MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Stanieria cyanosphaera PCC 7437 plasmid pSTA7437.03

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019750	AATAGA	2	12	464	475	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	434401191
2	NC_019750	CGGTCG	2	12	1263	1274	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	434401193
3	NC_019750	AAATTA	2	12	1775	1786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434401195
4	NC_019750	ACCGAA	2	12	2323	2334	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	434401196
5	NC_019750	AAATCA	2	12	2465	2476	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	434401196
6	NC_019750	TGAGGT	2	12	4745	4756	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	434401200
7	NC_019750	TACGCC	2	12	7305	7316	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	434401201
8	NC_019750	TCAACG	2	12	7954	7965	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	434401201
9	NC_019750	GCTGAA	2	12	9261	9272	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_019750	TCATCT	2	12	11274	11285	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	434401204
11	NC_019750	AGAATA	2	12	12827	12838	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	434401204
12	NC_019750	TTTGAA	2	12	17516	17527	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	434401210
13	NC_019750	AATTGA	2	12	17545	17556	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	434401210
14	NC_019750	TAAAGC	2	12	22635	22646	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434401216
15	NC_019750	ATTGCT	2	12	23857	23868	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434401217
16	NC_019750	CAGCTA	2	12	24067	24078	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	434401217
17	NC_019750	TGACGG	2	12	29126	29137	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	434401223
18	NC_019750	AGCTAC	2	12	32543	32554	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	434401225
19	NC_019750	CAATTT	2	12	33699	33710	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434401226
20	NC_019750	GGTTCG	2	12	34661	34672	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	434401227
21	NC_019750	CCTTAA	2	12	34870	34881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434401227
22	NC_019750	TAGAAG	2	12	35461	35472	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	434401227
23	NC_019750	GGAGAC	2	12	35557	35568	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	434401227
24	NC_019750	GAAAAA	2	12	35815	35826	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	434401228
25	NC_019750	AGTCGC	2	12	36930	36941	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	434401231
26	NC_019750	AAGTCA	2	12	37100	37111	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434401232
27	NC_019750	TTAGGA	2	12	41198	41209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434401236
28	NC_019750	TGATTG	2	12	46355	46366	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	434401238
29	NC_019750	GAATGC	2	12	48849	48860	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	434401242
30	NC_019750	AGTTAT	2	12	50765	50776	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019750	GTTATG	2	12	51258	51269	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	434401244
32	NC_019750	TGAAGG	2	12	53970	53981	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	434401244
33	NC_019750	GCCGTA	2	12	56376	56387	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	434401248
34	NC_019750	CATCGG	2	12	56650	56661	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	434401248
35	NC_019750	TTCGTG	2	12	59616	59627	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	434401251
36	NC_019750	CAGAAG	2	12	60302	60313	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	434401251
37	NC_019750	CTGCTA	2	12	61864	61875	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019750	TTTCTT	2	12	64324	64335	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	434401255

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.