MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.03

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019754	AC	4	8	193	200	50 %	0 %	0 %	50 %	428308169
2	NC_019754	GT	3	6	753	758	0 %	50 %	50 %	0 %	428308170
3	NC_019754	TA	3	6	3448	3453	50 %	50 %	0 %	0 %	428308171
4	NC_019754	CA	3	6	3603	3608	50 %	0 %	0 %	50 %	428308171
5	NC_019754	TC	3	6	4077	4082	0 %	50 %	0 %	50 %	428308171
6	NC_019754	AT	3	6	4701	4706	50 %	50 %	0 %	0 %	428308171
7	NC_019754	TA	4	8	4821	4828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019754	GC	3	6	5455	5460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_019754	CA	3	6	5551	5556	50 %	0 %	0 %	50 %	428308172
10	NC_019754	CG	3	6	9315	9320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_019754	AC	3	6	10060	10065	50 %	0 %	0 %	50 %	428308176
12	NC_019754	GA	3	6	10267	10272	50 %	0 %	50 %	0 %	428308177
13	NC_019754	TC	3	6	11916	11921	0 %	50 %	0 %	50 %	428308179
14	NC_019754	TA	4	8	13043	13050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019754	AT	3	6	13053	13058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019754	TA	3	6	13083	13088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019754	TA	3	6	13102	13107	50 %	50 %	0 %	0 %	428308181
18	NC_019754	AT	3	6	13346	13351	50 %	50 %	0 %	0 %	428308181
19	NC_019754	TA	3	6	14801	14806	50 %	50 %	0 %	0 %	428308183
20	NC_019754	TC	3	6	14949	14954	0 %	50 %	0 %	50 %	428308183
21	NC_019754	TA	3	6	14981	14986	50 %	50 %	0 %	0 %	428308183
22	NC_019754	TA	3	6	15071	15076	50 %	50 %	0 %	0 %	428308183
23	NC_019754	TA	3	6	15169	15174	50 %	50 %	0 %	0 %	428308183
24	NC_019754	TG	3	6	20471	20476	0 %	50 %	50 %	0 %	428308186
25	NC_019754	GA	3	6	22251	22256	50 %	0 %	50 %	0 %	428308187
26	NC_019754	TC	3	6	22337	22342	0 %	50 %	0 %	50 %	428308187
27	NC_019754	AC	3	6	23018	23023	50 %	0 %	0 %	50 %	428308187
28	NC_019754	AC	3	6	23713	23718	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_019754	TC	3	6	24459	24464	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_019754	GA	3	6	25577	25582	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019754	CT	3	6	25593	25598	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019754	TC	3	6	25792	25797	0 %	50 %	0 %	50 %	428308190
33	NC_019754	AT	3	6	26584	26589	50 %	50 %	0 %	0 %	428308191
34	NC_019754	TA	3	6	27147	27152	50 %	50 %	0 %	0 %	428308192
35	NC_019754	GA	3	6	27399	27404	50 %	0 %	50 %	0 %	428308192
36	NC_019754	AT	3	6	27458	27463	50 %	50 %	0 %	0 %	428308192
37	NC_019754	AT	3	6	27569	27574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019754	AC	3	6	27575	27580	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_019754	TG	3	6	28434	28439	0 %	50 %	50 %	0 %	428308193
40	NC_019754	AT	3	6	30051	30056	50 %	50 %	0 %	0 %	428308194
41	NC_019754	AT	3	6	30069	30074	50 %	50 %	0 %	0 %	428308194
42	NC_019754	AT	3	6	31366	31371	50 %	50 %	0 %	0 %	428308197
43	NC_019754	AT	3	6	31567	31572	50 %	50 %	0 %	0 %	428308197
44	NC_019754	AC	3	6	32235	32240	50 %	0 %	0 %	50 %	428308199
45	NC_019754	AG	3	6	33038	33043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019754	CT	3	6	34767	34772	0 %	50 %	0 %	50 %	428308203
47	NC_019754	AG	3	6	35024	35029	50 %	0 %	50 %	0 %	428308204
48	NC_019754	TA	3	6	35310	35315	50 %	50 %	0 %	0 %	428308204
49	NC_019754	GA	3	6	35810	35815	50 %	0 %	50 %	0 %	428308204
50	NC_019754	GA	3	6	36651	36656	50 %	0 %	50 %	0 %	428308204
51	NC_019754	AT	3	6	36679	36684	50 %	50 %	0 %	0 %	428308204
52	NC_019754	TA	3	6	37585	37590	50 %	50 %	0 %	0 %	428308204
53	NC_019754	GT	3	6	37592	37597	0 %	50 %	50 %	0 %	428308204
54	NC_019754	AG	3	6	38405	38410	50 %	0 %	50 %	0 %	428308205
55	NC_019754	CA	3	6	38614	38619	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_019754	AG	3	6	39029	39034	50 %	0 %	50 %	0 %	428308206
57	NC_019754	TG	3	6	40630	40635	0 %	50 %	50 %	0 %	428308209
58	NC_019754	TA	3	6	41891	41896	50 %	50 %	0 %	0 %	428308210
59	NC_019754	GA	3	6	42960	42965	50 %	0 %	50 %	0 %	428308211
60	NC_019754	AG	3	6	43756	43761	50 %	0 %	50 %	0 %	428308211
61	NC_019754	CA	3	6	44647	44652	50 %	0 %	0 %	50 %	428308212
62	NC_019754	CA	3	6	45167	45172	50 %	0 %	0 %	50 %	428308214
63	NC_019754	TA	3	6	45826	45831	50 %	50 %	0 %	0 %	428308214
64	NC_019754	TA	3	6	45932	45937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019754	AG	3	6	46351	46356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019754	CA	3	6	46735	46740	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_019754	AT	3	6	46988	46993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019754	GA	3	6	47029	47034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019754	GT	3	6	47203	47208	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019754	AT	4	8	47299	47306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019754	TA	3	6	47744	47749	50 %	50 %	0 %	0 %	428308215

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.