MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 chromosome

Total Repeats: 15265

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019751	TAT	2	6	1	6	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019751	ACT	2	6	1416	1421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019751	CAT	2	6	1435	1440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019751	CTC	2	6	2861	2866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_019751	CTC	2	6	2869	2874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_019751	GTT	2	6	4027	4032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019751	AAG	2	6	6322	6327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019751	TAT	2	6	6335	6340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019751	ATG	2	6	6431	6436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019751	ACT	2	6	6502	6507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019751	CAC	2	6	6508	6513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_019751	GCT	2	6	7640	7645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019751	CTA	2	6	7689	7694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019751	CAA	2	6	7713	7718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_019751	TGG	2	6	7755	7760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019751	CTT	2	6	9113	9118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019751	TCT	2	6	9126	9131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019751	TCA	2	6	9307	9312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019751	AAC	2	6	9377	9382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019751	TCA	2	6	10284	10289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019751	AAT	2	6	10356	10361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019751	CTT	2	6	11465	11470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_019751	ATC	2	6	11502	11507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019751	ACT	2	6	11544	11549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019751	ACA	2	6	11826	11831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019751	ATT	2	6	11835	11840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019751	AAG	2	6	11894	11899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019751	CTT	2	6	11908	11913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019751	TGG	2	6	13328	13333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019751	ATT	2	6	13413	13418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019751	ATT	2	6	13552	13557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019751	TAC	2	6	13710	13715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019751	GCA	2	6	13850	13855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019751	TTG	2	6	13952	13957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019751	ATT	3	9	14295	14303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019751	CAA	2	6	15370	15375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019751	ATC	2	6	15408	15413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019751	ACG	2	6	16410	16415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019751	AGC	2	6	16424	16429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019751	TCG	2	6	16438	16443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019751	CCA	2	6	16485	16490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_019751	ACT	2	6	16509	16514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019751	ATT	2	6	16569	16574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019751	GGA	2	6	16584	16589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019751	GCC	2	6	16592	16597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_019751	CTT	2	6	16618	16623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019751	GAA	2	6	16722	16727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019751	ATC	2	6	16729	16734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019751	ATT	2	6	18257	18262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019751	ACT	2	6	18328	18333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019751	ATC	2	6	18421	18426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_019751	TTA	2	6	18445	18450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019751	GTA	2	6	21904	21909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019751	ACA	2	6	21934	21939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019751	AGT	2	6	22036	22041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019751	GCA	2	6	22043	22048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019751	CAA	2	6	23499	23504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019751	ATG	2	6	23548	23553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019751	CCA	2	6	23594	23599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_019751	TTG	2	6	23614	23619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019751	TAA	2	6	23717	23722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019751	ATC	2	6	23807	23812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_019751	GCA	2	6	23826	23831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019751	GTC	2	6	29755	29760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_019751	AAT	2	6	29798	29803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019751	ATC	2	6	32162	32167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019751	TTC	2	6	32263	32268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019751	TAT	2	6	32793	32798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019751	CAA	2	6	32968	32973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019751	GTT	2	6	33575	33580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019751	CAT	2	6	33603	33608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019751	ATT	2	6	33646	33651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019751	ATT	2	6	33685	33690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019751	AAC	2	6	33696	33701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_019751	TAA	3	9	36108	36116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019751	ATT	2	6	36222	36227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019751	AAG	2	6	37065	37070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019751	AAT	2	6	39120	39125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019751	CTT	2	6	40268	40273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019751	ATT	2	6	40275	40280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019751	CAA	2	6	40337	40342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019751	ATC	2	6	40493	40498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_019751	ATT	2	6	42689	42694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019751	GTA	2	6	42742	42747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019751	ACC	2	6	42823	42828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_019751	GTA	2	6	42831	42836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019751	ATT	2	6	42853	42858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019751	AGT	2	6	43039	43044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019751	AGG	2	6	43051	43056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019751	AAT	2	6	43096	43101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019751	GGA	2	6	43127	43132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019751	TAG	2	6	43179	43184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019751	TGT	3	9	43193	43201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019751	AAT	2	6	43249	43254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019751	GCA	2	6	43310	43315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_019751	CAG	2	6	43350	43355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019751	GTT	2	6	43374	43379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019751	GTT	2	6	43448	43453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019751	AAT	2	6	43454	43459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019751	GTT	2	6	43671	43676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019751	AAT	2	6	43712	43717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019751	TGT	2	6	43856	43861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019751	TGT	2	6	44040	44045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019751	ACA	2	6	44051	44056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_019751	CTA	2	6	44108	44113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019751	ATC	2	6	44158	44163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_019751	TGC	2	6	44169	44174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_019751	TGC	3	9	44276	44284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_019751	ATT	2	6	44373	44378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019751	TAA	2	6	44604	44609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019751	AAT	2	6	44667	44672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019751	TCT	3	9	44676	44684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_019751	GTC	2	6	44706	44711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019751	ATT	2	6	44789	44794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019751	GAA	2	6	45746	45751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019751	CTC	2	6	46641	46646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_019751	TGA	2	6	46648	46653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019751	ATT	2	6	46655	46660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019751	ATT	2	6	46712	46717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019751	CTT	2	6	48592	48597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_019751	GCA	2	6	49235	49240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_019751	CAA	2	6	49343	49348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_019751	ACC	2	6	49352	49357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_019751	AGA	2	6	49475	49480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019751	ATT	2	6	51204	51209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019751	AAT	2	6	51233	51238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019751	AAC	2	6	51253	51258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_019751	CAT	2	6	51535	51540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_019751	TAA	2	6	55031	55036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019751	TTA	2	6	55110	55115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019751	TGT	2	6	55162	55167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019751	CAT	2	6	55221	55226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_019751	TAT	2	6	55258	55263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019751	GCA	2	6	55282	55287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_019751	TGT	2	6	55450	55455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019751	TGG	2	6	57906	57911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019751	TGC	2	6	57968	57973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_019751	ATT	2	6	57978	57983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019751	CTT	2	6	58031	58036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_019751	CAG	2	6	58065	58070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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