MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.06

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019755	ATTTG	2	10	1239	1248	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019755	GTGCT	2	10	1732	1741	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_019755	ATCAA	2	10	5478	5487	60 %	20 %	0 %	20 %	428308223
4	NC_019755	TGCCT	2	10	5490	5499	0 %	40 %	20 %	40 %	428308223
5	NC_019755	TAGAT	2	10	7728	7737	40 %	40 %	20 %	0 %	428308225
6	NC_019755	TGCCT	2	10	8476	8485	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_019755	GCCTT	2	10	8565	8574	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_019755	TTAAA	2	10	9448	9457	60 %	40 %	0 %	0 %	428308226
9	NC_019755	TAAAG	2	10	9791	9800	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019755	ATTAC	2	10	10126	10135	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_019755	TTTAA	2	10	10383	10392	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019755	CACTT	2	10	12794	12803	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_019755	AAATA	2	10	14114	14123	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019755	ATTGT	2	10	17002	17011	20 %	60 %	20 %	0 %	428308232
15	NC_019755	GCAGG	2	10	18765	18774	20 %	0 %	60 %	20 %	428308232
16	NC_019755	TAAGT	2	10	21051	21060	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019755	AAATT	2	10	24569	24578	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019755	AGCCA	2	10	25879	25888	40 %	0 %	20 %	40 %	428308239
19	NC_019755	TAAGT	2	10	27909	27918	40 %	40 %	20 %	0 %	428308240

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.