MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 chromosome

Total Repeats: 2500

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019753	AAGGA	2	10	740	749	60 %	0 %	40 %	0 %	428303694
2	NC_019753	GTGAT	2	10	974	983	20 %	40 %	40 %	0 %	428303694
3	NC_019753	GTTCT	2	10	17773	17782	0 %	60 %	20 %	20 %	428303704
4	NC_019753	TAGTG	2	10	20477	20486	20 %	40 %	40 %	0 %	428303707
5	NC_019753	CATTA	2	10	23492	23501	40 %	40 %	0 %	20 %	428303710
6	NC_019753	ATCTG	2	10	26357	26366	20 %	40 %	20 %	20 %	428303711
7	NC_019753	CATCC	2	10	26398	26407	20 %	20 %	0 %	60 %	428303711
8	NC_019753	TTGGT	2	10	28409	28418	0 %	60 %	40 %	0 %	428303712
9	NC_019753	ATGAT	2	10	29111	29120	40 %	40 %	20 %	0 %	428303712
10	NC_019753	CTGAT	2	10	35414	35423	20 %	40 %	20 %	20 %	428303717
11	NC_019753	ACATC	2	10	38939	38948	40 %	20 %	0 %	40 %	428303720
12	NC_019753	CCAAC	2	10	43260	43269	40 %	0 %	0 %	60 %	428303722
13	NC_019753	TCAAT	2	10	44333	44342	40 %	40 %	0 %	20 %	428303722
14	NC_019753	TTTCC	2	10	44357	44366	0 %	60 %	0 %	40 %	428303722
15	NC_019753	ATAAA	2	10	48406	48415	80 %	20 %	0 %	0 %	428303725
16	NC_019753	ATATC	2	10	49354	49363	40 %	40 %	0 %	20 %	428303726
17	NC_019753	ACCCC	2	10	54734	54743	20 %	0 %	0 %	80 %	428303730
18	NC_019753	GATGG	2	10	55260	55269	20 %	20 %	60 %	0 %	428303730
19	NC_019753	AGGTA	2	10	56342	56351	40 %	20 %	40 %	0 %	428303730
20	NC_019753	ATTTT	2	10	58063	58072	20 %	80 %	0 %	0 %	428303732
21	NC_019753	AGCAA	2	10	60535	60544	60 %	0 %	20 %	20 %	428303734
22	NC_019753	AGCAC	2	10	60955	60964	40 %	0 %	20 %	40 %	428303734
23	NC_019753	TTTGT	2	10	63571	63580	0 %	80 %	20 %	0 %	428303736
24	NC_019753	AGTTA	2	10	65544	65553	40 %	40 %	20 %	0 %	428303736
25	NC_019753	CGCAG	2	10	66184	66193	20 %	0 %	40 %	40 %	428303736
26	NC_019753	CATAT	2	10	70600	70609	40 %	40 %	0 %	20 %	428303738
27	NC_019753	TTTGC	2	10	71634	71643	0 %	60 %	20 %	20 %	428303738
28	NC_019753	TTGTT	2	10	73318	73327	0 %	80 %	20 %	0 %	428303739
29	NC_019753	TATCT	2	10	75268	75277	20 %	60 %	0 %	20 %	428303740
30	NC_019753	TTAAC	2	10	79099	79108	40 %	40 %	0 %	20 %	428303743
31	NC_019753	ACTTA	2	10	83838	83847	40 %	40 %	0 %	20 %	428303745
32	NC_019753	GTTTC	2	10	84894	84903	0 %	60 %	20 %	20 %	428303746
33	NC_019753	CCAAA	2	10	88927	88936	60 %	0 %	0 %	40 %	428303750
34	NC_019753	TACTG	2	10	93864	93873	20 %	40 %	20 %	20 %	428303754
35	NC_019753	ATCGC	2	10	94588	94597	20 %	20 %	20 %	40 %	428303755
36	NC_019753	AAACT	2	10	94787	94796	60 %	20 %	0 %	20 %	428303755
37	NC_019753	TCTAA	2	10	99175	99184	40 %	40 %	0 %	20 %	428303759
