MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 chromosome

Total Repeats: 14856

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019753	GCAA	2	8	564	571	50 %	0 %	25 %	25 %	428303694
2	NC_019753	ATTA	2	8	1035	1042	50 %	50 %	0 %	0 %	428303694
3	NC_019753	AGTT	2	8	1391	1398	25 %	50 %	25 %	0 %	428303694
4	NC_019753	TGCT	2	8	1620	1627	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_019753	AATT	2	8	2102	2109	50 %	50 %	0 %	0 %	428303695
6	NC_019753	AAGT	2	8	2386	2393	50 %	25 %	25 %	0 %	428303695
7	NC_019753	GATA	2	8	2612	2619	50 %	25 %	25 %	0 %	428303695
8	NC_019753	ATGG	2	8	2739	2746	25 %	25 %	50 %	0 %	428303695
9	NC_019753	TGGG	2	8	2821	2828	0 %	25 %	75 %	0 %	428303695
10	NC_019753	TTTG	2	8	2937	2944	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019753	TACT	2	8	2976	2983	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_019753	ACTT	2	8	2986	2993	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_019753	TTAA	2	8	3062	3069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019753	TCAA	2	8	3698	3705	50 %	25 %	0 %	25 %	428303696
15	NC_019753	TTAA	2	8	3742	3749	50 %	50 %	0 %	0 %	428303696
16	NC_019753	AAGC	2	8	4111	4118	50 %	0 %	25 %	25 %	428303696
17	NC_019753	ATCA	2	8	4216	4223	50 %	25 %	0 %	25 %	428303696
18	NC_019753	TTTA	2	8	4616	4623	25 %	75 %	0 %	0 %	428303696
19	NC_019753	TGAA	2	8	4803	4810	50 %	25 %	25 %	0 %	428303696
20	NC_019753	AATT	2	8	6609	6616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019753	ACAA	2	8	6676	6683	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_019753	ATGG	2	8	7327	7334	25 %	25 %	50 %	0 %	428303697
23	NC_019753	CCAA	2	8	7690	7697	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_019753	CCCT	2	8	8840	8847	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_019753	CATC	2	8	8907	8914	25 %	25 %	0 %	50 %	428303698
26	NC_019753	GCAG	2	8	9161	9168	25 %	0 %	50 %	25 %	428303698
27	NC_019753	TTTC	2	8	9198	9205	0 %	75 %	0 %	25 %	428303698
28	NC_019753	TTCC	2	8	9259	9266	0 %	50 %	0 %	50 %	428303698
29	NC_019753	TAAG	2	8	9349	9356	50 %	25 %	25 %	0 %	428303698
30	NC_019753	ACTT	2	8	9607	9614	25 %	50 %	0 %	25 %	428303698
31	NC_019753	ATTT	2	8	10083	10090	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019753	ACTC	2	8	10192	10199	25 %	25 %	0 %	50 %	428303699
33	NC_019753	ATTG	2	8	10324	10331	25 %	50 %	25 %	0 %	428303699
34	NC_019753	ATTA	2	8	10498	10505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019753	ATAA	2	8	10527	10534	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019753	ATTG	2	8	10770	10777	25 %	50 %	25 %	0 %	428303700
37	NC_019753	AATC	2	8	11500	11507	50 %	25 %	0 %	25 %	428303701
38	NC_019753	AGTA	2	8	12313	12320	50 %	25 %	25 %	0 %	428303701
39	NC_019753	ATAA	2	8	13229	13236	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019753	TTTG	2	8	13943	13950	0 %	75 %	25 %	0 %	428303702
41	NC_019753	TAAT	2	8	13959	13966	50 %	50 %	0 %	0 %	428303702
42	NC_019753	ACTG	2	8	14068	14075	25 %	25 %	25 %	25 %	428303702
43	NC_019753	TCTG	2	8	14852	14859	0 %	50 %	25 %	25 %	428303702
44	NC_019753	AGGC	2	8	15392	15399	25 %	0 %	50 %	25 %	428303702
45	NC_019753	CCGC	2	8	15423	15430	0 %	0 %	25 %	75 %	428303702
46	NC_019753	TTGG	2	8	16137	16144	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019753	GAAC	2	8	16214	16221	50 %	0 %	25 %	25 %	428303703
