MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.03

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019754	A	6	6	249	254	100 %	0 %	0 %	0 %	428308169
2	NC_019754	A	6	6	799	804	100 %	0 %	0 %	0 %	428308170
3	NC_019754	A	6	6	2847	2852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019754	A	6	6	2919	2924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019754	A	6	6	3423	3428	100 %	0 %	0 %	0 %	428308171
6	NC_019754	T	6	6	3708	3713	0 %	100 %	0 %	0 %	428308171
7	NC_019754	T	6	6	3779	3784	0 %	100 %	0 %	0 %	428308171
8	NC_019754	T	6	6	4361	4366	0 %	100 %	0 %	0 %	428308171
9	NC_019754	A	6	6	4579	4584	100 %	0 %	0 %	0 %	428308171
10	NC_019754	A	6	6	5963	5968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019754	T	6	6	6062	6067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019754	A	6	6	6074	6079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019754	A	7	7	6368	6374	100 %	0 %	0 %	0 %	428308173
14	NC_019754	A	6	6	6960	6965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019754	A	6	6	7040	7045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019754	A	6	6	7186	7191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019754	A	6	6	7267	7272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019754	A	6	6	7275	7280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019754	A	6	6	7392	7397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019754	T	6	6	7662	7667	0 %	100 %	0 %	0 %	428308174
21	NC_019754	A	6	6	8305	8310	100 %	0 %	0 %	0 %	428308174
22	NC_019754	T	6	6	8491	8496	0 %	100 %	0 %	0 %	428308174
23	NC_019754	A	7	7	8656	8662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019754	A	7	7	9875	9881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019754	A	6	6	10470	10475	100 %	0 %	0 %	0 %	428308177
26	NC_019754	A	6	6	10560	10565	100 %	0 %	0 %	0 %	428308177
27	NC_019754	A	6	6	10604	10609	100 %	0 %	0 %	0 %	428308177
28	NC_019754	T	6	6	10877	10882	0 %	100 %	0 %	0 %	428308177
29	NC_019754	C	6	6	11129	11134	0 %	0 %	0 %	100 %	428308177
30	NC_019754	A	6	6	11229	11234	100 %	0 %	0 %	0 %	428308177
31	NC_019754	T	6	6	12842	12847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019754	A	6	6	13128	13133	100 %	0 %	0 %	0 %	428308181
33	NC_019754	A	7	7	13801	13807	100 %	0 %	0 %	0 %	428308182
34	NC_019754	A	6	6	13999	14004	100 %	0 %	0 %	0 %	428308182
35	NC_019754	T	6	6	15642	15647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019754	T	6	6	16122	16127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019754	T	6	6	17001	17006	0 %	100 %	0 %	0 %	428308184
38	NC_019754	T	6	6	18125	18130	0 %	100 %	0 %	0 %	428308184
39	NC_019754	T	6	6	18933	18938	0 %	100 %	0 %	0 %	428308184
40	NC_019754	T	6	6	19955	19960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019754	T	6	6	20137	20142	0 %	100 %	0 %	0 %	428308186
42	NC_019754	A	6	6	22230	22235	100 %	0 %	0 %	0 %	428308187
43	NC_019754	C	6	6	22861	22866	0 %	0 %	0 %	100 %	428308187
44	NC_019754	C	6	6	23092	23097	0 %	0 %	0 %	100 %	428308187
45	NC_019754	A	6	6	24279	24284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019754	A	6	6	24414	24419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019754	A	6	6	24701	24706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019754	T	7	7	24718	24724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019754	A	6	6	25190	25195	100 %	0 %	0 %	0 %	428308189
50	NC_019754	A	7	7	25217	25223	100 %	0 %	0 %	0 %	428308189
