MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417

Total Repeats: 14685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019757	TGG	2	6	21	26	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019757	ATT	2	6	1476	1481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019757	GTA	2	6	1765	1770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019757	TAA	3	9	5911	5919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019757	TAA	2	6	6724	6729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019757	TTC	2	6	6760	6765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019757	TGA	2	6	6866	6871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019757	TGC	2	6	8265	8270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019757	TCA	2	6	9479	9484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019757	TAG	2	6	10815	10820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019757	AGC	2	6	10845	10850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019757	GAT	2	6	10864	10869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019757	ACA	2	6	10944	10949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019757	GCT	2	6	15918	15923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_019757	AAT	2	6	21239	21244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019757	CAC	2	6	21297	21302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_019757	AAG	2	6	22244	22249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019757	TCA	2	6	22344	22349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019757	TGA	2	6	22381	22386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019757	GTA	3	9	26784	26792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019757	ATA	2	6	26918	26923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019757	CAG	2	6	27010	27015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_019757	GTT	2	6	27154	27159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019757	CGC	2	6	27203	27208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_019757	TTC	2	6	27273	27278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019757	TGC	2	6	27300	27305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019757	TCA	2	6	27560	27565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019757	ATG	2	6	27625	27630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019757	TGT	2	6	27803	27808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019757	GGT	2	6	27852	27857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019757	GTT	3	9	27981	27989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019757	GCC	2	6	28042	28047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_019757	CAC	2	6	28117	28122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_019757	TTC	2	6	28142	28147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019757	TCT	2	6	28208	28213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019757	AAT	2	6	28401	28406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019757	ATT	2	6	28614	28619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019757	CTA	2	6	28637	28642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019757	GAT	2	6	28792	28797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019757	TGC	2	6	28879	28884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019757	GTT	3	9	28963	28971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019757	TGC	2	6	29170	29175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019757	AGC	2	6	29287	29292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019757	TAG	2	6	29424	29429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019757	AGC	3	9	29449	29457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019757	GCT	2	6	30946	30951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019757	CTC	2	6	30970	30975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_019757	ATC	2	6	30976	30981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019757	CCA	2	6	30988	30993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_019757	CTA	2	6	32173	32178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019757	GTG	2	6	32187	32192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019757	CGA	2	6	32259	32264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019757	TAA	2	6	32268	32273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019757	ACC	2	6	32405	32410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_019757	CAT	2	6	32449	32454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019757	CAG	2	6	32455	32460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019757	TTG	2	6	33837	33842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019757	AGA	2	6	35281	35286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019757	GCT	2	6	36497	36502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019757	ATT	2	6	36537	36542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019757	TAT	2	6	36545	36550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019757	TAA	2	6	37653	37658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019757	CTA	2	6	37660	37665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019757	AGT	2	6	37754	37759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019757	ACT	2	6	37768	37773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019757	ATT	2	6	38256	38261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019757	CTA	2	6	39217	39222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019757	AGT	2	6	40687	40692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019757	AGC	2	6	41018	41023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019757	GCC	2	6	41216	41221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_019757	TAA	2	6	43723	43728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019757	TCA	2	6	43797	43802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_019757	CGC	2	6	43826	43831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_019757	ACC	2	6	43882	43887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_019757	ACA	2	6	43911	43916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019757	TGG	3	9	43925	43933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019757	CGA	2	6	43958	43963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_019757	ATT	2	6	44076	44081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019757	AGT	2	6	44362	44367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019757	ACA	2	6	44378	44383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019757	ATG	2	6	46413	46418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019757	TTG	2	6	46574	46579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019757	CAT	2	6	46656	46661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_019757	TGT	2	6	46812	46817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019757	ATC	2	6	46841	46846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_019757	AGC	2	6	46999	47004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019757	CAT	2	6	50077	50082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019757	AGA	2	6	50099	50104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019757	TTG	2	6	50201	50206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019757	ACT	2	6	50894	50899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019757	TTG	2	6	50900	50905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019757	ACA	2	6	53302	53307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019757	CAA	2	6	53383	53388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_019757	TAT	2	6	55129	55134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019757	ACC	2	6	55669	55674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_019757	TAA	2	6	56740	56745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019757	ATT	2	6	56895	56900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019757	TTC	2	6	56984	56989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_019757	GAC	2	6	57054	57059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019757	TAT	2	6	57109	57114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019757	TTA	2	6	57177	57182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019757	CTG	2	6	57218	57223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019757	CTA	2	6	57245	57250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_019757	TAA	2	6	57420	57425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019757	ATT	2	6	60626	60631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019757	AGG	2	6	60683	60688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019757	TTG	2	6	60927	60932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019757	TGA	2	6	62031	62036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019757	TCT	2	6	62072	62077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_019757	TCC	2	6	63768	63773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_019757	CAA	2	6	63846	63851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_019757	CAC	2	6	67752	67757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_019757	TTG	2	6	67786	67791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019757	CTG	2	6	67930	67935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_019757	CAA	2	6	68094	68099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_019757	GTT	2	6	68272	68277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019757	ATA	2	6	68378	68383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019757	GTA	2	6	68975	68980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019757	GAT	2	6	69603	69608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019757	GCC	2	6	69700	69705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_019757	ATT	2	6	69793	69798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019757	ATT	2	6	70652	70657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019757	TAG	2	6	70660	70665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019757	ATT	2	6	72066	72071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019757	GTT	2	6	72878	72883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019757	AGG	2	6	72931	72936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019757	GAC	2	6	72953	72958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_019757	ATC	2	6	74017	74022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_019757	CAT	2	6	74893	74898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_019757	ATT	2	6	74937	74942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019757	AGT	2	6	74957	74962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019757	CAG	2	6	76797	76802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_019757	AAT	2	6	78493	78498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019757	CAC	2	6	78500	78505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_019757	TAT	2	6	80185	80190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019757	TAT	2	6	80208	80213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019757	ACT	2	6	80535	80540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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139	NC_019757	CTG	2	6	80625	80630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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