MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.08

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019756	TTA	2	6	42	47	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019756	CCA	2	6	249	254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308242
3	NC_019756	TTA	2	6	283	288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308242
4	NC_019756	TAT	2	6	585	590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308242
5	NC_019756	TGC	3	9	833	841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308242
6	NC_019756	AAT	2	6	874	879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308242
7	NC_019756	CTT	3	9	967	975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308243
8	NC_019756	CAG	2	6	1024	1029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308243
9	NC_019756	GCT	3	9	1153	1161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308243
10	NC_019756	ATT	2	6	1319	1324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308243
11	NC_019756	GTT	2	6	1325	1330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308243
12	NC_019756	TGC	2	6	1545	1550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308243
13	NC_019756	GTT	2	6	1652	1657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019756	TAT	2	6	1665	1670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019756	ACG	2	6	1794	1799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308244
16	NC_019756	ATG	2	6	1803	1808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308244
17	NC_019756	ATG	2	6	1947	1952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308244
18	NC_019756	AAT	2	6	2004	2009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019756	ACC	2	6	2018	2023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_019756	CTC	2	6	2025	2030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_019756	ATA	2	6	2165	2170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019756	TAG	2	6	2225	2230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019756	GAA	2	6	2249	2254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308245
24	NC_019756	CTC	2	6	2412	2417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308245
25	NC_019756	GAT	2	6	2522	2527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308245
26	NC_019756	CTG	2	6	2533	2538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308245
27	NC_019756	CAT	2	6	2539	2544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308245
28	NC_019756	AGC	2	6	2569	2574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308245
29	NC_019756	ACG	2	6	2776	2781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308245
30	NC_019756	CGA	2	6	2803	2808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308245
31	NC_019756	ACT	2	6	2845	2850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019756	TTG	2	6	2863	2868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019756	TAT	2	6	3155	3160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308246
34	NC_019756	GTA	2	6	3184	3189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308246
35	NC_019756	GCG	2	6	3317	3322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019756	ATT	2	6	3617	3622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308247
37	NC_019756	AGC	3	9	3674	3682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308247
38	NC_019756	AAG	2	6	3777	3782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308247
39	NC_019756	AAG	2	6	4101	4106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308247
40	NC_019756	TGG	2	6	4235	4240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308247
41	NC_019756	TGA	2	6	4316	4321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308247
42	NC_019756	GAA	2	6	4355	4360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308247
43	NC_019756	TAG	2	6	4369	4374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308247
44	NC_019756	GAT	2	6	4413	4418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019756	ATC	2	6	4448	4453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019756	TTA	2	6	4456	4461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.