MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417

Total Repeats: 18451

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019757	GTCT	2	8	940	947	0 %	50 %	25 %	25 %	434402185
2	NC_019757	ATTA	2	8	1530	1537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019757	TGGG	2	8	2462	2469	0 %	25 %	75 %	0 %	434402186
4	NC_019757	TGGG	2	8	2978	2985	0 %	25 %	75 %	0 %	434402186
5	NC_019757	GCTC	2	8	3699	3706	0 %	25 %	25 %	50 %	434402187
6	NC_019757	AAGC	2	8	4064	4071	50 %	0 %	25 %	25 %	434402187
7	NC_019757	GATA	2	8	4846	4853	50 %	25 %	25 %	0 %	434402187
8	NC_019757	TGAT	2	8	4883	4890	25 %	50 %	25 %	0 %	434402187
9	NC_019757	TCGG	2	8	5651	5658	0 %	25 %	50 %	25 %	434402187
10	NC_019757	AAAT	2	8	5815	5822	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019757	AGAT	2	8	6655	6662	50 %	25 %	25 %	0 %	434402189
12	NC_019757	ACCA	2	8	6790	6797	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_019757	ACTT	2	8	6954	6961	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_019757	AATA	2	8	7121	7128	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019757	ATTT	2	8	7659	7666	25 %	75 %	0 %	0 %	434402190
16	NC_019757	TTGA	2	8	9021	9028	25 %	50 %	25 %	0 %	434402191
17	NC_019757	ACTC	2	8	9402	9409	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_019757	AAAT	2	8	11492	11499	75 %	25 %	0 %	0 %	434402193
19	NC_019757	AGAT	2	8	11967	11974	50 %	25 %	25 %	0 %	434402194
20	NC_019757	TGCG	2	8	12203	12210	0 %	25 %	50 %	25 %	434402194
21	NC_019757	GATT	2	8	12281	12288	25 %	50 %	25 %	0 %	434402194
22	NC_019757	GGCA	2	8	13001	13008	25 %	0 %	50 %	25 %	434402195
23	NC_019757	AAAG	2	8	13348	13355	75 %	0 %	25 %	0 %	434402195
24	NC_019757	GTAG	2	8	13604	13611	25 %	25 %	50 %	0 %	434402195
25	NC_019757	TTGC	2	8	13918	13925	0 %	50 %	25 %	25 %	434402196
26	NC_019757	CTTC	2	8	13984	13991	0 %	50 %	0 %	50 %	434402196
27	NC_019757	GTTT	2	8	14090	14097	0 %	75 %	25 %	0 %	434402196
28	NC_019757	CAGC	2	8	14964	14971	25 %	0 %	25 %	50 %	434402197
29	NC_019757	TCTT	2	8	15369	15376	0 %	75 %	0 %	25 %	434402197
30	NC_019757	GATT	2	8	15846	15853	25 %	50 %	25 %	0 %	434402197
31	NC_019757	TCTT	2	8	16197	16204	0 %	75 %	0 %	25 %	434402198
32	NC_019757	GAAA	2	8	16490	16497	75 %	0 %	25 %	0 %	434402198
33	NC_019757	AGCA	2	8	16659	16666	50 %	0 %	25 %	25 %	434402198
34	NC_019757	GCCA	2	8	16871	16878	25 %	0 %	25 %	50 %	434402198
35	NC_019757	AAAC	2	8	17019	17026	75 %	0 %	0 %	25 %	434402198
36	NC_019757	TAAC	2	8	17200	17207	50 %	25 %	0 %	25 %	434402198
37	NC_019757	TTCT	2	8	17638	17645	0 %	75 %	0 %	25 %	434402199
38	NC_019757	ACTA	2	8	17843	17850	50 %	25 %	0 %	25 %	434402199
39	NC_019757	CTAA	2	8	18108	18115	50 %	25 %	0 %	25 %	434402199
40	NC_019757	TTCC	2	8	18169	18176	0 %	50 %	0 %	50 %	434402199
41	NC_019757	CCAG	2	8	18276	18283	25 %	0 %	25 %	50 %	434402199
42	NC_019757	CCCA	2	8	18658	18665	25 %	0 %	0 %	75 %	434402200
43	NC_019757	CTGC	2	8	18846	18853	0 %	25 %	25 %	50 %	434402200
44	NC_019757	TGTA	2	8	18915	18922	25 %	50 %	25 %	0 %	434402200
45	NC_019757	TCAA	2	8	19229	19236	50 %	25 %	0 %	25 %	434402200
46	NC_019757	GCCC	2	8	19521	19528	0 %	0 %	25 %	75 %	434402200
47	NC_019757	TTTG	2	8	19544	19551	0 %	75 %	25 %	0 %	434402200
48	NC_019757	ACCC	2	8	19738	19745	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
49	NC_019757	TCAA	2	8	20199	20206	50 %	25 %	0 %	25 %	434402201
