MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 chromosome

Total Repeats: 11423

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019753	GCAA	2	8	564	571	50 %	0 %	25 %	25 %	428303694
2	NC_019753	ATTA	2	8	1035	1042	50 %	50 %	0 %	0 %	428303694
3	NC_019753	AGTT	2	8	1391	1398	25 %	50 %	25 %	0 %	428303694
4	NC_019753	AATT	2	8	2102	2109	50 %	50 %	0 %	0 %	428303695
5	NC_019753	AAGT	2	8	2386	2393	50 %	25 %	25 %	0 %	428303695
6	NC_019753	GATA	2	8	2612	2619	50 %	25 %	25 %	0 %	428303695
7	NC_019753	ATGG	2	8	2739	2746	25 %	25 %	50 %	0 %	428303695
8	NC_019753	TGGG	2	8	2821	2828	0 %	25 %	75 %	0 %	428303695
9	NC_019753	TCAA	2	8	3698	3705	50 %	25 %	0 %	25 %	428303696
10	NC_019753	TTAA	2	8	3742	3749	50 %	50 %	0 %	0 %	428303696
11	NC_019753	AAGC	2	8	4111	4118	50 %	0 %	25 %	25 %	428303696
12	NC_019753	ATCA	2	8	4216	4223	50 %	25 %	0 %	25 %	428303696
13	NC_019753	TTTA	2	8	4616	4623	25 %	75 %	0 %	0 %	428303696
14	NC_019753	TGAA	2	8	4803	4810	50 %	25 %	25 %	0 %	428303696
15	NC_019753	ATGG	2	8	7327	7334	25 %	25 %	50 %	0 %	428303697
16	NC_019753	CATC	2	8	8907	8914	25 %	25 %	0 %	50 %	428303698
17	NC_019753	GCAG	2	8	9161	9168	25 %	0 %	50 %	25 %	428303698
18	NC_019753	TTTC	2	8	9198	9205	0 %	75 %	0 %	25 %	428303698
19	NC_019753	TTCC	2	8	9259	9266	0 %	50 %	0 %	50 %	428303698
20	NC_019753	TAAG	2	8	9349	9356	50 %	25 %	25 %	0 %	428303698
21	NC_019753	ACTT	2	8	9607	9614	25 %	50 %	0 %	25 %	428303698
22	NC_019753	ACTC	2	8	10192	10199	25 %	25 %	0 %	50 %	428303699
23	NC_019753	ATTG	2	8	10324	10331	25 %	50 %	25 %	0 %	428303699
24	NC_019753	ATTG	2	8	10770	10777	25 %	50 %	25 %	0 %	428303700
25	NC_019753	AATC	2	8	11500	11507	50 %	25 %	0 %	25 %	428303701
26	NC_019753	AGTA	2	8	12313	12320	50 %	25 %	25 %	0 %	428303701
27	NC_019753	TTTG	2	8	13943	13950	0 %	75 %	25 %	0 %	428303702
28	NC_019753	TAAT	2	8	13959	13966	50 %	50 %	0 %	0 %	428303702
29	NC_019753	ACTG	2	8	14068	14075	25 %	25 %	25 %	25 %	428303702
30	NC_019753	TCTG	2	8	14852	14859	0 %	50 %	25 %	25 %	428303702
31	NC_019753	AGGC	2	8	15392	15399	25 %	0 %	50 %	25 %	428303702
32	NC_019753	CCGC	2	8	15423	15430	0 %	0 %	25 %	75 %	428303702
33	NC_019753	GAAC	2	8	16214	16221	50 %	0 %	25 %	25 %	428303703
34	NC_019753	GGTG	2	8	16657	16664	0 %	25 %	75 %	0 %	428303703
35	NC_019753	TACC	2	8	16978	16985	25 %	25 %	0 %	50 %	428303703
36	NC_019753	TCAC	2	8	16996	17003	25 %	25 %	0 %	50 %	428303703
37	NC_019753	AAGA	2	8	17620	17627	75 %	0 %	25 %	0 %	428303704
38	NC_019753	ATGG	2	8	17839	17846	25 %	25 %	50 %	0 %	428303704
39	NC_019753	ATGT	2	8	18142	18149	25 %	50 %	25 %	0 %	428303704
40	NC_019753	GAAA	2	8	18774	18781	75 %	0 %	25 %	0 %	428303705
41	NC_019753	TGGA	2	8	19254	19261	25 %	25 %	50 %	0 %	428303705
42	NC_019753	TAAT	2	8	19317	19324	50 %	50 %	0 %	0 %	428303705
43	NC_019753	GAAA	2	8	19944	19951	75 %	0 %	25 %	0 %	428303706
44	NC_019753	TATT	2	8	20665	20672	25 %	75 %	0 %	0 %	428303707
45	NC_019753	TTTG	2	8	21026	21033	0 %	75 %	25 %	0 %	428303707
46	NC_019753	TTTG	2	8	21613	21620	0 %	75 %	25 %	0 %	428303708