38	NC_019753	TAAGT	2	10	99234	99243	40 %	40 %	20 %	0 %	428303759
39	NC_019753	GTATT	2	10	99733	99742	20 %	60 %	20 %	0 %	428303759
40	NC_019753	CTTAC	2	10	101020	101029	20 %	40 %	0 %	40 %	428303761
41	NC_019753	GGAAT	2	10	102376	102385	40 %	20 %	40 %	0 %	428303761
42	NC_019753	TGCCG	2	10	103335	103344	0 %	20 %	40 %	40 %	428303761
43	NC_019753	AATCA	2	10	104470	104479	60 %	20 %	0 %	20 %	428303762
44	NC_019753	TCACA	2	10	105063	105072	40 %	20 %	0 %	40 %	428303762
45	NC_019753	ATCGC	2	10	108887	108896	20 %	20 %	20 %	40 %	428303766
46	NC_019753	GTTCG	2	10	122130	122139	0 %	40 %	40 %	20 %	428303777
47	NC_019753	GCGCA	2	10	126606	126615	20 %	0 %	40 %	40 %	428303780
48	NC_019753	AGGCT	2	10	130802	130811	20 %	20 %	40 %	20 %	428303784
49	NC_019753	GATCA	2	10	132351	132360	40 %	20 %	20 %	20 %	428303785
50	NC_019753	TTAAT	2	10	137724	137733	40 %	60 %	0 %	0 %	428303791
51	NC_019753	CCCCT	2	10	138643	138652	0 %	20 %	0 %	80 %	428303791
52	NC_019753	AGGGG	2	10	138656	138665	20 %	0 %	80 %	0 %	428303791
53	NC_019753	AATGG	2	10	141912	141921	40 %	20 %	40 %	0 %	428303794
54	NC_019753	TACCA	2	10	143036	143045	40 %	20 %	0 %	40 %	428303795
55	NC_019753	AATCA	2	10	144475	144484	60 %	20 %	0 %	20 %	428303797
56	NC_019753	AATGT	2	10	144525	144534	40 %	40 %	20 %	0 %	428303797
57	NC_019753	AAGTC	2	10	146295	146304	40 %	20 %	20 %	20 %	428303799
58	NC_019753	ATGCT	2	10	150644	150653	20 %	40 %	20 %	20 %	428303803
59	NC_019753	TGGGA	2	10	151644	151653	20 %	20 %	60 %	0 %	428303805
60	NC_019753	ATTCC	2	10	154471	154480	20 %	40 %	0 %	40 %	428303808
61	NC_019753	ACTTC	2	10	156249	156258	20 %	40 %	0 %	40 %	428303810
62	NC_019753	TGCTG	2	10	162070	162079	0 %	40 %	40 %	20 %	428303812
63	NC_019753	ACAAA	2	10	163330	163339	80 %	0 %	0 %	20 %	428303813
64	NC_019753	CAGTC	2	10	163731	163740	20 %	20 %	20 %	40 %	428303813
65	NC_019753	ACCAA	2	10	166447	166456	60 %	0 %	0 %	40 %	428303814
66	NC_019753	CTGCT	2	10	166843	166852	0 %	40 %	20 %	40 %	428303815
67	NC_019753	AGTCA	2	10	167272	167281	40 %	20 %	20 %	20 %	428303815
68	NC_019753	TCTAA	2	10	168297	168306	40 %	40 %	0 %	20 %	428303816
69	NC_019753	TGATT	2	10	168826	168835	20 %	60 %	20 %	0 %	428303817
70	NC_019753	TGAGG	2	10	170900	170909	20 %	20 %	60 %	0 %	428303820
71	NC_019753	ATTAC	2	10	171283	171292	40 %	40 %	0 %	20 %	428303820
72	NC_019753	CTGTT	2	10	172738	172747	0 %	60 %	20 %	20 %	428303822
73	NC_019753	AGTGG	2	10	177698	177707	20 %	20 %	60 %	0 %	428303827
74	NC_019753	GCCGA	2	10	179238	179247	20 %	0 %	40 %	40 %	428303827