50	NC_019757	TCAA	2	8	21249	21256	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_019757	CAAA	2	8	21649	21656	75 %	0 %	0 %	25 %	434402202
52	NC_019757	CTAT	2	8	22663	22670	25 %	50 %	0 %	25 %	434402203
53	NC_019757	ACCA	2	8	22696	22703	50 %	0 %	0 %	50 %	434402203
54	NC_019757	TCCT	2	8	23094	23101	0 %	50 %	0 %	50 %	434402203
55	NC_019757	CTTG	2	8	23245	23252	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_019757	AAGT	2	8	23424	23431	50 %	25 %	25 %	0 %	434402204
57	NC_019757	TCAG	2	8	23512	23519	25 %	25 %	25 %	25 %	434402204
58	NC_019757	GATT	2	8	23679	23686	25 %	50 %	25 %	0 %	434402204
59	NC_019757	ATTT	2	8	23715	23722	25 %	75 %	0 %	0 %	434402204
60	NC_019757	GCTC	2	8	23741	23748	0 %	25 %	25 %	50 %	434402204
61	NC_019757	CCAG	2	8	23924	23931	25 %	0 %	25 %	50 %	434402204
62	NC_019757	AGCC	2	8	23996	24003	25 %	0 %	25 %	50 %	434402204
63	NC_019757	TACA	2	8	24024	24031	50 %	25 %	0 %	25 %	434402204
64	NC_019757	TGCT	2	8	24403	24410	0 %	50 %	25 %	25 %	434402204
65	NC_019757	TGCT	2	8	24453	24460	0 %	50 %	25 %	25 %	434402204
66	NC_019757	AATT	2	8	24621	24628	50 %	50 %	0 %	0 %	434402204
67	NC_019757	CGGA	2	8	24704	24711	25 %	0 %	50 %	25 %	434402204
68	NC_019757	GATA	2	8	24818	24825	50 %	25 %	25 %	0 %	434402204
69	NC_019757	CAAG	2	8	24830	24837	50 %	0 %	25 %	25 %	434402204
70	NC_019757	GATT	2	8	25412	25419	25 %	50 %	25 %	0 %	434402204
71	NC_019757	CGCT	2	8	25493	25500	0 %	25 %	25 %	50 %	434402204
72	NC_019757	TTGA	2	8	25746	25753	25 %	50 %	25 %	0 %	434402204
73	NC_019757	ATCT	2	8	26231	26238	25 %	50 %	0 %	25 %	434402204
74	NC_019757	AAGC	2	8	26283	26290	50 %	0 %	25 %	25 %	434402204
75	NC_019757	TTAA	2	8	26669	26676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019757	TATG	2	8	26756	26763	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019757	ATCA	2	8	27246	27253	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_019757	TCCA	2	8	27438	27445	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_019757	CGAT	2	8	27453	27460	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_019757	CTTA	2	8	27531	27538	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_019757	AAAG	2	8	27548	27555	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019757	ATAA	2	8	28423	28430	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019757	ATTA	2	8	28596	28603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019757	CCAA	2	8	28604	28611	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_019757	TGAT	2	8	29108	29115	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019757	TTCA	2	8	29302	29309	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_019757	GCAA	2	8	29331	29338	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_019757	CTTG	2	8	29778	29785	0 %	50 %	25 %	25 %	434402205
89	NC_019757	AGTC	2	8	29797	29804	25 %	25 %	25 %	25 %	434402205
90	NC_019757	TCAC	2	8	30592	30599	25 %	25 %	0 %	50 %	434402205
91	NC_019757	GATG	2	8	31812	31819	25 %	25 %	50 %	0 %	434402206
92	NC_019757	TCCC	2	8	32210	32217	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
93	NC_019757	GTTG	2	8	32305	32312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019757	ATTC	2	8	32542	32549	25 %	50 %	0 %	25 %	434402207
95	NC_019757	TAAT	2	8	33594	33601	50 %	50 %	0 %	0 %	434402207
96	NC_019757	AGCC	2	8	33782	33789	25 %	0 %	25 %	50 %	434402207
97	NC_019757	TGAT	2	8	33814	33821	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019757	GTTT	2	8	34143	34150	0 %	75 %	25 %	0 %	434402208
