MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Stanieria cyanosphaera PCC 7437 plasmid pSTA7437.03

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019750	GAGTT	2	10	205	214	20 %	40 %	40 %	0 %	434401191
2	NC_019750	TTTTG	2	10	841	850	0 %	80 %	20 %	0 %	434401193
3	NC_019750	ATTAA	2	10	2033	2042	60 %	40 %	0 %	0 %	434401195
4	NC_019750	GGTTT	2	10	6684	6693	0 %	60 %	40 %	0 %	434401201
5	NC_019750	AATTC	2	10	11005	11014	40 %	40 %	0 %	20 %	434401204
6	NC_019750	GATTT	2	10	11745	11754	20 %	60 %	20 %	0 %	434401204
7	NC_019750	GCTGC	2	10	13009	13018	0 %	20 %	40 %	40 %	434401204
8	NC_019750	TTGAA	2	10	13487	13496	40 %	40 %	20 %	0 %	434401204
9	NC_019750	TGTTT	2	10	13537	13546	0 %	80 %	20 %	0 %	434401204
10	NC_019750	GAAGA	2	10	18658	18667	60 %	0 %	40 %	0 %	434401213
11	NC_019750	ATGAA	2	10	21084	21093	60 %	20 %	20 %	0 %	434401215
12	NC_019750	TTTTA	2	10	21220	21229	20 %	80 %	0 %	0 %	434401215
13	NC_019750	GAAGA	2	10	22262	22271	60 %	0 %	40 %	0 %	434401216
14	NC_019750	AACCA	2	10	22592	22601	60 %	0 %	0 %	40 %	434401216
15	NC_019750	AAATT	2	10	23617	23626	60 %	40 %	0 %	0 %	434401217
16	NC_019750	TTAGT	2	10	23804	23813	20 %	60 %	20 %	0 %	434401217
17	NC_019750	CCCAA	2	10	24116	24125	40 %	0 %	0 %	60 %	434401217
18	NC_019750	TAGAT	2	10	27202	27211	40 %	40 %	20 %	0 %	434401220
19	NC_019750	ATGGC	2	10	30880	30889	20 %	20 %	40 %	20 %	434401224
20	NC_019750	CCGTA	2	10	31792	31801	20 %	20 %	20 %	40 %	434401225
21	NC_019750	AGTAA	2	10	32499	32508	60 %	20 %	20 %	0 %	434401225
22	NC_019750	CAACT	2	10	34520	34529	40 %	20 %	0 %	40 %	434401227
23	NC_019750	AAAAG	2	10	38705	38714	80 %	0 %	20 %	0 %	434401233
24	NC_019750	TTGTC	2	10	38852	38861	0 %	60 %	20 %	20 %	434401233
25	NC_019750	GGAAC	2	10	41920	41929	40 %	0 %	40 %	20 %	434401236
26	NC_019750	TGGGG	2	10	43684	43693	0 %	20 %	80 %	0 %	434401238
27	NC_019750	AATTC	2	10	46077	46086	40 %	40 %	0 %	20 %	434401238
28	NC_019750	CAAAC	2	10	47614	47623	60 %	0 %	0 %	40 %	434401240
29	NC_019750	GCGAC	2	10	47816	47825	20 %	0 %	40 %	40 %	434401240
30	NC_019750	GTTGG	2	10	49161	49170	0 %	40 %	60 %	0 %	434401242
31	NC_019750	GTAAG	2	10	49285	49294	40 %	20 %	40 %	0 %	434401242
32	NC_019750	ATTTC	2	10	51446	51455	20 %	60 %	0 %	20 %	434401244
33	NC_019750	TGAGG	2	10	51496	51505	20 %	20 %	60 %	0 %	434401244
34	NC_019750	ACTAC	2	10	51926	51935	40 %	20 %	0 %	40 %	434401244
35	NC_019750	CAAAC	2	10	53254	53263	60 %	0 %	0 %	40 %	434401244
36	NC_019750	GGGGC	2	10	54273	54282	0 %	0 %	80 %	20 %	434401244
37	NC_019750	ACTGG	2	10	55935	55944	20 %	20 %	40 %	20 %	434401247
38	NC_019750	TGGGA	2	10	57511	57520	20 %	20 %	60 %	0 %	434401248
39	NC_019750	AAATT	2	10	58590	58599	60 %	40 %	0 %	0 %	434401249
40	NC_019750	ATAGC	2	10	64016	64025	40 %	20 %	20 %	20 %	434401255

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.