MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 chromosome

Total Repeats: 73249

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019751	AAC	2	6	117	122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428296780
2	NC_019751	AAT	2	6	128	133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296780
3	NC_019751	TGA	2	6	265	270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296780
4	NC_019751	ATT	2	6	313	318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296780
5	NC_019751	ATT	2	6	321	326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296780
6	NC_019751	TGT	2	6	394	399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296780
7	NC_019751	AAT	2	6	407	412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296780
8	NC_019751	GCA	2	6	428	433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296780
9	NC_019751	GTG	3	9	483	491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428296780
10	NC_019751	TGA	2	6	673	678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296780
11	NC_019751	AAG	2	6	711	716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296780
12	NC_019751	AGT	2	6	760	765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296780
13	NC_019751	ACC	2	6	781	786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296780
14	NC_019751	ATT	2	6	1109	1114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296780
15	NC_019751	GAT	2	6	1139	1144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296780
16	NC_019751	CGT	2	6	1160	1165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296780
17	NC_019751	GAA	2	6	1244	1249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296780
18	NC_019751	ACC	2	6	1584	1589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296781
19	NC_019751	TTG	2	6	1812	1817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296781
20	NC_019751	ATG	2	6	1901	1906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296781
21	NC_019751	ACC	2	6	1947	1952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296781
22	NC_019751	AGA	2	6	1953	1958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296781
23	NC_019751	ATG	2	6	2066	2071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296781
24	NC_019751	TCA	2	6	2137	2142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296781
25	NC_019751	TGC	2	6	2202	2207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296781
26	NC_019751	TAA	2	6	2250	2255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296781
27	NC_019751	ATA	2	6	2271	2276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296781
28	NC_019751	TCC	2	6	2341	2346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428296781
29	NC_019751	CGT	2	6	2347	2352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296781
30	NC_019751	CCT	2	6	2357	2362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428296781
31	NC_019751	CAC	2	6	2367	2372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296781
32	NC_019751	CAT	2	6	2381	2386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296781
33	NC_019751	TGC	2	6	2415	2420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296781
34	NC_019751	AAT	2	6	2472	2477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296781
35	NC_019751	AAT	2	6	2676	2681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296781
36	NC_019751	CTT	2	6	2690	2695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428296781
37	NC_019751	GCT	2	6	2963	2968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296782
38	NC_019751	ACA	2	6	3099	3104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428296782
39	NC_019751	TTA	2	6	3179	3184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296782
40	NC_019751	TAT	2	6	3205	3210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296782
41	NC_019751	GCT	2	6	3266	3271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296782
42	NC_019751	TGC	3	9	3304	3312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296782
43	NC_019751	TGC	2	6	3327	3332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296782
44	NC_019751	TCG	2	6	3374	3379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296782
45	NC_019751	CGT	2	6	3380	3385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296782
46	NC_019751	CGT	2	6	3606	3611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296783
47	NC_019751	ACC	2	6	3615	3620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296783
48	NC_019751	TAA	2	6	3656	3661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296783
49	NC_019751	TCG	3	9	3703	3711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296784
50	NC_019751	ACC	2	6	3821	3826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296784
51	NC_019751	CAA	2	6	3830	3835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428296784
52	NC_019751	TAG	2	6	4173	4178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296785
53	NC_019751	TAG	2	6	4212	4217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296785
54	NC_019751	TGA	2	6	4252	4257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296785
55	NC_019751	ATC	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296785
56	NC_019751	ATT	2	6	4402	4407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296785
57	NC_019751	CTG	2	6	4451	4456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296785
58	NC_019751	ACC	2	6	4471	4476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296785
59	NC_019751	AGA	2	6	4530	4535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296785
60	NC_019751	GAC	2	6	4821	4826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296785
61	NC_019751	CGT	2	6	4901	4906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296785
62	NC_019751	CTA	2	6	4929	4934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296785
63	NC_019751	GCA	2	6	4951	4956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296785
64	NC_019751	TGA	2	6	5053	5058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296785
65	NC_019751	GAT	2	6	5297	5302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296785
