MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Stanieria cyanosphaera PCC 7437 plasmid pSTA7437.03

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019750	GAGTT	2	10	205	214	20 %	40 %	40 %	0 %	434401191
2	NC_019750	TTTTG	2	10	841	850	0 %	80 %	20 %	0 %	434401193
3	NC_019750	ATTAA	2	10	2033	2042	60 %	40 %	0 %	0 %	434401195
4	NC_019750	ATTCA	2	10	3408	3417	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_019750	GGTTT	2	10	6684	6693	0 %	60 %	40 %	0 %	434401201
6	NC_019750	AATTC	2	10	11005	11014	40 %	40 %	0 %	20 %	434401204
7	NC_019750	GATTT	2	10	11745	11754	20 %	60 %	20 %	0 %	434401204
8	NC_019750	GCTGC	2	10	13009	13018	0 %	20 %	40 %	40 %	434401204
9	NC_019750	TTGAA	2	10	13487	13496	40 %	40 %	20 %	0 %	434401204
10	NC_019750	TGTTT	2	10	13537	13546	0 %	80 %	20 %	0 %	434401204
11	NC_019750	GAAGA	2	10	18658	18667	60 %	0 %	40 %	0 %	434401213
12	NC_019750	ATGAA	2	10	21084	21093	60 %	20 %	20 %	0 %	434401215
13	NC_019750	TTTTA	2	10	21220	21229	20 %	80 %	0 %	0 %	434401215
14	NC_019750	GAAGA	2	10	22262	22271	60 %	0 %	40 %	0 %	434401216
15	NC_019750	AACCA	2	10	22592	22601	60 %	0 %	0 %	40 %	434401216
16	NC_019750	AAATT	2	10	23617	23626	60 %	40 %	0 %	0 %	434401217
17	NC_019750	TTAGT	2	10	23804	23813	20 %	60 %	20 %	0 %	434401217
18	NC_019750	CCCAA	2	10	24116	24125	40 %	0 %	0 %	60 %	434401217
19	NC_019750	TAGAT	2	10	27202	27211	40 %	40 %	20 %	0 %	434401220
20	NC_019750	CTTCA	2	10	27514	27523	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_019750	TCCCA	2	10	28233	28242	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
22	NC_019750	ATTCG	2	10	28866	28875	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_019750	ATGGC	2	10	30880	30889	20 %	20 %	40 %	20 %	434401224
24	NC_019750	ATTCG	2	10	31610	31619	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_019750	CCGTA	2	10	31792	31801	20 %	20 %	20 %	40 %	434401225
26	NC_019750	AGTAA	2	10	32499	32508	60 %	20 %	20 %	0 %	434401225
27	NC_019750	AAGAG	2	10	34087	34096	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019750	TTAAA	2	10	34220	34229	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019750	GTTTT	2	10	34290	34299	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019750	CAACT	2	10	34520	34529	40 %	20 %	0 %	40 %	434401227
31	NC_019750	AAAAG	2	10	38705	38714	80 %	0 %	20 %	0 %	434401233
32	NC_019750	TTGTC	2	10	38852	38861	0 %	60 %	20 %	20 %	434401233
33	NC_019750	ATTTA	2	10	40217	40226	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019750	GGAAC	2	10	41920	41929	40 %	0 %	40 %	20 %	434401236
35	NC_019750	TGGGG	2	10	43684	43693	0 %	20 %	80 %	0 %	434401238
36	NC_019750	AATTC	2	10	46077	46086	40 %	40 %	0 %	20 %	434401238
37	NC_019750	TAAGT	2	10	46785	46794	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019750	CAAAC	2	10	47614	47623	60 %	0 %	0 %	40 %	434401240
39	NC_019750	GCGAC	2	10	47816	47825	20 %	0 %	40 %	40 %	434401240
40	NC_019750	CTGCC	2	10	48153	48162	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
41	NC_019750	GTTGG	2	10	49161	49170	0 %	40 %	60 %	0 %	434401242
42	NC_019750	GTAAG	2	10	49285	49294	40 %	20 %	40 %	0 %	434401242
43	NC_019750	ATTTC	2	10	51446	51455	20 %	60 %	0 %	20 %	434401244
44	NC_019750	TGAGG	2	10	51496	51505	20 %	20 %	60 %	0 %	434401244
45	NC_019750	ACTAC	2	10	51926	51935	40 %	20 %	0 %	40 %	434401244
46	NC_019750	CAAAC	2	10	53254	53263	60 %	0 %	0 %	40 %	434401244
47	NC_019750	GGGGC	2	10	54273	54282	0 %	0 %	80 %	20 %	434401244
48	NC_019750	ACTGG	2	10	55935	55944	20 %	20 %	40 %	20 %	434401247
49	NC_019750	TGGGA	2	10	57511	57520	20 %	20 %	60 %	0 %	434401248
50	NC_019750	AAATT	2	10	58590	58599	60 %	40 %	0 %	0 %	434401249
51	NC_019750	ATAGC	2	10	64016	64025	40 %	20 %	20 %	20 %	434401255
52	NC_019750	AGGCT	2	10	64655	64664	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_019750	CCCCA	2	10	67386	67395	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.