47	NC_019753	AAAT	2	8	22220	22227	75 %	25 %	0 %	0 %	428303709
48	NC_019753	TTTG	3	12	22472	22483	0 %	75 %	25 %	0 %	428303709
49	NC_019753	CTTT	2	8	22487	22494	0 %	75 %	0 %	25 %	428303709
50	NC_019753	AGAA	2	8	22567	22574	75 %	0 %	25 %	0 %	428303709
51	NC_019753	ATTA	2	8	22585	22592	50 %	50 %	0 %	0 %	428303709
52	NC_019753	ATCC	2	8	23170	23177	25 %	25 %	0 %	50 %	428303710
53	NC_019753	AAGG	2	8	23611	23618	50 %	0 %	50 %	0 %	428303710
54	NC_019753	TGTT	2	8	24071	24078	0 %	75 %	25 %	0 %	428303710
55	NC_019753	TCCT	2	8	26095	26102	0 %	50 %	0 %	50 %	428303711
56	NC_019753	TTTG	2	8	26282	26289	0 %	75 %	25 %	0 %	428303711
57	NC_019753	CCTT	2	8	27032	27039	0 %	50 %	0 %	50 %	428303711
58	NC_019753	TGCT	2	8	28606	28613	0 %	50 %	25 %	25 %	428303712
59	NC_019753	TTGA	2	8	28663	28670	25 %	50 %	25 %	0 %	428303712
60	NC_019753	CAAT	2	8	28812	28819	50 %	25 %	0 %	25 %	428303712
61	NC_019753	GAAA	2	8	29031	29038	75 %	0 %	25 %	0 %	428303712
62	NC_019753	TTCT	2	8	29151	29158	0 %	75 %	0 %	25 %	428303712
63	NC_019753	CGAA	2	8	29182	29189	50 %	0 %	25 %	25 %	428303712
64	NC_019753	CTTG	2	8	29310	29317	0 %	50 %	25 %	25 %	428303712
65	NC_019753	AAGT	2	8	30159	30166	50 %	25 %	25 %	0 %	428303713
66	NC_019753	AGTT	2	8	30876	30883	25 %	50 %	25 %	0 %	428303713
67	NC_019753	TTGT	2	8	31518	31525	0 %	75 %	25 %	0 %	428303713
68	NC_019753	TAAC	2	8	33620	33627	50 %	25 %	0 %	25 %	428303715
69	NC_019753	TAAG	2	8	35672	35679	50 %	25 %	25 %	0 %	428303717
70	NC_019753	ATTT	2	8	36111	36118	25 %	75 %	0 %	0 %	428303717
71	NC_019753	TTTG	2	8	37291	37298	0 %	75 %	25 %	0 %	428303719
72	NC_019753	ACTA	2	8	37551	37558	50 %	25 %	0 %	25 %	428303719
73	NC_019753	GCAC	2	8	37651	37658	25 %	0 %	25 %	50 %	428303719
74	NC_019753	CTTT	2	8	37789	37796	0 %	75 %	0 %	25 %	428303719
75	NC_019753	CATC	2	8	37928	37935	25 %	25 %	0 %	50 %	428303719
76	NC_019753	ATTA	2	8	38304	38311	50 %	50 %	0 %	0 %	428303719
77	NC_019753	TTTA	2	8	38466	38473	25 %	75 %	0 %	0 %	428303719
78	NC_019753	GTTT	2	8	38563	38570	0 %	75 %	25 %	0 %	428303719
79	NC_019753	TCAA	2	8	39433	39440	50 %	25 %	0 %	25 %	428303720
80	NC_019753	TGAT	2	8	39448	39455	25 %	50 %	25 %	0 %	428303720
81	NC_019753	GTTG	2	8	40071	40078	0 %	50 %	50 %	0 %	428303721
82	NC_019753	TAGC	2	8	40413	40420	25 %	25 %	25 %	25 %	428303721
83	NC_019753	AAAT	2	8	40717	40724	75 %	25 %	0 %	0 %	428303721
84	NC_019753	TCAA	2	8	41372	41379	50 %	25 %	0 %	25 %	428303721
85	NC_019753	AATT	2	8	41386	41393	50 %	50 %	0 %	0 %	428303721
86	NC_019753	TCAT	2	8	41654	41661	25 %	50 %	0 %	25 %	428303721
87	NC_019753	TGAT	2	8	41897	41904	25 %	50 %	25 %	0 %	428303722
88	NC_019753	CAAA	2	8	41954	41961	75 %	0 %	0 %	25 %	428303722
89	NC_019753	GTTC	2	8	42623	42630	0 %	50 %	25 %	25 %	428303722
90	NC_019753	TTGC	2	8	42632	42639	0 %	50 %	25 %	25 %	428303722
91	NC_019753	TAAA	2	8	43359	43366	75 %	25 %	0 %	0 %	428303722
92	NC_019753	CCCT	2	8	43425	43432	0 %	25 %	0 %	75 %	428303722
93	NC_019753	AATT	3	12	43931	43942	50 %	50 %	0 %	0 %	428303722
