MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 chromosome

Total Repeats: 4998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019751	GCTT	2	8	3940	3947	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019751	GAGT	2	8	6250	6257	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019751	TAAT	2	8	7619	7626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019751	TAAA	2	8	8341	8348	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019751	CTTT	2	8	10276	10283	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_019751	TTAA	2	8	11449	11456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019751	TTCA	2	8	11804	11811	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_019751	AGAC	2	8	14002	14009	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_019751	TAGA	2	8	18195	18202	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019751	GTAA	2	8	18240	18247	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019751	TAAT	2	8	18312	18319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019751	TTGA	2	8	19205	19212	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019751	AAAT	2	8	21844	21851	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019751	ATCA	2	8	24457	24464	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_019751	ATTT	2	8	28643	28650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019751	CAAG	2	8	29739	29746	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_019751	AGTA	2	8	29914	29921	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019751	AAAT	2	8	33723	33730	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019751	ATTT	2	8	33731	33738	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019751	AATT	2	8	36169	36176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019751	ACTA	2	8	36228	36235	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_019751	TTAG	2	8	40189	40196	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019751	AATT	2	8	40421	40428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019751	ACCA	2	8	43077	43084	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_019751	GATT	2	8	43491	43498	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019751	CCTG	2	8	44077	44084	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_019751	TAGA	2	8	44739	44746	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019751	TTAA	2	8	46673	46680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019751	ATTT	2	8	49393	49400	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019751	ATCT	2	8	50905	50912	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_019751	TTTA	2	8	55083	55090	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019751	TTGA	2	8	55289	55296	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019751	AATA	2	8	57984	57991	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019751	CTAT	2	8	58014	58021	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_019751	AAAG	2	8	58610	58617	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019751	ACGC	2	8	58709	58716	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_019751	TATT	2	8	58866	58873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019751	TTTA	2	8	58913	58920	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019751	AATC	2	8	59131	59138	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_019751	GTTA	2	8	59215	59222	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019751	ATAA	2	8	59483	59490	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019751	TAAA	2	8	61788	61795	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019751	TTCT	2	8	61839	61846	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_019751	TACT	2	8	61952	61959	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_019751	TTAA	2	8	62293	62300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019751	GTTT	2	8	62415	62422	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019751	TAAA	2	8	64822	64829	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019751	ATTA	2	8	67430	67437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019751	GGCT	2	8	77324	77331	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_019751	GTAT	2	8	81950	81957	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019751	ATGT	2	8	82036	82043	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019751	TATT	2	8	82124	82131	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019751	ACTA	2	8	82265	82272	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_019751	ATTT	2	8	88000	88007	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019751	TAAA	2	8	88056	88063	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019751	ATTA	2	8	89815	89822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019751	TAAA	2	8	91240	91247	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019751	GTTT	2	8	91271	91278	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019751	TTTA	2	8	91968	91975	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019751	CTTT	2	8	92032	92039	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_019751	ATGT	2	8	92092	92099	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019751	GGCG	2	8	92671	92678	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
63	NC_019751	TTCA	2	8	94717	94724	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_019751	AGAT	2	8	95261	95268	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019751	ATTT	2	8	97887	97894	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019751	CTTT	2	8	98037	98044	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_019751	CAAG	2	8	98357	98364	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_019751	TTAA	2	8	100257	100264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019751	GTTT	2	8	100388	100395	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019751	AAAG	2	8	100437	100444	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019751	AAAG	2	8	100609	100616	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019751	ATTC	2	8	103961	103968	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_019751	AGCG	2	8	107391	107398	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_019751	ATTC	2	8	110308	110315	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_019751	AGTA	2	8	113620	113627	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019751	TTTG	2	8	113716	113723	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019751	TAAA	2	8	113738	113745	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019751	CTCA	2	8	118122	118129	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_019751	TTAT	2	8	121450	121457	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019751	ATAG	2	8	121804	121811	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019751	ATTA	2	8	122716	122723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019751	TTAA	2	8	123558	123565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019751	TAGA	2	8	124574	124581	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019751	ATAA	2	8	125703	125710	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019751	ACCC	2	8	126460	126467	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
86	NC_019751	ATGT	2	8	127290	127297	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019751	TTTA	2	8	128603	128610	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019751	ACAA	2	8	128780	128787	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_019751	TTGA	2	8	130037	130044	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019751	TCAT	2	8	130088	130095	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_019751	GCAA	2	8	131157	131164	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_019751	TTTG	2	8	131178	131185	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019751	ACTT	2	8	131219	131226	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_019751	AGCC	2	8	133226	133233	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_019751	GCAA	2	8	133471	133478	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_019751	TTAG	2	8	134265	134272	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019751	ATTA	2	8	138604	138611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019751	TAAG	2	8	138626	138633	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019751	TTGA	2	8	138677	138684	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019751	AATT	2	8	139693	139700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019751	TGTT	2	8	140038	140045	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019751	TTTA	2	8	140138	140145	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019751	TTAA	2	8	146462	146469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019751	TTAT	2	8	146509	146516	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019751	TAAT	2	8	146732	146739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019751	CTTT	2	8	146745	146752	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_019751	AGTA	2	8	146767	146774	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019751	ATTT	2	8	147286	147293	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019751	AAAT	2	8	147335	147342	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019751	AGAA	2	8	147634	147641	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019751	TAAT	2	8	147747	147754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019751	TTAA	2	8	148968	148975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019751	TTTA	2	8	149271	149278	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019751	TAGT	2	8	149301	149308	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019751	TAAT	2	8	149429	149436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019751	ATCT	2	8	149585	149592	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_019751	TACT	2	8	150055	150062	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_019751	ATAA	2	8	150294	150301	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019751	ATTT	2	8	150626	150633	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019751	AAAT	2	8	153008	153015	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019751	GAAT	2	8	153027	153034	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019751	TTTA	2	8	154486	154493	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019751	AAAG	2	8	154544	154551	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019751	TTGA	2	8	159852	159859	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019751	TAAA	2	8	160185	160192	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019751	GGCT	2	8	160339	160346	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_019751	TCAA	2	8	160469	160476	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_019751	TCAA	2	8	161398	161405	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_019751	TAAT	2	8	164403	164410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019751	CTAT	2	8	164667	164674	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_019751	ACCC	2	8	165229	165236	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
132	NC_019751	GCTT	2	8	165259	165266	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_019751	TCAA	2	8	166082	166089	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_019751	ATTT	2	8	167204	167211	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019751	TAAA	2	8	167566	167573	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019751	AATT	2	8	169168	169175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019751	TAAA	2	8	170408	170415	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019751	TCCT	2	8	174179	174186	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_019751	CATA	2	8	176310	176317	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_019751	ATTT	2	8	176374	176381	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019751	AGTA	2	8	179422	179429	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019751	TCCA	2	8	179469	179476	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_019751	AATT	2	8	179737	179744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019751	TTTC	2	8	179863	179870	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_019751	AACT	2	8	179883	179890	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_019751	AGAT	2	8	180145	180152	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019751	TGAA	2	8	180932	180939	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019751	GAAG	2	8	181164	181171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019751	AACC	2	8	190272	190279	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_019751	TACT	2	8	190359	190366	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_019751	AAGT	2	8	192879	192886	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_019751	AGTT	2	8	193380	193387	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_019751	GAAT	2	8	195246	195253	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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