48	NC_019753	GGTG	2	8	16657	16664	0 %	25 %	75 %	0 %	428303703
49	NC_019753	TACC	2	8	16978	16985	25 %	25 %	0 %	50 %	428303703
50	NC_019753	TCAC	2	8	16996	17003	25 %	25 %	0 %	50 %	428303703
51	NC_019753	TTTA	2	8	17311	17318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019753	AAGA	2	8	17620	17627	75 %	0 %	25 %	0 %	428303704
53	NC_019753	ATGG	2	8	17839	17846	25 %	25 %	50 %	0 %	428303704
54	NC_019753	ATGT	2	8	18142	18149	25 %	50 %	25 %	0 %	428303704
55	NC_019753	CTTC	2	8	18392	18399	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_019753	AAAT	2	8	18555	18562	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019753	GAAA	2	8	18774	18781	75 %	0 %	25 %	0 %	428303705
58	NC_019753	TGGA	2	8	19254	19261	25 %	25 %	50 %	0 %	428303705
59	NC_019753	TAAT	2	8	19317	19324	50 %	50 %	0 %	0 %	428303705
60	NC_019753	GAAA	2	8	19944	19951	75 %	0 %	25 %	0 %	428303706
61	NC_019753	TATT	2	8	20665	20672	25 %	75 %	0 %	0 %	428303707
62	NC_019753	TTTG	2	8	21026	21033	0 %	75 %	25 %	0 %	428303707
63	NC_019753	AAGT	2	8	21224	21231	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019753	TTTG	2	8	21613	21620	0 %	75 %	25 %	0 %	428303708
65	NC_019753	AAAT	2	8	22220	22227	75 %	25 %	0 %	0 %	428303709
66	NC_019753	TTTG	3	12	22472	22483	0 %	75 %	25 %	0 %	428303709
67	NC_019753	CTTT	2	8	22487	22494	0 %	75 %	0 %	25 %	428303709
68	NC_019753	AGAA	2	8	22567	22574	75 %	0 %	25 %	0 %	428303709
69	NC_019753	ATTA	2	8	22585	22592	50 %	50 %	0 %	0 %	428303709
70	NC_019753	ATCC	2	8	23170	23177	25 %	25 %	0 %	50 %	428303710
71	NC_019753	AAGG	2	8	23611	23618	50 %	0 %	50 %	0 %	428303710
72	NC_019753	TGTT	2	8	24071	24078	0 %	75 %	25 %	0 %	428303710
73	NC_019753	TCCT	2	8	26095	26102	0 %	50 %	0 %	50 %	428303711
74	NC_019753	TTTG	2	8	26282	26289	0 %	75 %	25 %	0 %	428303711
75	NC_019753	CCTT	2	8	27032	27039	0 %	50 %	0 %	50 %	428303711
76	NC_019753	TTAG	2	8	27567	27574	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019753	TAAA	2	8	27836	27843	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019753	TTAA	2	8	27956	27963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019753	TGCT	2	8	28606	28613	0 %	50 %	25 %	25 %	428303712
80	NC_019753	TTGA	2	8	28663	28670	25 %	50 %	25 %	0 %	428303712
81	NC_019753	CAAT	2	8	28812	28819	50 %	25 %	0 %	25 %	428303712
82	NC_019753	GAAA	2	8	29031	29038	75 %	0 %	25 %	0 %	428303712
83	NC_019753	TTCT	2	8	29151	29158	0 %	75 %	0 %	25 %	428303712
84	NC_019753	CGAA	2	8	29182	29189	50 %	0 %	25 %	25 %	428303712
85	NC_019753	CTTG	2	8	29310	29317	0 %	50 %	25 %	25 %	428303712
86	NC_019753	AAGT	2	8	30159	30166	50 %	25 %	25 %	0 %	428303713
87	NC_019753	AGTT	2	8	30876	30883	25 %	50 %	25 %	0 %	428303713
88	NC_019753	TTGT	2	8	31518	31525	0 %	75 %	25 %	0 %	428303713
89	NC_019753	TTTG	2	8	31836	31843	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019753	TAGA	2	8	32286	32293	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019753	TAAC	2	8	33620	33627	50 %	25 %	0 %	25 %	428303715
92	NC_019753	TAAG	2	8	35672	35679	50 %	25 %	25 %	0 %	428303717
93	NC_019753	ATTT	2	8	36111	36118	25 %	75 %	0 %	0 %	428303717
94	NC_019753	TTTA	2	8	36149	36156	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019753	TGTT	2	8	36196	36203	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019753	CTAT	2	8	36310	36317	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_019753	GTTG	2	8	36449	36456	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019753	TGCT	2	8	37011	37018	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_019753	TTTG	2	8	37291	37298	0 %	75 %	25 %	0 %	428303719