94	NC_019753	ATTC	2	8	44249	44256	25 %	50 %	0 %	25 %	428303722
95	NC_019753	AAGT	2	8	44664	44671	50 %	25 %	25 %	0 %	428303722
96	NC_019753	ATTT	2	8	46243	46250	25 %	75 %	0 %	0 %	428303724
97	NC_019753	CTTA	2	8	46352	46359	25 %	50 %	0 %	25 %	428303724
98	NC_019753	TCAA	2	8	46766	46773	50 %	25 %	0 %	25 %	428303724
99	NC_019753	ATCA	2	8	47610	47617	50 %	25 %	0 %	25 %	428303725
100	NC_019753	GCAA	2	8	48132	48139	50 %	0 %	25 %	25 %	428303725
101	NC_019753	CAAG	2	8	48147	48154	50 %	0 %	25 %	25 %	428303725
102	NC_019753	CATC	2	8	48209	48216	25 %	25 %	0 %	50 %	428303725
103	NC_019753	AAAT	2	8	48217	48224	75 %	25 %	0 %	0 %	428303725
104	NC_019753	CTAT	2	8	48307	48314	25 %	50 %	0 %	25 %	428303725
105	NC_019753	GGGA	2	8	49733	49740	25 %	0 %	75 %	0 %	428303726
106	NC_019753	ATCT	2	8	50480	50487	25 %	50 %	0 %	25 %	428303727
107	NC_019753	AATT	2	8	50852	50859	50 %	50 %	0 %	0 %	428303727
108	NC_019753	TCTT	2	8	50906	50913	0 %	75 %	0 %	25 %	428303727
109	NC_019753	TTTC	2	8	50949	50956	0 %	75 %	0 %	25 %	428303727
110	NC_019753	AATC	2	8	51233	51240	50 %	25 %	0 %	25 %	428303727
111	NC_019753	GTAC	2	8	51387	51394	25 %	25 %	25 %	25 %	428303727
112	NC_019753	TCAA	2	8	53074	53081	50 %	25 %	0 %	25 %	428303729
113	NC_019753	CTAA	2	8	53311	53318	50 %	25 %	0 %	25 %	428303729
114	NC_019753	TAAA	2	8	54049	54056	75 %	25 %	0 %	0 %	428303730
115	NC_019753	ATTT	2	8	54235	54242	25 %	75 %	0 %	0 %	428303730
116	NC_019753	TTCT	2	8	54869	54876	0 %	75 %	0 %	25 %	428303730
117	NC_019753	ACTA	2	8	55167	55174	50 %	25 %	0 %	25 %	428303730
118	NC_019753	AACT	2	8	55702	55709	50 %	25 %	0 %	25 %	428303730
119	NC_019753	ATTT	2	8	55711	55718	25 %	75 %	0 %	0 %	428303730
120	NC_019753	AAAG	2	8	56000	56007	75 %	0 %	25 %	0 %	428303730
121	NC_019753	TTCT	2	8	56095	56102	0 %	75 %	0 %	25 %	428303730
122	NC_019753	CGAG	2	8	56255	56262	25 %	0 %	50 %	25 %	428303730
123	NC_019753	CAAA	2	8	57710	57717	75 %	0 %	0 %	25 %	428303731
124	NC_019753	GTTC	2	8	58473	58480	0 %	50 %	25 %	25 %	428303733
125	NC_019753	TGAT	2	8	58963	58970	25 %	50 %	25 %	0 %	428303733
126	NC_019753	TTCA	2	8	58993	59000	25 %	50 %	0 %	25 %	428303733
127	NC_019753	TTGA	2	8	59113	59120	25 %	50 %	25 %	0 %	428303733
128	NC_019753	AATA	2	8	59893	59900	75 %	25 %	0 %	0 %	428303734
129	NC_019753	CAAC	2	8	60298	60305	50 %	0 %	0 %	50 %	428303734
130	NC_019753	ATTT	2	8	60388	60395	25 %	75 %	0 %	0 %	428303734
131	NC_019753	CCTG	2	8	60870	60877	0 %	25 %	25 %	50 %	428303734
132	NC_019753	CCCG	2	8	61078	61085	0 %	0 %	25 %	75 %	428303734
133	NC_019753	GTTT	2	8	61107	61114	0 %	75 %	25 %	0 %	428303734
134	NC_019753	AGCA	2	8	61133	61140	50 %	0 %	25 %	25 %	428303734
135	NC_019753	AGCA	2	8	61822	61829	50 %	0 %	25 %	25 %	428303734
136	NC_019753	GTCA	2	8	62116	62123	25 %	25 %	25 %	25 %	428303735
137	NC_019753	CAAG	2	8	62148	62155	50 %	0 %	25 %	25 %	428303735
138	NC_019753	CAAC	2	8	62156	62163	50 %	0 %	0 %	50 %	428303735
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