MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.06

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019755	GCTG	3	12	128	139	0 %	25 %	50 %	25 %	428308219
2	NC_019755	AGCC	2	8	337	344	25 %	0 %	25 %	50 %	428308219
3	NC_019755	ATGT	2	8	681	688	25 %	50 %	25 %	0 %	428308219
4	NC_019755	TTAT	2	8	864	871	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019755	CTGT	2	8	1420	1427	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_019755	CTTT	2	8	1552	1559	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_019755	CAAT	2	8	3564	3571	50 %	25 %	0 %	25 %	428308222
8	NC_019755	CAAC	2	8	3862	3869	50 %	0 %	0 %	50 %	428308222
9	NC_019755	AAAT	2	8	4119	4126	75 %	25 %	0 %	0 %	428308222
10	NC_019755	AGTT	2	8	4460	4467	25 %	50 %	25 %	0 %	428308222
11	NC_019755	AGCA	2	8	5321	5328	50 %	0 %	25 %	25 %	428308223
12	NC_019755	CTGA	2	8	5377	5384	25 %	25 %	25 %	25 %	428308223
13	NC_019755	GGTC	2	8	5529	5536	0 %	25 %	50 %	25 %	428308223
14	NC_019755	CTTG	2	8	5635	5642	0 %	50 %	25 %	25 %	428308223
15	NC_019755	ATAG	2	8	5660	5667	50 %	25 %	25 %	0 %	428308223
16	NC_019755	CTTT	2	8	6119	6126	0 %	75 %	0 %	25 %	428308224
17	NC_019755	TAAG	2	8	6200	6207	50 %	25 %	25 %	0 %	428308224
18	NC_019755	AGAA	2	8	6591	6598	75 %	0 %	25 %	0 %	428308224
19	NC_019755	CTTT	2	8	6780	6787	0 %	75 %	0 %	25 %	428308224
20	NC_019755	TTGG	2	8	6818	6825	0 %	50 %	50 %	0 %	428308224
21	NC_019755	CAAA	2	8	7408	7415	75 %	0 %	0 %	25 %	428308225
22	NC_019755	AGTC	2	8	7588	7595	25 %	25 %	25 %	25 %	428308225
23	NC_019755	AGTG	2	8	7957	7964	25 %	25 %	50 %	0 %	428308225
24	NC_019755	ATTT	2	8	8238	8245	25 %	75 %	0 %	0 %	428308225
25	NC_019755	GTTT	2	8	8432	8439	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019755	AATT	2	8	9598	9605	50 %	50 %	0 %	0 %	428308226
27	NC_019755	TAAA	2	8	9702	9709	75 %	25 %	0 %	0 %	428308226
28	NC_019755	AAGC	2	8	10899	10906	50 %	0 %	25 %	25 %	428308229
29	NC_019755	CAAG	2	8	11103	11110	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_019755	TTGA	2	8	11381	11388	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019755	GCTC	2	8	11610	11617	0 %	25 %	25 %	50 %	428308230
32	NC_019755	GTCG	2	8	11619	11626	0 %	25 %	50 %	25 %	428308230
33	NC_019755	AGTT	2	8	11713	11720	25 %	50 %	25 %	0 %	428308230
34	NC_019755	GATT	2	8	13396	13403	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019755	TTTC	2	8	13765	13772	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_019755	TGGC	2	8	13947	13954	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019755	CAAA	2	8	14377	14384	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_019755	CATT	2	8	15121	15128	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_019755	GACA	2	8	15238	15245	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_019755	CTCG	2	8	16910	16917	0 %	25 %	25 %	50 %	428308232
41	NC_019755	TTGC	2	8	16929	16936	0 %	50 %	25 %	25 %	428308232
42	NC_019755	AAAG	2	8	17048	17055	75 %	0 %	25 %	0 %	428308232
43	NC_019755	TACA	2	8	17905	17912	50 %	25 %	0 %	25 %	428308232
44	NC_019755	CTAA	2	8	18116	18123	50 %	25 %	0 %	25 %	428308232
45	NC_019755	CTGT	2	8	18339	18346	0 %	50 %	25 %	25 %	428308232
46	NC_019755	CAGC	2	8	18618	18625	25 %	0 %	25 %	50 %	428308232
47	NC_019755	GTAA	2	8	19486	19493	50 %	25 %	25 %	0 %	428308232
48	NC_019755	CTTT	2	8	19619	19626	0 %	75 %	0 %	25 %	428308232
49	NC_019755	GGAA	2	8	19696	19703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019755	TAAA	2	8	20766	20773	75 %	25 %	0 %	0 %	428308234
51	NC_019755	CAGC	2	8	20934	20941	25 %	0 %	25 %	50 %	428308234
52	NC_019755	TTTG	2	8	21454	21461	0 %	75 %	25 %	0 %	428308235
53	NC_019755	GACC	2	8	21648	21655	25 %	0 %	25 %	50 %	428308235
54	NC_019755	TTGC	2	8	22210	22217	0 %	50 %	25 %	25 %	428308235
55	NC_019755	TTAC	2	8	22518	22525	25 %	50 %	0 %	25 %	428308236
56	NC_019755	AATC	2	8	23511	23518	50 %	25 %	0 %	25 %	428308236
57	NC_019755	GCTT	2	8	23688	23695	0 %	50 %	25 %	25 %	428308237
58	NC_019755	GTCA	2	8	23850	23857	25 %	25 %	25 %	25 %	428308237
59	NC_019755	TCAT	2	8	24009	24016	25 %	50 %	0 %	25 %	428308237
60	NC_019755	AAAC	2	8	24327	24334	75 %	0 %	0 %	25 %	428308237
61	NC_019755	GAAA	2	8	24620	24627	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019755	CACC	2	8	24911	24918	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
63	NC_019755	GATA	2	8	25086	25093	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019755	TCAA	2	8	25384	25391	50 %	25 %	0 %	25 %	428308238
65	NC_019755	CTGG	2	8	25437	25444	0 %	25 %	50 %	25 %	428308238
66	NC_019755	TTAA	2	8	26247	26254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019755	ACCA	2	8	26765	26772	50 %	0 %	0 %	50 %	428308240
68	NC_019755	ACCA	2	8	26847	26854	50 %	0 %	0 %	50 %	428308240
69	NC_019755	TGCT	2	8	27630	27637	0 %	50 %	25 %	25 %	428308240
70	NC_019755	TCAA	2	8	27880	27887	50 %	25 %	0 %	25 %	428308240
71	NC_019755	AACC	2	8	27949	27956	50 %	0 %	0 %	50 %	428308240
72	NC_019755	ATTT	2	8	28965	28972	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019755	ATAA	2	8	29002	29009	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019755	ATTG	2	8	29442	29449	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.