MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.03

Total Repeats: 113

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019752	TACT	2	8	538	545	25 %	50 %	0 %	25 %	428303527
2	NC_019752	TAAT	2	8	1278	1285	50 %	50 %	0 %	0 %	428303527
3	NC_019752	GAAA	2	8	1297	1304	75 %	0 %	25 %	0 %	428303527
4	NC_019752	AATA	2	8	1313	1320	75 %	25 %	0 %	0 %	428303527
5	NC_019752	CACC	2	8	2003	2010	25 %	0 %	0 %	75 %	428303528
6	NC_019752	AAAT	2	8	2116	2123	75 %	25 %	0 %	0 %	428303528
7	NC_019752	TTGC	2	8	2803	2810	0 %	50 %	25 %	25 %	428303530
8	NC_019752	CAAC	2	8	3228	3235	50 %	0 %	0 %	50 %	428303530
9	NC_019752	AAGC	2	8	3693	3700	50 %	0 %	25 %	25 %	428303531
10	NC_019752	GCTT	2	8	4755	4762	0 %	50 %	25 %	25 %	428303532
11	NC_019752	CAAA	2	8	4763	4770	75 %	0 %	0 %	25 %	428303532
12	NC_019752	TAAA	2	8	4775	4782	75 %	25 %	0 %	0 %	428303532
13	NC_019752	ATAA	2	8	5725	5732	75 %	25 %	0 %	0 %	428303533
14	NC_019752	AATT	2	8	6285	6292	50 %	50 %	0 %	0 %	428303534
15	NC_019752	AATT	2	8	6498	6505	50 %	50 %	0 %	0 %	428303535
16	NC_019752	TGGA	2	8	6515	6522	25 %	25 %	50 %	0 %	428303535
17	NC_019752	TTGG	2	8	6602	6609	0 %	50 %	50 %	0 %	428303535
18	NC_019752	TAAT	2	8	7348	7355	50 %	50 %	0 %	0 %	428303537
19	NC_019752	GAAT	2	8	7709	7716	50 %	25 %	25 %	0 %	428303538
20	NC_019752	CACC	2	8	7765	7772	25 %	0 %	0 %	75 %	428303538
21	NC_019752	TTGG	2	8	7910	7917	0 %	50 %	50 %	0 %	428303539
22	NC_019752	ATCA	2	8	8132	8139	50 %	25 %	0 %	25 %	428303540
23	NC_019752	TGAT	2	8	10122	10129	25 %	50 %	25 %	0 %	428303541
24	NC_019752	AATT	2	8	10422	10429	50 %	50 %	0 %	0 %	428303541
25	NC_019752	AGCC	2	8	10957	10964	25 %	0 %	25 %	50 %	428303541
26	NC_019752	TTGT	2	8	11955	11962	0 %	75 %	25 %	0 %	428303541
27	NC_019752	TGTT	2	8	13330	13337	0 %	75 %	25 %	0 %	428303543
28	NC_019752	TAGG	2	8	13515	13522	25 %	25 %	50 %	0 %	428303543
29	NC_019752	ATTT	2	8	13937	13944	25 %	75 %	0 %	0 %	428303544
30	NC_019752	GGTT	2	8	14284	14291	0 %	50 %	50 %	0 %	428303544
31	NC_019752	AGAT	2	8	14724	14731	50 %	25 %	25 %	0 %	428303545
32	NC_019752	TTAA	2	8	14843	14850	50 %	50 %	0 %	0 %	428303545
33	NC_019752	AAAT	2	8	15138	15145	75 %	25 %	0 %	0 %	428303546
34	NC_019752	CCCA	2	8	15351	15358	25 %	0 %	0 %	75 %	428303546
35	NC_019752	TTTA	2	8	16165	16172	25 %	75 %	0 %	0 %	428303547
36	NC_019752	AAAT	2	8	16386	16393	75 %	25 %	0 %	0 %	428303548
37	NC_019752	ACTC	2	8	16606	16613	25 %	25 %	0 %	50 %	428303548
