MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.03

Total Repeats: 519

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019754	AAG	2	6	84	89	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308169
2	NC_019754	CAA	2	6	94	99	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308169
3	NC_019754	AAG	2	6	204	209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308169
4	NC_019754	GAA	2	6	526	531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308170
5	NC_019754	AGA	2	6	738	743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308170
6	NC_019754	AAG	2	6	780	785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308170
7	NC_019754	AGC	2	6	838	843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308170
8	NC_019754	ACT	2	6	868	873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308170
9	NC_019754	CAA	2	6	955	960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308170
10	NC_019754	CCT	2	6	984	989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308170
11	NC_019754	GTC	2	6	1181	1186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308170
12	NC_019754	TAA	2	6	1260	1265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308170
13	NC_019754	TAC	2	6	1292	1297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308170
14	NC_019754	TGA	2	6	1329	1334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308170
15	NC_019754	TAG	2	6	1347	1352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308170
16	NC_019754	TGA	2	6	1353	1358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308170
17	NC_019754	ATG	3	9	1367	1375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308170
18	NC_019754	GAT	2	6	1411	1416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308170
19	NC_019754	AGC	2	6	1479	1484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308170
20	NC_019754	CGT	2	6	1495	1500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308170
21	NC_019754	AGA	2	6	1530	1535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308170
22	NC_019754	AAT	2	6	1546	1551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308170
23	NC_019754	AAT	2	6	1570	1575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308170
24	NC_019754	ATG	2	6	1679	1684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308170
25	NC_019754	GAT	3	9	1837	1845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308170
26	NC_019754	AAT	2	6	1846	1851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308170
27	NC_019754	CTG	2	6	1928	1933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308170
28	NC_019754	CTG	2	6	1945	1950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308170
29	NC_019754	ATG	3	9	1976	1984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308170
30	NC_019754	AAG	2	6	2102	2107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308170
31	NC_019754	TAA	2	6	2160	2165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308170
32	NC_019754	TGT	2	6	2307	2312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308170
33	NC_019754	TGA	2	6	2328	2333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308170
34	NC_019754	AGA	2	6	2349	2354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308170
35	NC_019754	ACA	2	6	2424	2429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308170
36	NC_019754	CAC	2	6	2483	2488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308170
37	NC_019754	ACT	2	6	3299	3304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308171
38	NC_019754	TGA	2	6	3418	3423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308171
39	NC_019754	TCT	2	6	3549	3554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308171
40	NC_019754	TCT	2	6	3585	3590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308171
41	NC_019754	TGT	2	6	3615	3620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308171
42	NC_019754	AAG	2	6	3698	3703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308171
43	NC_019754	GTT	2	6	3730	3735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308171
44	NC_019754	TTA	2	6	3868	3873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308171
45	NC_019754	GTT	2	6	3886	3891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308171
46	NC_019754	AGC	3	9	3983	3991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308171
47	NC_019754	CTG	2	6	4109	4114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308171
48	NC_019754	GTC	2	6	4136	4141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308171
49	NC_019754	TAT	2	6	4309	4314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308171
50	NC_019754	TCA	2	6	4323	4328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308171
51	NC_019754	TTA	2	6	4329	4334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308171
52	NC_019754	ATA	2	6	4380	4385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308171
53	NC_019754	TAA	2	6	4457	4462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308171
54	NC_019754	TCT	2	6	4464	4469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308171
55	NC_019754	AGA	2	6	4515	4520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308171
56	NC_019754	CAG	2	6	4621	4626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308171
57	NC_019754	ATT	2	6	4667	4672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308171
58	NC_019754	GAT	2	6	4673	4678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308171
59	NC_019754	TAA	2	6	5581	5586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308172
60	NC_019754	ATA	2	6	6177	6182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308173
61	NC_019754	TAT	2	6	6251	6256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308173
62	NC_019754	ATC	2	6	6313	6318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308173
63	NC_019754	ACA	2	6	6350	6355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308173
64	NC_019754	GTA	2	6	6391	6396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308173
65	NC_019754	TGA	2	6	7519	7524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308174
66	NC_019754	ATC	2	6	7546	7551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308174
67	NC_019754	CGC	2	6	7601	7606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308174
68	NC_019754	GCA	2	6	7621	7626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308174
69	NC_019754	AGT	2	6	7716	7721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308174
70	NC_019754	TAA	2	6	7757	7762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308174
71	NC_019754	CGT	2	6	7789	7794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308174
72	NC_019754	GAT	2	6	7924	7929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308174
73	NC_019754	CAA	2	6	7959	7964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308174