100	NC_019753	ACTA	2	8	37551	37558	50 %	25 %	0 %	25 %	428303719
101	NC_019753	GCAC	2	8	37651	37658	25 %	0 %	25 %	50 %	428303719
102	NC_019753	CTTT	2	8	37789	37796	0 %	75 %	0 %	25 %	428303719
103	NC_019753	CATC	2	8	37928	37935	25 %	25 %	0 %	50 %	428303719
104	NC_019753	ATTA	2	8	38304	38311	50 %	50 %	0 %	0 %	428303719
105	NC_019753	TTTA	2	8	38466	38473	25 %	75 %	0 %	0 %	428303719
106	NC_019753	GTTT	2	8	38563	38570	0 %	75 %	25 %	0 %	428303719
107	NC_019753	ATTT	2	8	38727	38734	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019753	TCAA	2	8	39433	39440	50 %	25 %	0 %	25 %	428303720
109	NC_019753	TGAT	2	8	39448	39455	25 %	50 %	25 %	0 %	428303720
110	NC_019753	ACTA	2	8	40031	40038	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_019753	GTTG	2	8	40071	40078	0 %	50 %	50 %	0 %	428303721
112	NC_019753	TAGC	2	8	40413	40420	25 %	25 %	25 %	25 %	428303721
113	NC_019753	AAAT	2	8	40717	40724	75 %	25 %	0 %	0 %	428303721
114	NC_019753	TCAA	2	8	41372	41379	50 %	25 %	0 %	25 %	428303721
115	NC_019753	AATT	2	8	41386	41393	50 %	50 %	0 %	0 %	428303721
116	NC_019753	TCAT	2	8	41654	41661	25 %	50 %	0 %	25 %	428303721
117	NC_019753	TGAT	2	8	41897	41904	25 %	50 %	25 %	0 %	428303722
118	NC_019753	CAAA	2	8	41954	41961	75 %	0 %	0 %	25 %	428303722
119	NC_019753	GTTC	2	8	42623	42630	0 %	50 %	25 %	25 %	428303722
120	NC_019753	TTGC	2	8	42632	42639	0 %	50 %	25 %	25 %	428303722
121	NC_019753	TAAA	2	8	43359	43366	75 %	25 %	0 %	0 %	428303722
122	NC_019753	CCCT	2	8	43425	43432	0 %	25 %	0 %	75 %	428303722
123	NC_019753	AATT	3	12	43931	43942	50 %	50 %	0 %	0 %	428303722
124	NC_019753	ATTC	2	8	44249	44256	25 %	50 %	0 %	25 %	428303722
125	NC_019753	AAGT	2	8	44664	44671	50 %	25 %	25 %	0 %	428303722
126	NC_019753	TAAA	2	8	44894	44901	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019753	TAAC	2	8	45004	45011	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_019753	ATTA	2	8	45028	45035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019753	AAAT	2	8	45298	45305	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019753	TAAA	2	8	45465	45472	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019753	ATTT	2	8	46243	46250	25 %	75 %	0 %	0 %	428303724
132	NC_019753	CTTA	2	8	46352	46359	25 %	50 %	0 %	25 %	428303724
133	NC_019753	TCAA	2	8	46766	46773	50 %	25 %	0 %	25 %	428303724
134	NC_019753	ATTA	2	8	46943	46950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019753	ATCA	2	8	47610	47617	50 %	25 %	0 %	25 %	428303725
136	NC_019753	GCAA	2	8	48132	48139	50 %	0 %	25 %	25 %	428303725
137	NC_019753	CAAG	2	8	48147	48154	50 %	0 %	25 %	25 %	428303725
138	NC_019753	CATC	2	8	48209	48216	25 %	25 %	0 %	50 %	428303725
139	NC_019753	AAAT	2	8	48217	48224	75 %	25 %	0 %	0 %	428303725
140	NC_019753	CTAT	2	8	48307	48314	25 %	50 %	0 %	25 %	428303725
141	NC_019753	GGGA	2	8	49733	49740	25 %	0 %	75 %	0 %	428303726
142	NC_019753	ATCT	2	8	50480	50487	25 %	50 %	0 %	25 %	428303727
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144	NC_019753	TCTT	2	8	50906	50913	0 %	75 %	0 %	25 %	428303727
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