019757	CAAAA	2	10	162742	162751	80 %	0 %	0 %	20 %	434402330
77	NC_019757	CGCCA	2	10	164038	164047	20 %	0 %	20 %	60 %	434402331
78	NC_019757	TACAA	2	10	166963	166972	60 %	20 %	0 %	20 %	434402334
79	NC_019757	AAATC	2	10	171212	171221	60 %	20 %	0 %	20 %	434402338
80	NC_019757	GTCTT	2	10	174245	174254	0 %	60 %	20 %	20 %	434402339
81	NC_019757	GGTGT	2	10	187205	187214	0 %	40 %	60 %	0 %	434402350
82	NC_019757	CAAGC	2	10	187334	187343	40 %	0 %	20 %	40 %	434402350
83	NC_019757	ATCTG	2	10	189874	189883	20 %	40 %	20 %	20 %	434402351
84	NC_019757	TGGAA	2	10	190961	190970	40 %	20 %	40 %	0 %	434402352
85	NC_019757	CAGCG	2	10	194871	194880	20 %	0 %	40 %	40 %	434402356
86	NC_019757	TGGGT	2	10	200826	200835	0 %	40 %	60 %	0 %	434402360
87	NC_019757	ACCCC	2	10	202293	202302	20 %	0 %	0 %	80 %	434402362
88	NC_019757	AAAGC	2	10	202387	202396	60 %	0 %	20 %	20 %	434402362
89	NC_019757	TATTG	2	10	202984	202993	20 %	60 %	20 %	0 %	434402362
90	NC_019757	AGTCA	2	10	207377	207386	40 %	20 %	20 %	20 %	434402367
91	NC_019757	GAAAA	2	10	210837	210846	80 %	0 %	20 %	0 %	434402368
92	NC_019757	TCTCT	2	10	211860	211869	0 %	60 %	0 %	40 %	434402369
93	NC_019757	TTTAT	2	10	211934	211943	20 %	80 %	0 %	0 %	434402369
94	NC_019757	CAAAA	2	10	214824	214833	80 %	0 %	0 %	20 %	434402373
95	NC_019757	ATAGG	2	10	215668	215677	40 %	20 %	40 %	0 %	434402374
96	NC_019757	ACGCA	2	10	219843	219852	40 %	0 %	20 %	40 %	434402378
97	NC_019757	TTCTG	2	10	223622	223631	0 %	60 %	20 %	20 %	434402380
98	NC_019757	GTGCT	2	10	226043	226052	0 %	40 %	40 %	20 %	434402382
99	NC_019757	TTTAA	2	10	226610	226619	40 %	60 %	0 %	0 %	434402384
100	NC_019757	CAATT	2	10	229920	229929	40 %	40 %	0 %	20 %	434402388
101	NC_019757	AAATC	2	10	232039	232048	60 %	20 %	0 %	20 %	434402389
102	NC_019757	TCTTT	2	10	232171	232180	0 %	80 %	0 %	20 %	434402389
103	NC_019757	CGTTG	2	10	234576	234585	0 %	40 %	40 %	20 %	434402391
104	NC_019757	TCTAA	2	10	238836	238845	40 %	40 %	0 %	20 %	434402396
105	NC_019757	TTAAT	2	10	239083	239092	40 %	60 %	0 %	0 %	434402396
106	NC_019757	GATGG	2	10	241987	241996	20 %	20 %	60 %	0 %	434402400
107	NC_019757	ATGGA	2	10	245005	245014	40 %	20 %	40 %	0 %	434402403
108	NC_019757	TTTAA	2	10	245045	245054	40 %	60 %	0 %	0 %	434402403
109	NC_019757	GCTAG	2	10	249243	249252	20 %	20 %	40 %	20 %	434402409
110	NC_019757	CTCAA	2	10	258647	258656	40 %	20 %	0 %	40 %	434402418
111	NC_019757	ATCTA	2	10	259052	259061	40 %	40 %	0 %	20 %	434402418
112	NC_019757	ACTAA	2	10	261856	261865	60 %	20 %	0 %	20 %	434402421
113	NC_019757	AAGGT	2	10	265144	265153	40 %	20 %	40 %	0 %	434402423
114	NC_019757	AAGTA	2	10	265414	265423	60 %	20 %	20 %	0 %	434402423