74	NC_019754	AGT	2	6	8052	8057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308174
75	NC_019754	CTC	2	6	8143	8148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308174
76	NC_019754	AGC	2	6	8151	8156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308174
77	NC_019754	TTG	2	6	8268	8273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308174
78	NC_019754	GTT	2	6	8283	8288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308174
79	NC_019754	ATC	2	6	8439	8444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308174
80	NC_019754	ATT	2	6	8479	8484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308174
81	NC_019754	AAG	2	6	8501	8506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308174
82	NC_019754	AAT	2	6	8516	8521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308174
83	NC_019754	CGC	2	6	8545	8550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308174
84	NC_019754	GTT	2	6	8950	8955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308175
85	NC_019754	ACT	2	6	9005	9010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308175
86	NC_019754	GTA	2	6	9081	9086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308175
87	NC_019754	AAC	2	6	9132	9137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308175
88	NC_019754	TTC	2	6	9940	9945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308176
89	NC_019754	CTC	2	6	9946	9951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308176
90	NC_019754	TAC	2	6	9998	10003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308176
91	NC_019754	ATA	2	6	10144	10149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308177
92	NC_019754	AAG	2	6	10279	10284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308177
93	NC_019754	TGT	2	6	10552	10557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308177
94	NC_019754	CTA	2	6	10678	10683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308177
95	NC_019754	TCG	2	6	11172	11177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308177
96	NC_019754	GCA	2	6	11190	11195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308177
97	NC_019754	TAG	2	6	11397	11402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308178
98	NC_019754	ACC	2	6	11442	11447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308178
99	NC_019754	CAT	2	6	11460	11465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308178
100	NC_019754	AAC	2	6	11485	11490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308178
101	NC_019754	TGT	2	6	11501	11506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308178
102	NC_019754	ATT	2	6	11649	11654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308179
103	NC_019754	CTG	2	6	11689	11694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308179
104	NC_019754	GTC	2	6	11701	11706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308179
105	NC_019754	CTG	2	6	11776	11781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308179
106	NC_019754	CTG	2	6	11872	11877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308179
107	NC_019754	CTT	2	6	11899	11904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308179
108	NC_019754	GAA	2	6	12028	12033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308180
109	NC_019754	AGC	2	6	12060	12065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308180
110	NC_019754	CAG	2	6	12077	12082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308180
111	NC_019754	CTT	2	6	12149	12154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308180
112	NC_019754	GGA	2	6	12166	12171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308180
113	NC_019754	TGC	2	6	12198	12203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308180
114	NC_019754	TAC	2	6	12336	12341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308180
115	NC_019754	TCA	2	6	12379	12384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308180
116	NC_019754	ACA	2	6	13200	13205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308181
117	NC_019754	AAC	2	6	13330	13335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308181
118	NC_019754	ATT	2	6	13448	13453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308181
119	NC_019754	GAT	2	6	13536	13541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308181
120	NC_019754	GCT	2	6	13562	13567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308181
121	NC_019754	TAA	2	6	13643	13648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308181
122	NC_019754	TAT	2	6	13651	13656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308181
123	NC_019754	TAA	2	6	13676	13681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308181
124	NC_019754	CAT	2	6	13913	13918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308182
125	NC_019754	AGA	2	6	13933	13938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308182
126	NC_019754	GTT	2	6	14032	14037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308182
127	NC_019754	AAT	2	6	14309	14314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308183
128	NC_019754	CTT	2	6	14362	14367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308183
129	NC_019754	TCA	2	6	14406	14411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308183
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131	NC_019754	GAT	2	6	14523	14528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308183
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133	NC_019754	TAA	2	6	14596	14601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308183
134	NC_019754	TTA	2	6	14718	14723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308183
135	NC_019754	TTC	2	6	14748	14753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308183
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137	NC_019754	TTC	2	6	14845	14850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308183
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141	NC_019754	TAA	2	6	15148	15153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308183
142	NC_019754	CTT	2	6	15255	15260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308183
143	NC_019754	CTT	2	6	15394	15399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308183
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152	NC_019754	CTT	2	6	16707	16712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308184
153	NC_019754	TTC	3	9	16755	16763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308184
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161	NC_019754	ATT	2	6	17349	17354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308184
162	NC_019754	GGT	2	6	17498	17503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308184
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