75	NC_019753	ACACC	2	10	180063	180072	40 %	0 %	0 %	60 %	428303828
76	NC_019753	CCCTA	2	10	185233	185242	20 %	20 %	0 %	60 %	428303831
77	NC_019753	ACAAT	2	10	189792	189801	60 %	20 %	0 %	20 %	428303835
78	NC_019753	TAATG	2	10	194764	194773	40 %	40 %	20 %	0 %	428303841
79	NC_019753	CTTTA	2	10	198457	198466	20 %	60 %	0 %	20 %	428303844
80	NC_019753	ATTTT	2	10	198491	198500	20 %	80 %	0 %	0 %	428303844
81	NC_019753	ATTAC	2	10	217980	217989	40 %	40 %	0 %	20 %	428303860
82	NC_019753	ATGGC	2	10	218247	218256	20 %	20 %	40 %	20 %	428303860
83	NC_019753	CGCCA	2	10	224123	224132	20 %	0 %	20 %	60 %	428303866
84	NC_019753	TCTTG	2	10	229033	229042	0 %	60 %	20 %	20 %	428303869
85	NC_019753	TGAGT	2	10	229592	229601	20 %	40 %	40 %	0 %	428303869
86	NC_019753	AATTT	2	10	233357	233366	40 %	60 %	0 %	0 %	428303871
87	NC_019753	TGCCT	2	10	234945	234954	0 %	40 %	20 %	40 %	428303873
88	NC_019753	CGCTG	2	10	235062	235071	0 %	20 %	40 %	40 %	428303873
89	NC_019753	AATTA	2	10	238104	238113	60 %	40 %	0 %	0 %	428303874
90	NC_019753	CTTGG	2	10	242550	242559	0 %	40 %	40 %	20 %	428303878
91	NC_019753	TGAGT	2	10	243487	243496	20 %	40 %	40 %	0 %	428303879
92	NC_019753	AAACT	2	10	245277	245286	60 %	20 %	0 %	20 %	428303880
93	NC_019753	CCAAC	2	10	246002	246011	40 %	0 %	0 %	60 %	428303880
94	NC_019753	CGGAT	2	10	246081	246090	20 %	20 %	40 %	20 %	428303880
95	NC_019753	TAATT	2	10	247233	247242	40 %	60 %	0 %	0 %	428303881
96	NC_019753	TTACG	2	10	250301	250310	20 %	40 %	20 %	20 %	428303885
97	NC_019753	GGTAA	2	10	253278	253287	40 %	20 %	40 %	0 %	428303888
98	NC_019753	ACTAA	2	10	254616	254625	60 %	20 %	0 %	20 %	428303889
99	NC_019753	TATGT	2	10	255481	255490	20 %	60 %	20 %	0 %	428303890
100	NC_019753	TTAAT	2	10	258486	258495	40 %	60 %	0 %	0 %	428303893
101	NC_019753	CTGTT	2	10	261976	261985	0 %	60 %	20 %	20 %	428303896
102	NC_019753	AGAAA	2	10	264068	264077	80 %	0 %	20 %	0 %	428303897
103	NC_019753	ATATT	2	10	264491	264500	40 %	60 %	0 %	0 %	428303898
104	NC_019753	AATTT	2	10	266705	266714	40 %	60 %	0 %	0 %	428303899
105	NC_019753	TTTGC	2	10	266754	266763	0 %	60 %	20 %	20 %	428303899
106	NC_019753	CAGTC	2	10	267115	267124	20 %	20 %	20 %	40 %	428303899
107	NC_019753	ATTGG	2	10	267806	267815	20 %	40 %	40 %	0 %	428303899
108	NC_019753	ATTAT	2	10	267899	267908	40 %	60 %	0 %	0 %	428303899
109	NC_019753	GGCTT	2	10	268570	268579	0 %	40 %	40 %	20 %	428303899
110	NC_019753	TTAAT	2	10	268665	268674	40 %	60 %	0 %	0 %	428303899
111	NC_019753	AGGCT	2	10	268680	268689	20 %	20 %	40 %	20 %	428303899
