MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.03

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019754	CACATT	2	12	709	720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308170
2	NC_019754	AACACC	2	12	825	836	50 %	0 %	0 %	50 %	428308170
3	NC_019754	GCTACA	2	12	3831	3842	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428308171
4	NC_019754	TAAATA	2	12	4211	4222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308171
5	NC_019754	CAGAAA	2	12	6276	6287	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	428308173
6	NC_019754	ATAGCC	2	12	8224	8235	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428308174
7	NC_019754	TAAATA	2	12	10862	10873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308177
8	NC_019754	AACTAA	2	12	13394	13405	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428308181
9	NC_019754	CTGATG	2	12	13609	13620	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428308181
10	NC_019754	ACCGCA	2	12	20673	20684	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428308186
11	NC_019754	CAAAGC	2	12	23921	23932	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428308188
12	NC_019754	TTTTCC	2	12	26114	26125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308190
13	NC_019754	TCGCTA	2	12	30222	30233	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428308195
14	NC_019754	TTGGGG	2	12	30648	30659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308195
15	NC_019754	TCAGCT	2	12	31917	31928	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428308198
16	NC_019754	AGAGCC	2	12	36944	36955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308204
17	NC_019754	TTTTAT	2	12	42127	42138	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	428308210
18	NC_019754	CTAGCA	2	12	44529	44540	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428308212
19	NC_019754	ATCTTT	2	12	47524	47535	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	428308215
20	NC_019754	ATCCTC	2	12	48152	48163	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	428308216
21	NC_019754	TTGTGC	2	12	48275	48286	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428308216
22	NC_019754	AACGCT	2	12	48665	48676	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428308217

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.