MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.03

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019752	AT	3	6	16	21	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019752	AT	3	6	48	53	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019752	AT	3	6	898	903	50 %	50 %	0 %	0 %	428303527
4	NC_019752	TC	3	6	1121	1126	0 %	50 %	0 %	50 %	428303527
5	NC_019752	CT	3	6	2968	2973	0 %	50 %	0 %	50 %	428303530
6	NC_019752	TA	3	6	3951	3956	50 %	50 %	0 %	0 %	428303531
7	NC_019752	TC	3	6	5675	5680	0 %	50 %	0 %	50 %	428303533
8	NC_019752	AG	4	8	5917	5924	50 %	0 %	50 %	0 %	428303533
9	NC_019752	GA	3	6	6234	6239	50 %	0 %	50 %	0 %	428303534
10	NC_019752	AC	3	6	6296	6301	50 %	0 %	0 %	50 %	428303534
11	NC_019752	AT	3	6	6689	6694	50 %	50 %	0 %	0 %	428303535
12	NC_019752	AT	3	6	7365	7370	50 %	50 %	0 %	0 %	428303538
13	NC_019752	CA	3	6	7614	7619	50 %	0 %	0 %	50 %	428303538
14	NC_019752	TA	3	6	9229	9234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019752	AT	3	6	9446	9451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019752	TA	3	6	9473	9478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019752	CT	3	6	9639	9644	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_019752	AT	3	6	9883	9888	50 %	50 %	0 %	0 %	428303541
19	NC_019752	AG	3	6	9921	9926	50 %	0 %	50 %	0 %	428303541
20	NC_019752	TC	3	6	12130	12135	0 %	50 %	0 %	50 %	428303542
21	NC_019752	GA	3	6	14211	14216	50 %	0 %	50 %	0 %	428303544
22	NC_019752	AG	3	6	14326	14331	50 %	0 %	50 %	0 %	428303544
23	NC_019752	CT	3	6	14373	14378	0 %	50 %	0 %	50 %	428303544
24	NC_019752	AT	3	6	15934	15939	50 %	50 %	0 %	0 %	428303546
25	NC_019752	GA	3	6	16908	16913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019752	AT	3	6	17525	17530	50 %	50 %	0 %	0 %	428303549
27	NC_019752	AT	3	6	18202	18207	50 %	50 %	0 %	0 %	428303549
28	NC_019752	TC	3	6	19293	19298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_019752	GA	3	6	20195	20200	50 %	0 %	50 %	0 %	428303551
30	NC_019752	CT	4	8	20790	20797	0 %	50 %	0 %	50 %	428303551
31	NC_019752	CT	3	6	20800	20805	0 %	50 %	0 %	50 %	428303551
32	NC_019752	TG	3	6	20855	20860	0 %	50 %	50 %	0 %	428303551
33	NC_019752	GA	3	6	22185	22190	50 %	0 %	50 %	0 %	428303551
34	NC_019752	GA	3	6	22709	22714	50 %	0 %	50 %	0 %	428303551
35	NC_019752	GA	4	8	23629	23636	50 %	0 %	50 %	0 %	428303551
36	NC_019752	TC	3	6	25110	25115	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_019752	CA	3	6	25559	25564	50 %	0 %	0 %	50 %	428303552
38	NC_019752	GA	3	6	27254	27259	50 %	0 %	50 %	0 %	428303554
39	NC_019752	CA	3	6	28941	28946	50 %	0 %	0 %	50 %	428303554
40	NC_019752	GA	3	6	29500	29505	50 %	0 %	50 %	0 %	428303554
41	NC_019752	GA	3	6	29983	29988	50 %	0 %	50 %	0 %	428303554
42	NC_019752	GA	3	6	30792	30797	50 %	0 %	50 %	0 %	428303554
43	NC_019752	TC	3	6	31921	31926	0 %	50 %	0 %	50 %	428303554
44	NC_019752	TC	3	6	32151	32156	0 %	50 %	0 %	50 %	428303554
45	NC_019752	TC	3	6	32226	32231	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_019752	GA	3	6	33734	33739	50 %	0 %	50 %	0 %	428303555
47	NC_019752	AG	4	8	35116	35123	50 %	0 %	50 %	0 %	428303556
48	NC_019752	AT	3	6	35440	35445	50 %	50 %	0 %	0 %	428303556
49	NC_019752	TA	4	8	36084	36091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019752	AG	3	6	36413	36418	50 %	0 %	50 %	0 %	428303558
51	NC_019752	CT	3	6	36509	36514	0 %	50 %	0 %	50 %	428303558
52	NC_019752	AC	4	8	37020	37027	50 %	0 %	0 %	50 %	428303558
53	NC_019752	AG	3	6	40407	40412	50 %	0 %	50 %	0 %	428303560
54	NC_019752	TC	3	6	41771	41776	0 %	50 %	0 %	50 %	428303562
55	NC_019752	AT	3	6	43340	43345	50 %	50 %	0 %	0 %	428303562
56	NC_019752	TA	3	6	45428	45433	50 %	50 %	0 %	0 %	428303563
57	NC_019752	AT	3	6	46980	46985	50 %	50 %	0 %	0 %	428303564
58	NC_019752	GT	3	6	50217	50222	0 %	50 %	50 %	0 %	428303564
59	NC_019752	AT	3	6	51309	51314	50 %	50 %	0 %	0 %	428303564
60	NC_019752	CG	3	6	51366	51371	0 %	0 %	50 %	50 %	428303564
61	NC_019752	GT	3	6	51662	51667	0 %	50 %	50 %	0 %	428303564
62	NC_019752	TA	3	6	52096	52101	50 %	50 %	0 %	0 %	428303564
63	NC_019752	AT	3	6	52624	52629	50 %	50 %	0 %	0 %	428303565
64	NC_019752	GA	3	6	52664	52669	50 %	0 %	50 %	0 %	428303565
65	NC_019752	GA	3	6	53185	53190	50 %	0 %	50 %	0 %	428303565
66	NC_019752	TA	3	6	53387	53392	50 %	50 %	0 %	0 %	428303565
67	NC_019752	AT	3	6	53551	53556	50 %	50 %	0 %	0 %	428303566
68	NC_019752	GA	3	6	53949	53954	50 %	0 %	50 %	0 %	428303566
69	NC_019752	AT	3	6	55271	55276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.