MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 chromosome

Total Repeats: 955

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019753	ACCCC	2	10	1435	1444	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
2	NC_019753	GAAAA	2	10	7082	7091	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019753	CTATT	2	10	8806	8815	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_019753	AAAAG	2	10	11334	11343	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019753	TTTAC	2	10	21859	21868	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_019753	ATTTT	2	10	32310	32319	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019753	GAGAG	2	10	41681	41690	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019753	CTGAA	2	10	44961	44970	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_019753	TTTTA	2	10	45053	45062	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019753	TCTAA	2	10	45491	45500	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_019753	GGGGT	2	10	47038	47047	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019753	ATTGA	2	10	59247	59256	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019753	TACCT	2	10	63278	63287	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_019753	CATAT	2	10	76535	76544	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_019753	ACCCC	2	10	77151	77160	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
16	NC_019753	TTTGC	2	10	77602	77611	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_019753	TAAAA	2	10	93054	93063	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019753	AATTT	2	10	94288	94297	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019753	AAAAT	2	10	97064	97073	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019753	GGTTC	2	10	97218	97227	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_019753	ATCCA	2	10	100372	100381	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_019753	TAAAA	2	10	100556	100565	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019753	TTAAT	2	10	118984	118993	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019753	TAGTT	2	10	119025	119034	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019753	AACAT	2	10	119377	119386	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_019753	GAAGG	2	10	123882	123891	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019753	TAATA	2	10	129169	129178	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019753	AAAAT	2	10	131156	131165	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019753	TTATC	2	10	133933	133942	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_019753	AGAGT	2	10	154960	154969	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019753	ATACT	2	10	159485	159494	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_019753	ATAGT	2	10	161275	161284	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019753	ATTTT	2	10	163976	163985	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019753	TGCGC	2	10	173205	173214	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_019753	TGGGT	2	10	191628	191637	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019753	TTTAG	2	10	194323	194332	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019753	AATTT	2	10	196910	196919	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019753	ACAAG	2	10	196965	196974	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_019753	CGAAA	2	10	206170	206179	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_019753	TAAAT	2	10	208467	208476	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019753	CCCCT	2	10	210188	210197	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
42	NC_019753	GCTTT	2	10	213019	213028	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_019753	TTAAA	2	10	225290	225299	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019753	TTCGC	2	10	230241	230250	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_019753	CGATA	2	10	230377	230386	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_019753	CTAAG	2	10	242379	242388	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_019753	CACTG	2	10	246290	246299	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_019753	CTTAC	2	10	246438	246447	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_019753	AAATT	2	10	249552	249561	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019753	AAAAT	2	10	249599	249608	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019753	AGATA	2	10	249730	249739	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019753	GCATA	2	10	255203	255212	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_019753	TTGCA	2	10	262687	262696	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_019753	TTAAA	2	10	262740	262749	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019753	CCCCT	2	10	287259	287268	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
56	NC_019753	AGGGG	2	10	287274	287283	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019753	TATAT	2	10	293780	293789	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019753	ACCTT	2	10	293926	293935	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_019753	TCAAT	2	10	301984	301993	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_019753	ACTTA	2	10	307955	307964	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_019753	AAGAT	2	10	310074	310083	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019753	TTCGC	2	10	311816	311825	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_019753	ACCCC	2	10	316426	316435	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
64	NC_019753	TTGGC	2	10	325106	325115	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_019753	CCAAA	2	10	328166	328175	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_019753	TAAAT	2	10	372561	372570	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019753	TCATT	2	10	376853	376862	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_019753	GATTG	2	10	378903	378912	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019753	GCGGG	2	10	380195	380204	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
70	NC_019753	TTTCC	2	10	380743	380752	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_019753	GTTGC	2	10	385194	385203	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_019753	GTGAG	2	10	391425	391434	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019753	GCAGT	2	10	391740	391749	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_019753	GTTGC	2	10	393021	393030	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_019753	TTAAT	2	10	395084	395093	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019753	ACTAG	2	10	395133	395142	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_019753	AAAAT	2	10	399365	399374	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019753	CAAAA	2	10	405080	405089	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_019753	TTAAA	2	10	405253	405262	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019753	ATTAC	2	10	427793	427802	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_019753	TTTTG	2	10	427878	427887	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019753	TGTAG	2	10	430847	430856	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019753	GCTTC	2	10	430981	430990	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_019753	AAAGT	2	10	432043	432052	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019753	TCAAA	2	10	433079	433088	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_019753	GTTAA	2	10	433782	433791	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019753	TGAAC	2	10	438883	438892	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_019753	TAATT	2	10	441470	441479	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019753	ATTGG	2	10	448373	448382	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019753	AACAA	2	10	449471	449480	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_019753	CAAAT	2	10	449823	449832	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_019753	GGTTT	2	10	451394	451403	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019753	TAAGG	2	10	451423	451432	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019753	TTTGA	2	10	452983	452992	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019753	CAACC	2	10	454195	454204	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