38	NC_019752	CAAA	2	8	17126	17133	75 %	0 %	0 %	25 %	428303549
39	NC_019752	ATTT	2	8	17383	17390	25 %	75 %	0 %	0 %	428303549
40	NC_019752	AGTT	2	8	17923	17930	25 %	50 %	25 %	0 %	428303549
41	NC_019752	CAAA	2	8	18530	18537	75 %	0 %	0 %	25 %	428303549
42	NC_019752	CGAC	2	8	18671	18678	25 %	0 %	25 %	50 %	428303549
43	NC_019752	TTTC	2	8	19615	19622	0 %	75 %	0 %	25 %	428303550
44	NC_019752	CAGC	2	8	19798	19805	25 %	0 %	25 %	50 %	428303550
45	NC_019752	GACG	2	8	20391	20398	25 %	0 %	50 %	25 %	428303551
46	NC_019752	CCCT	2	8	20784	20791	0 %	25 %	0 %	75 %	428303551
47	NC_019752	TGTT	2	8	20881	20888	0 %	75 %	25 %	0 %	428303551
48	NC_019752	ACGG	2	8	20930	20937	25 %	0 %	50 %	25 %	428303551
49	NC_019752	AAGC	2	8	21278	21285	50 %	0 %	25 %	25 %	428303551
50	NC_019752	TATT	2	8	22011	22018	25 %	75 %	0 %	0 %	428303551
51	NC_019752	TATT	2	8	22118	22125	25 %	75 %	0 %	0 %	428303551
52	NC_019752	AATT	2	8	22742	22749	50 %	50 %	0 %	0 %	428303551
53	NC_019752	AACC	2	8	23058	23065	50 %	0 %	0 %	50 %	428303551
54	NC_019752	GCCA	2	8	23812	23819	25 %	0 %	25 %	50 %	428303551
55	NC_019752	AAAC	2	8	24012	24019	75 %	0 %	0 %	25 %	428303551
56	NC_019752	AAGC	2	8	25654	25661	50 %	0 %	25 %	25 %	428303552
57	NC_019752	TGTT	2	8	25889	25896	0 %	75 %	25 %	0 %	428303552
58	NC_019752	TTAT	2	8	26284	26291	25 %	75 %	0 %	0 %	428303552
59	NC_019752	AATT	2	8	26997	27004	50 %	50 %	0 %	0 %	428303553
60	NC_019752	TACC	2	8	28159	28166	25 %	25 %	0 %	50 %	428303554
61	NC_019752	ATTT	2	8	29036	29043	25 %	75 %	0 %	0 %	428303554
62	NC_019752	TCAG	2	8	29777	29784	25 %	25 %	25 %	25 %	428303554
63	NC_019752	AATG	2	8	30029	30036	50 %	25 %	25 %	0 %	428303554
64	NC_019752	ATAG	2	8	30132	30139	50 %	25 %	25 %	0 %	428303554
65	NC_019752	ATCA	2	8	30156	30163	50 %	25 %	0 %	25 %	428303554
66	NC_019752	TCAA	2	8	31621	31628	50 %	25 %	0 %	25 %	428303554
67	NC_019752	AGAT	2	8	31909	31916	50 %	25 %	25 %	0 %	428303554
68	NC_019752	CAAA	2	8	33565	33572	75 %	0 %	0 %	25 %	428303555
69	NC_019752	CCAC	2	8	33988	33995	25 %	0 %	0 %	75 %	428303555
70	NC_019752	CATC	2	8	34275	34282	25 %	25 %	0 %	50 %	428303555
71	NC_019752	AAGG	2	8	34895	34902	50 %	0 %	50 %	0 %	428303556
72	NC_019752	GGAA	2	8	36482	36489	50 %	0 %	50 %	0 %	428303558
73	NC_019752	CTGG	2	8	36560	36567	0 %	25 %	50 %	25 %	428303558
74	NC_019752	TTCC	2	8	36977	36984	0 %	50 %	0 %	50 %	428303558
75	NC_019752	CAAT	2	8	38278	38285	50 %	25 %	0 %	25 %	428303558
76	NC_019752	CCCA	2	8	38634	38641	25 %	0 %	0 %	75 %	428303558