66	NC_019751	TAG	2	6	5562	5567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296785
67	NC_019751	ATG	2	6	5573	5578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296785
68	NC_019751	CGC	2	6	5596	5601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428296785
69	NC_019751	ACC	2	6	5662	5667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296785
70	NC_019751	GCG	2	6	5719	5724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428296785
71	NC_019751	AAC	2	6	5868	5873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428296785
72	NC_019751	CCG	2	6	5883	5888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428296785
73	NC_019751	ATG	2	6	5906	5911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296785
74	NC_019751	TTC	2	6	6095	6100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428296785
75	NC_019751	ATT	2	6	6167	6172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296785
76	NC_019751	ATT	2	6	6185	6190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296785
77	NC_019751	TTA	2	6	6579	6584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296786
78	NC_019751	TAA	2	6	6593	6598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296786
79	NC_019751	TCA	2	6	6781	6786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296786
80	NC_019751	ATA	2	6	6912	6917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296786
81	NC_019751	ATT	2	6	7028	7033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296786
82	NC_019751	ATT	2	6	7088	7093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296786
83	NC_019751	ACT	3	9	7094	7102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296786
84	NC_019751	ATA	2	6	7117	7122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296786
85	NC_019751	CTC	2	6	7174	7179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428296786
86	NC_019751	CCA	2	6	7191	7196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296786
87	NC_019751	ATA	2	6	7197	7202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296786
88	NC_019751	AGG	3	9	7280	7288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428296786
89	NC_019751	TAA	2	6	7328	7333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296786
90	NC_019751	TGC	2	6	7397	7402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296786
91	NC_019751	GAA	2	6	7415	7420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296786
92	NC_019751	AAT	2	6	7455	7460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296786
93	NC_019751	TCT	2	6	7513	7518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428296786
94	NC_019751	AAG	2	6	7520	7525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296786
95	NC_019751	TCA	2	6	7548	7553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296786
96	NC_019751	CAA	2	6	7777	7782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428296787
97	NC_019751	AGA	2	6	7841	7846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296787
98	NC_019751	TGA	2	6	7910	7915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296787
99	NC_019751	AGA	2	6	8090	8095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296787
100	NC_019751	TGG	2	6	8149	8154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428296787
101	NC_019751	GAA	2	6	8250	8255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296787
102	NC_019751	CCT	2	6	8422	8427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428296788
103	NC_019751	CGG	2	6	8454	8459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428296788
104	NC_019751	TAC	2	6	8470	8475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296788
105	NC_019751	GAA	2	6	8544	8549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296788
106	NC_019751	GTG	2	6	8809	8814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428296788
107	NC_019751	TCA	2	6	9450	9455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296789
108	NC_019751	CCA	2	6	9579	9584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296789
109	NC_019751	CCG	2	6	9588	9593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428296789
110	NC_019751	AAT	2	6	9628	9633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296789
111	NC_019751	ATG	2	6	9685	9690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296789
112	NC_019751	AGT	2	6	9869	9874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296789
113	NC_019751	CCA	2	6	9881	9886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296789
114	NC_019751	TTG	2	6	10563	10568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296790
115	NC_019751	ACA	2	6	10580	10585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428296790
116	NC_019751	AGC	2	6	10595	10600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296790
117	NC_019751	GAT	2	6	10654	10659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296790
118	NC_019751	AGA	2	6	10771	10776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296790
119	NC_019751	TTG	2	6	10833	10838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296790
120	NC_019751	TTG	2	6	10871	10876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296790
121	NC_019751	ACG	2	6	11098	11103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296790
122	NC_019751	TAT	2	6	11958	11963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296791
123	NC_019751	ACT	2	6	11987	11992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296791
124	NC_019751	TGA	2	6	12020	12025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296791
125	NC_019751	CGC	2	6	12166	12171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428296791
126	NC_019751	TTA	2	6	12202	12207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296791
127	NC_019751	TGT	2	6	12234	12239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296791
128	NC_019751	AAC	2	6	12288	12293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428296791
129	NC_019751	GCT	3	9	12322	12330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296791
130	NC_019751	GGT	2	6	12334	12339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428296791
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