112	NC_019753	TTTCT	2	10	269294	269303	0 %	80 %	0 %	20 %	428303900
113	NC_019753	CAATT	2	10	271495	271504	40 %	40 %	0 %	20 %	428303902
114	NC_019753	ATTTC	2	10	273614	273623	20 %	60 %	0 %	20 %	428303905
115	NC_019753	CGAGA	2	10	277190	277199	40 %	0 %	40 %	20 %	428303907
116	NC_019753	TTTGG	2	10	277718	277727	0 %	60 %	40 %	0 %	428303908
117	NC_019753	ACGAG	2	10	277774	277783	40 %	0 %	40 %	20 %	428303908
118	NC_019753	TGAAT	2	10	277912	277921	40 %	40 %	20 %	0 %	428303908
119	NC_019753	GTTTA	2	10	280131	280140	20 %	60 %	20 %	0 %	428303908
120	NC_019753	ACTCT	2	10	284816	284825	20 %	40 %	0 %	40 %	428303911
121	NC_019753	GTTTG	2	10	289431	289440	0 %	60 %	40 %	0 %	428303915
122	NC_019753	TTAGT	2	10	293046	293055	20 %	60 %	20 %	0 %	428303918
123	NC_019753	CTTTA	2	10	293549	293558	20 %	60 %	0 %	20 %	428303918
124	NC_019753	AATTA	2	10	295187	295196	60 %	40 %	0 %	0 %	428303920
125	NC_019753	AAATA	2	10	296285	296294	80 %	20 %	0 %	0 %	428303920
126	NC_019753	CAGAG	2	10	298249	298258	40 %	0 %	40 %	20 %	428303922
127	NC_019753	GCAAG	2	10	298619	298628	40 %	0 %	40 %	20 %	428303922
128	NC_019753	TTTTA	2	10	299318	299327	20 %	80 %	0 %	0 %	428303922
129	NC_019753	TTGGC	2	10	302454	302463	0 %	40 %	40 %	20 %	428303924
130	NC_019753	ACCTC	2	10	307122	307131	20 %	20 %	0 %	60 %	428303930
131	NC_019753	AGGAA	2	10	308608	308617	60 %	0 %	40 %	0 %	428303932
132	NC_019753	TCTTG	2	10	310608	310617	0 %	60 %	20 %	20 %	428303933
133	NC_019753	TGAGT	2	10	311167	311176	20 %	40 %	40 %	0 %	428303933
134	NC_019753	TCTAC	2	10	313199	313208	20 %	40 %	0 %	40 %	428303934
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249	NC_019753	CGGAT	2	10	569374	569383	20 %	20 %	40 %	20 %	428304140
250	NC_019753	CATCC	2	10	570698	570707	20 %	20 %	0 %	60 %	428304141
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252	NC_019753	GTCAG	2	10	575948	575957	20 %	20 %	40 %	20 %	428304145
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255	NC_019753	TTCTG	2	10	579625	579634	0 %	60 %	20 %	20 %	428304151
256	NC_019753	ATAAA	2	10	581157	581166	80 %	20 %	0 %	0 %	428304151
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258	NC_019753	TTCTG	2	10	586403	586412	0 %	60 %	20 %	20 %	428304156
259	NC_019753	TTTTC	2	10	588334	588343	0 %	80 %	0 %	20 %	428304158
260	NC_019753	TACTC	2	10	588398	588407	20 %	40 %	0 %	40 %	428304158
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389	NC_019753	CACTT	2	10	879724	879733	20 %	40 %	0 %	40 %	428304387
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