96	NC_019753	AGGAG	2	10	458984	458993	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019753	TGTAC	2	10	463492	463501	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_019753	GAAAA	2	10	463803	463812	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019753	AGTAA	2	10	478740	478749	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019753	CTTTA	2	10	483037	483046	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_019753	CTTTA	2	10	483075	483084	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_019753	AAGTT	2	10	488441	488450	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019753	ACTTA	2	10	489072	489081	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_019753	GGTAA	2	10	491399	491408	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019753	AAACG	2	10	492867	492876	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_019753	TACAG	2	10	505804	505813	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_019753	TACAT	2	10	513864	513873	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_019753	CAACG	2	10	514584	514593	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_019753	TAATT	2	10	518925	518934	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019753	TTTGA	2	10	519512	519521	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019753	TAATT	2	10	521076	521085	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019753	TAAAA	2	10	523519	523528	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019753	AAGTC	2	10	549743	549752	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_019753	CAACC	2	10	554137	554146	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
115	NC_019753	CAACC	2	10	557834	557843	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
116	NC_019753	GGTTT	2	10	572326	572335	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019753	ACTTA	2	10	592970	592979	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_019753	CTATG	2	10	596682	596691	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_019753	CCTGA	2	10	604865	604874	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_019753	TTACC	2	10	606734	606743	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_019753	GTCAA	2	10	608573	608582	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_019753	GGGCT	2	10	612217	612226	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
123	NC_019753	AAATT	2	10	613060	613069	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019753	TTTTC	2	10	617049	617058	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_019753	TTTAC	2	10	619514	619523	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_019753	TTTAC	2	10	632152	632161	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_019753	AGAAC	2	10	641180	641189	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_019753	TCCCC	2	10	644710	644719	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
129	NC_019753	AGTTG	2	10	647058	647067	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019753	AAAGC	2	10	650920	650929	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_019753	ACTAA	2	10	651631	651640	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_019753	ACATC	2	10	656269	656278	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_019753	CAACG	2	10	656988	656997	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_019753	AAAAT	2	10	659821	659830	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019753	GAGAG	2	10	660493	660502	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019753	ATTAA	2	10	674845	674854	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019753	ATTAA	2	10	676184	676193	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019753	TTTAA	2	10	694613	694622	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019753	GCGCT	2	10	711470	711479	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
140	NC_019753	CTAAT	2	10	713726	713735	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_019753	AAGTA	2	10	727249	727258	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019753	CATAA	2	10	731507	731516	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_019753	CGCAG	2	10	731530	731539	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
144	NC_019753	ATTAC	2	10	734997	735006	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_019753	TTGCT	2	10	736580	736589	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_019753	GGCAG	2	10	738734	738743	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
147	NC_019753	AATTA	2	10	748373	748382	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_019753	ATGCT	2	10	947856	947865	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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428	NC_019753	TAATA	2	10	2391116	2391125	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
429	NC_019753	AAATA	2	10	2401109	2401118	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_019753	TCAAT	2	10	2423554	2423563	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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442	NC_019753	CCCTT	2	10	2470616	2470625	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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449	NC_019753	TTAGT	2	10	2529989	2529998	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_019753	AAGGG	2	10	2530405	2530414	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
452	NC_019753	ACCCC	2	10	2533196	2533205	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
453	NC_019753	TGGGG	2	10	2542311	2542320	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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457	NC_019753	AGGGG	2	10	2572811	2572820	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
458	NC_019753	CATAC	2	10	2574563	2574572	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
459	NC_019753	TAGGG	2	10	2576961	2576970	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
460	NC_019753	GGAGA	3	15	2585106	2585120	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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462	NC_019753	CTTTT	2	10	2590307	2590316	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
463	NC_019753	AAATT	2	10	2590729	2590738	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_019753	AATTC	2	10	2606339	2606348	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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466	NC_019753	ATTCG	2	10	2626766	2626775	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
467	NC_019753	TACAG	2	10	2633033	2633042	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
468	NC_019753	AAAAG	2	10	2636831	2636840	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
469	NC_019753	TATCA	2	10	2640056	2640065	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
470	NC_019753	AATTA	2	10	2645127	2645136	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_019753	CCTTA	2	10	2672323	2672332	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
472	NC_019753	TATTT	2	10	2672468	2672477	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_019753	TAACC	2	10	2682021	2682030	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
474	NC_019753	TTTGG	2	10	2688359	2688368	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
475	NC_019753	GTAAA	2	10	2694245	2694254	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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478	NC_019753	GTTGC	2	10	2716773	2716782	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
479	NC_019753	AATTA	2	10	2727450	2727459	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
480	NC_019753	CTTGA	2	10	2736025	2736034	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
481	NC_019753	CAACC	2	10	2741295	2741304	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
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486	NC_019753	GGTTG	2	10	2763740	2763749	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
487	NC_019753	CAACC	2	10	2763750	2763759	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
488	NC_019753	TGAAA	2	10	2763783	2763792	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
489	NC_019753	AGGGG	2	10	2766890	2766899	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
490	NC_019753	AATTG	2	10	2773400	2773409	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
491	NC_019753	TTAAA	2	10	2775727	2775736	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_019753	AATTA	2	10	2822703	2822712	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

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