115	NC_019757	CAATT	2	10	266827	266836	40 %	40 %	0 %	20 %	434402424
116	NC_019757	AATAA	2	10	270866	270875	80 %	20 %	0 %	0 %	434402428
117	NC_019757	TGATT	2	10	271375	271384	20 %	60 %	20 %	0 %	434402428
118	NC_019757	TCTAA	2	10	275246	275255	40 %	40 %	0 %	20 %	434402433
119	NC_019757	TCAAA	2	10	287167	287176	60 %	20 %	0 %	20 %	434402439
120	NC_019757	ATAGC	2	10	288158	288167	40 %	20 %	20 %	20 %	434402440
121	NC_019757	ACGCG	2	10	289408	289417	20 %	0 %	40 %	40 %	434402441
122	NC_019757	GTTCT	2	10	301060	301069	0 %	60 %	20 %	20 %	434402448
123	NC_019757	CTTCC	2	10	303075	303084	0 %	40 %	0 %	60 %	434402450
124	NC_019757	AATTC	2	10	304627	304636	40 %	40 %	0 %	20 %	434402451
125	NC_019757	GTAGG	2	10	310501	310510	20 %	20 %	60 %	0 %	434402457
126	NC_019757	AATTT	2	10	314182	314191	40 %	60 %	0 %	0 %	434402460
127	NC_019757	AAAAC	2	10	314626	314635	80 %	0 %	0 %	20 %	434402460
128	NC_019757	CTACG	2	10	315671	315680	20 %	20 %	20 %	40 %	434402461
129	NC_019757	CTCAA	2	10	321655	321664	40 %	20 %	0 %	40 %	434402466
130	NC_019757	AGAAA	2	10	324099	324108	80 %	0 %	20 %	0 %	434402468
131	NC_019757	CTTGA	2	10	326973	326982	20 %	40 %	20 %	20 %	434402470
132	NC_019757	ACCAA	2	10	328397	328406	60 %	0 %	0 %	40 %	434402471
133	NC_019757	CAAAG	2	10	329372	329381	60 %	0 %	20 %	20 %	434402472
134	NC_019757	CTACC	2	10	331639	331648	20 %	20 %	0 %	60 %	434402473
135	NC_019757	TCTCT	2	10	340074	340083	0 %	60 %	0 %	40 %	434402478
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246	NC_019757	ACACT	2	10	573663	573672	40 %	20 %	0 %	40 %	434402652
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248	NC_019757	AATCA	2	10	574328	574337	60 %	20 %	0 %	20 %	434402652
249	NC_019757	CTGTT	2	10	585018	585027	0 %	60 %	20 %	20 %	434402658
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251	NC_019757	CGCTA	2	10	601030	601039	20 %	20 %	20 %	40 %	434402672
252	NC_019757	GCTTG	3	15	602318	602332	0 %	40 %	40 %	20 %	434402674
253	NC_019757	TATTT	2	10	602648	602657	20 %	80 %	0 %	0 %	434402674
254	NC_019757	ATTTT	2	10	602675	602684	20 %	80 %	0 %	0 %	434402674
255	NC_019757	CACCC	2	10	603259	603268	20 %	0 %	0 %	80 %	434402675
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257	NC_019757	CTTCA	2	10	607223	607232	20 %	40 %	0 %	40 %	434402679
258	NC_019757	TGGTG	2	10	609174	609183	0 %	40 %	60 %	0 %	434402681
259	NC_019757	TTTGG	2	10	609663	609672	0 %	60 %	40 %	0 %	434402681
260	NC_019757	GGCAA	2	10	612201	612210	40 %	0 %	40 %	20 %	434402684
261	NC_019757	GTACT	2	10	612394	612403	20 %	40 %	20 %	20 %	434402684
262	NC_019757	CTTTA	2	10	614489	614498	20 %	60 %	0 %	20 %	434402686
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