51	NC_019754	A	7	7	25343	25349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019754	T	6	6	25781	25786	0 %	100 %	0 %	0 %	428308190
53	NC_019754	T	6	6	26071	26076	0 %	100 %	0 %	0 %	428308190
54	NC_019754	T	8	8	26813	26820	0 %	100 %	0 %	0 %	428308192
55	NC_019754	A	6	6	26832	26837	100 %	0 %	0 %	0 %	428308192
56	NC_019754	T	6	6	26878	26883	0 %	100 %	0 %	0 %	428308192
57	NC_019754	A	6	6	26909	26914	100 %	0 %	0 %	0 %	428308192
58	NC_019754	T	7	7	27299	27305	0 %	100 %	0 %	0 %	428308192
59	NC_019754	T	6	6	27415	27420	0 %	100 %	0 %	0 %	428308192
60	NC_019754	C	6	6	29062	29067	0 %	0 %	0 %	100 %	428308193
61	NC_019754	T	6	6	29571	29576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019754	T	6	6	29682	29687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019754	A	6	6	31084	31089	100 %	0 %	0 %	0 %	428308196
64	NC_019754	G	6	6	31942	31947	0 %	0 %	100 %	0 %	428308198
65	NC_019754	T	6	6	32102	32107	0 %	100 %	0 %	0 %	428308198
66	NC_019754	A	6	6	33933	33938	100 %	0 %	0 %	0 %	428308202
67	NC_019754	T	6	6	34259	34264	0 %	100 %	0 %	0 %	428308202
68	NC_019754	G	6	6	36141	36146	0 %	0 %	100 %	0 %	428308204
69	NC_019754	A	6	6	36327	36332	100 %	0 %	0 %	0 %	428308204
70	NC_019754	A	6	6	36428	36433	100 %	0 %	0 %	0 %	428308204
71	NC_019754	A	6	6	37119	37124	100 %	0 %	0 %	0 %	428308204
72	NC_019754	A	6	6	37257	37262	100 %	0 %	0 %	0 %	428308204
73	NC_019754	T	6	6	38743	38748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019754	A	7	7	39968	39974	100 %	0 %	0 %	0 %	428308206
75	NC_019754	A	7	7	40043	40049	100 %	0 %	0 %	0 %	428308207
76	NC_019754	A	7	7	40363	40369	100 %	0 %	0 %	0 %	428308208
77	NC_019754	T	6	6	40861	40866	0 %	100 %	0 %	0 %	428308209
78	NC_019754	A	6	6	41161	41166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019754	A	6	6	41173	41178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019754	T	7	7	41758	41764	0 %	100 %	0 %	0 %	428308210
81	NC_019754	T	7	7	43197	43203	0 %	100 %	0 %	0 %	428308211
82	NC_019754	T	6	6	43358	43363	0 %	100 %	0 %	0 %	428308211
83	NC_019754	T	6	6	43827	43832	0 %	100 %	0 %	0 %	428308211
84	NC_019754	C	6	6	44011	44016	0 %	0 %	0 %	100 %	428308211
85	NC_019754	A	6	6	44402	44407	100 %	0 %	0 %	0 %	428308212
86	NC_019754	T	7	7	44716	44722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019754	T	7	7	44876	44882	0 %	100 %	0 %	0 %	428308213
88	NC_019754	A	6	6	45245	45250	100 %	0 %	0 %	0 %	428308214
89	NC_019754	A	6	6	45858	45863	100 %	0 %	0 %	0 %	428308214
90	NC_019754	T	6	6	46017	46022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019754	A	7	7	46299	46305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019754	A	6	6	46318	46323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019754	A	6	6	46329	46334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019754	T	6	6	46479	46484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019754	T	6	6	47002	47007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019754	T	7	7	47775	47781	0 %	100 %	0 %	0 %	428308215
97	NC_019754	A	7	7	48101	48107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019754	C	6	6	48741	48746	0 %	0 %	0 %	100 %	428308217
99	NC_019754	A	6	6	49331	49336	100 %	0 %	0 %	0 %	428308217
100	NC_019754	A	6	6	49928	49933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019754	A	6	6	50035	50040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019754	A	6	6	50511	50516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.