99	NC_019757	GTTT	2	8	34832	34839	0 %	75 %	25 %	0 %	434402208
100	NC_019757	AGTC	2	8	35069	35076	25 %	25 %	25 %	25 %	434402208
101	NC_019757	TAAA	2	8	35488	35495	75 %	25 %	0 %	0 %	434402209
102	NC_019757	TTTC	2	8	35586	35593	0 %	75 %	0 %	25 %	434402209
103	NC_019757	CTTT	2	8	35702	35709	0 %	75 %	0 %	25 %	434402209
104	NC_019757	CATC	2	8	35928	35935	25 %	25 %	0 %	50 %	434402209
105	NC_019757	CCAG	2	8	36657	36664	25 %	0 %	25 %	50 %	434402210
106	NC_019757	AGGG	2	8	36687	36694	25 %	0 %	75 %	0 %	434402210
107	NC_019757	AGAT	2	8	39155	39162	50 %	25 %	25 %	0 %	434402213
108	NC_019757	TGCA	2	8	39245	39252	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_019757	GGAC	2	8	39703	39710	25 %	0 %	50 %	25 %	434402214
110	NC_019757	GGGA	2	8	40077	40084	25 %	0 %	75 %	0 %	434402214
111	NC_019757	ATTT	2	8	40672	40679	25 %	75 %	0 %	0 %	434402214
112	NC_019757	GTTT	2	8	40804	40811	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019757	TAAA	2	8	40890	40897	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019757	GGTG	2	8	41065	41072	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019757	AAAC	2	8	41788	41795	75 %	0 %	0 %	25 %	434402215
116	NC_019757	TGGC	2	8	42289	42296	0 %	25 %	50 %	25 %	434402215
117	NC_019757	CATT	2	8	42311	42318	25 %	50 %	0 %	25 %	434402215
118	NC_019757	GCTT	2	8	42735	42742	0 %	50 %	25 %	25 %	434402215
119	NC_019757	GGAC	2	8	43155	43162	25 %	0 %	50 %	25 %	434402215
120	NC_019757	TGCC	2	8	43546	43553	0 %	25 %	25 %	50 %	434402215
121	NC_019757	TAGG	2	8	44082	44089	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019757	GAAG	2	8	44169	44176	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019757	ATAA	2	8	44280	44287	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019757	GCTT	2	8	44886	44893	0 %	50 %	25 %	25 %	434402216
125	NC_019757	CAAA	2	8	45880	45887	75 %	0 %	0 %	25 %	434402217
126	NC_019757	AGCT	2	8	46344	46351	25 %	25 %	25 %	25 %	434402217
127	NC_019757	CCTG	2	8	46689	46696	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_019757	TACT	2	8	46991	46998	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_019757	ATCA	2	8	47435	47442	50 %	25 %	0 %	25 %	434402218
130	NC_019757	TCAA	2	8	48041	48048	50 %	25 %	0 %	25 %	434402218
131	NC_019757	GATA	2	8	48313	48320	50 %	25 %	25 %	0 %	434402218
132	NC_019757	CAAA	2	8	48747	48754	75 %	0 %	0 %	25 %	434402218
133	NC_019757	AATT	2	8	49034	49041	50 %	50 %	0 %	0 %	434402218
134	NC_019757	AATT	2	8	49571	49578	50 %	50 %	0 %	0 %	434402218
135	NC_019757	TAAT	2	8	50500	50507	50 %	50 %	0 %	0 %	434402219
136	NC_019757	TGCT	2	8	50584	50591	0 %	50 %	25 %	25 %	434402220
137	NC_019757	AATT	2	8	50959	50966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019757	AATT	2	8	51028	51035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019757	ACTC	2	8	51110	51117	25 %	25 %	0 %	50 %	434402221
140	NC_019757	TTAG	2	8	53130	53137	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019757	TACT	2	8	53164	53171	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_019757	ATTT	2	8	53288	53295	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019757	TTAT	2	8	53392	53399	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019757	TAAT	2	8	53436	53443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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