MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.06

Total Repeats: 17

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019755	CAATCA	2	12	531	542	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428308219
2	NC_019755	CAAAGA	2	12	2190	2201	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	428308222
3	NC_019755	GTCAAA	2	12	5357	5368	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428308223
4	NC_019755	CTAGAA	2	12	6508	6519	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428308224
5	NC_019755	CCTTAC	2	12	8631	8642	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_019755	GAAAAA	2	12	9255	9266	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	428308226
7	NC_019755	ACTTCT	2	12	9890	9901	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	428308227
8	NC_019755	TTAAAT	2	12	10441	10452	50 %	50 %	0 %	0 %	428308228
9	NC_019755	TATTGT	2	12	10572	10583	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	428308228
10	NC_019755	CTGAAT	2	12	15822	15833	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428308231
11	NC_019755	CCTGAA	2	12	22153	22164	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428308235
12	NC_019755	TGTTAA	2	12	22387	22398	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428308235
13	NC_019755	TCAAAA	2	12	22711	22722	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428308236
14	NC_019755	ATAGCG	2	12	22744	22755	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428308236
15	NC_019755	TTCTGA	2	12	25201	25212	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428308238
16	NC_019755	GGATTA	2	12	25445	25456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308238
17	NC_019755	AGAGCG	2	12	29464	29475	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.