MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.03

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019752	ACCAT	3	15	1692	1706	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_019752	CCTTC	2	10	2220	2229	0 %	40 %	0 %	60 %	428303529
3	NC_019752	CCCTT	2	10	2895	2904	0 %	40 %	0 %	60 %	428303530
4	NC_019752	CTTTT	2	10	3498	3507	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_019752	GTCAT	2	10	10447	10456	20 %	40 %	20 %	20 %	428303541
6	NC_019752	TTGGC	2	10	13069	13078	0 %	40 %	40 %	20 %	428303543
7	NC_019752	TTGCA	2	10	13137	13146	20 %	40 %	20 %	20 %	428303543
8	NC_019752	CGTGA	2	10	15906	15915	20 %	20 %	40 %	20 %	428303546
9	NC_019752	TAGTA	2	10	16087	16096	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019752	GCTTG	2	10	16577	16586	0 %	40 %	40 %	20 %	428303548
11	NC_019752	CGTCA	2	10	16981	16990	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_019752	AAATG	2	10	17360	17369	60 %	20 %	20 %	0 %	428303549
13	NC_019752	CCGTT	2	10	17500	17509	0 %	40 %	20 %	40 %	428303549
14	NC_019752	AGGGC	2	10	17721	17730	20 %	0 %	60 %	20 %	428303549
15	NC_019752	TCAAA	2	10	17966	17975	60 %	20 %	0 %	20 %	428303549
16	NC_019752	ACAAA	2	10	18422	18431	80 %	0 %	0 %	20 %	428303549
17	NC_019752	CGGGA	2	10	20996	21005	20 %	0 %	60 %	20 %	428303551
18	NC_019752	TGCGT	2	10	21825	21834	0 %	40 %	40 %	20 %	428303551
19	NC_019752	AAATT	2	10	22555	22564	60 %	40 %	0 %	0 %	428303551
20	NC_019752	TATGT	2	10	26806	26815	20 %	60 %	20 %	0 %	428303553
21	NC_019752	TGATT	2	10	29681	29690	20 %	60 %	20 %	0 %	428303554
22	NC_019752	GCAAT	2	10	32783	32792	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_019752	CAGCA	2	10	32989	32998	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_019752	CTGCG	2	10	36781	36790	0 %	20 %	40 %	40 %	428303558
25	NC_019752	GCAAT	2	10	36895	36904	40 %	20 %	20 %	20 %	428303558
26	NC_019752	AATCC	2	10	37542	37551	40 %	20 %	0 %	40 %	428303558
27	NC_019752	CAAAC	2	10	37936	37945	60 %	0 %	0 %	40 %	428303558
28	NC_019752	AATAT	2	10	39538	39547	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019752	GCTTT	2	10	39959	39968	0 %	60 %	20 %	20 %	428303559
30	NC_019752	TTGTA	2	10	41198	41207	20 %	60 %	20 %	0 %	428303561
31	NC_019752	TTCGC	2	10	44464	44473	0 %	40 %	20 %	40 %	428303563
32	NC_019752	CCAAG	2	10	44768	44777	40 %	0 %	20 %	40 %	428303563
33	NC_019752	CATTC	2	10	45550	45559	20 %	40 %	0 %	40 %	428303563
34	NC_019752	GAAGT	2	10	45953	45962	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019752	TTTGC	2	10	48264	48273	0 %	60 %	20 %	20 %	428303564
36	NC_019752	TTGAA	2	10	48769	48778	40 %	40 %	20 %	0 %	428303564
37	NC_019752	AGATT	2	10	52171	52180	40 %	40 %	20 %	0 %	428303565

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.