MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.03

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019754	AAATT	2	10	1378	1387	60 %	40 %	0 %	0 %	428308170
2	NC_019754	TGCAC	2	10	2811	2820	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_019754	ACTGC	2	10	5595	5604	20 %	20 %	20 %	40 %	428308172
4	NC_019754	ATATT	2	10	6031	6040	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019754	TGTAG	2	10	7471	7480	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019754	TCTGT	2	10	11564	11573	0 %	60 %	20 %	20 %	428308178
7	NC_019754	AAATT	2	10	12897	12906	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019754	GTTGC	2	10	13309	13318	0 %	40 %	40 %	20 %	428308181
9	NC_019754	CTGTT	2	10	14261	14270	0 %	60 %	20 %	20 %	428308183
10	NC_019754	TCTTT	2	10	16355	16364	0 %	80 %	0 %	20 %	428308184
11	NC_019754	GTTTT	2	10	17587	17596	0 %	80 %	20 %	0 %	428308184
12	NC_019754	CTGCT	2	10	21879	21888	0 %	40 %	20 %	40 %	428308187
13	NC_019754	TCTTT	2	10	23181	23190	0 %	80 %	0 %	20 %	428308187
14	NC_019754	TCCAA	2	10	23483	23492	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_019754	TCTGG	2	10	27178	27187	0 %	40 %	40 %	20 %	428308192
16	NC_019754	GAAAA	2	10	27380	27389	80 %	0 %	20 %	0 %	428308192
17	NC_019754	ATGAT	2	10	29172	29181	40 %	40 %	20 %	0 %	428308193
18	NC_019754	CCCCT	2	10	30956	30965	0 %	20 %	0 %	80 %	428308196
19	NC_019754	CTTAC	2	10	31301	31310	20 %	40 %	0 %	40 %	428308197
20	NC_019754	ACCCG	2	10	32277	32286	20 %	0 %	20 %	60 %	428308199
21	NC_019754	TTCGC	2	10	33384	33393	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_019754	AATAA	2	10	33517	33526	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019754	GGCTC	2	10	33809	33818	0 %	20 %	40 %	40 %	428308202
24	NC_019754	TGCCT	2	10	34904	34913	0 %	40 %	20 %	40 %	428308204
25	NC_019754	CAGAT	2	10	37618	37627	40 %	20 %	20 %	20 %	428308204
26	NC_019754	ATCAA	2	10	37709	37718	60 %	20 %	0 %	20 %	428308204
27	NC_019754	AACTA	2	10	38225	38234	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_019754	ATACA	2	10	45159	45168	60 %	20 %	0 %	20 %	428308214
29	NC_019754	CAACT	2	10	46139	46148	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_019754	AAACT	2	10	47465	47474	60 %	20 %	0 %	20 %	428308215
31	NC_019754	CAAAT	2	10	48468	48477	60 %	20 %	0 %	20 %	428308216
32	NC_019754	ACCCA	2	10	50120	50129	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.