77	NC_019752	TTGT	2	8	39082	39089	0 %	75 %	25 %	0 %	428303558
78	NC_019752	CATC	2	8	40615	40622	25 %	25 %	0 %	50 %	428303560
79	NC_019752	TGAT	2	8	41393	41400	25 %	50 %	25 %	0 %	428303562
80	NC_019752	TTTA	2	8	42015	42022	25 %	75 %	0 %	0 %	428303562
81	NC_019752	TCCT	2	8	43248	43255	0 %	50 %	0 %	50 %	428303562
82	NC_019752	TACC	2	8	43328	43335	25 %	25 %	0 %	50 %	428303562
83	NC_019752	CGTT	2	8	43387	43394	0 %	50 %	25 %	25 %	428303562
84	NC_019752	TTGT	2	8	43401	43408	0 %	75 %	25 %	0 %	428303562
85	NC_019752	ACGA	2	8	44779	44786	50 %	0 %	25 %	25 %	428303563
86	NC_019752	AATC	2	8	44815	44822	50 %	25 %	0 %	25 %	428303563
87	NC_019752	TGAT	2	8	45123	45130	25 %	50 %	25 %	0 %	428303563
88	NC_019752	AACG	2	8	47075	47082	50 %	0 %	25 %	25 %	428303564
89	NC_019752	CGAC	2	8	47171	47178	25 %	0 %	25 %	50 %	428303564
90	NC_019752	TGTT	2	8	48091	48098	0 %	75 %	25 %	0 %	428303564
91	NC_019752	TGCC	2	8	48283	48290	0 %	25 %	25 %	50 %	428303564
92	NC_019752	TTAA	2	8	48302	48309	50 %	50 %	0 %	0 %	428303564
93	NC_019752	TTCG	2	8	48648	48655	0 %	50 %	25 %	25 %	428303564
94	NC_019752	GTTG	2	8	48749	48756	0 %	50 %	50 %	0 %	428303564
95	NC_019752	TGGT	2	8	49271	49278	0 %	50 %	50 %	0 %	428303564
96	NC_019752	AAGT	2	8	49713	49720	50 %	25 %	25 %	0 %	428303564
97	NC_019752	TTGC	2	8	50145	50152	0 %	50 %	25 %	25 %	428303564
98	NC_019752	TTGA	2	8	50263	50270	25 %	50 %	25 %	0 %	428303564
99	NC_019752	GCAC	2	8	50711	50718	25 %	0 %	25 %	50 %	428303564
100	NC_019752	TAAT	2	8	51303	51310	50 %	50 %	0 %	0 %	428303564
101	NC_019752	ATCC	2	8	51967	51974	25 %	25 %	0 %	50 %	428303564
102	NC_019752	CCAA	2	8	52136	52143	50 %	0 %	0 %	50 %	428303564
103	NC_019752	TTGT	2	8	52328	52335	0 %	75 %	25 %	0 %	428303565
104	NC_019752	TGGT	2	8	52757	52764	0 %	50 %	50 %	0 %	428303565
105	NC_019752	GTTT	2	8	53087	53094	0 %	75 %	25 %	0 %	428303565
106	NC_019752	ACCA	2	8	53192	53199	50 %	0 %	0 %	50 %	428303565
107	NC_019752	TAGA	2	8	53514	53521	50 %	25 %	25 %	0 %	428303566
108	NC_019752	ATTA	2	8	53534	53541	50 %	50 %	0 %	0 %	428303566
109	NC_019752	ACTC	2	8	53650	53657	25 %	25 %	0 %	50 %	428303566
110	NC_019752	AATT	2	8	54020	54027	50 %	50 %	0 %	0 %	428303566
111	NC_019752	TTCC	2	8	54221	54228	0 %	50 %	0 %	50 %	428303566
112	NC_019752	TAAT	2	8	54705	54712	50 %	50 %	0 %	0 %	428303566
113	NC_019752	CTTG	2	8	55078	55085	0 %	50 %	25 %	25 %	428303566

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.