MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Stanieria cyanosphaera PCC 7437 plasmid pSTA7437.03

Total Repeats: 208

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019750	AAAG	2	8	144	151	75 %	0 %	25 %	0 %	434401191
2	NC_019750	AAAT	2	8	163	170	75 %	25 %	0 %	0 %	434401191
3	NC_019750	ATAG	2	8	354	361	50 %	25 %	25 %	0 %	434401191
4	NC_019750	TAAC	2	8	748	755	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_019750	TGTC	2	8	854	861	0 %	50 %	25 %	25 %	434401193
6	NC_019750	GTTG	2	8	991	998	0 %	50 %	50 %	0 %	434401193
7	NC_019750	TCTT	2	8	1027	1034	0 %	75 %	0 %	25 %	434401193
8	NC_019750	TTCT	2	8	1212	1219	0 %	75 %	0 %	25 %	434401193
9	NC_019750	ATGG	2	8	1877	1884	25 %	25 %	50 %	0 %	434401195
10	NC_019750	ACCA	2	8	2591	2598	50 %	0 %	0 %	50 %	434401196
11	NC_019750	AACC	2	8	2765	2772	50 %	0 %	0 %	50 %	434401197
12	NC_019750	TTGA	2	8	3287	3294	25 %	50 %	25 %	0 %	434401198
13	NC_019750	AGAT	2	8	3345	3352	50 %	25 %	25 %	0 %	434401198
14	NC_019750	TACA	2	8	3470	3477	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_019750	CAAC	2	8	3679	3686	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_019750	TAAA	2	8	4014	4021	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019750	ATTT	2	8	4332	4339	25 %	75 %	0 %	0 %	434401199
18	NC_019750	AAAG	2	8	4377	4384	75 %	0 %	25 %	0 %	434401199
19	NC_019750	AGGT	2	8	4648	4655	25 %	25 %	50 %	0 %	434401200
20	NC_019750	AAAC	2	8	4692	4699	75 %	0 %	0 %	25 %	434401200
21	NC_019750	ACCA	2	8	5219	5226	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_019750	ATAC	2	8	5370	5377	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_019750	CGAG	2	8	5735	5742	25 %	0 %	50 %	25 %	434401201
24	NC_019750	AAGA	2	8	6258	6265	75 %	0 %	25 %	0 %	434401201
25	NC_019750	CAAA	2	8	6284	6291	75 %	0 %	0 %	25 %	434401201
26	NC_019750	ACAG	2	8	6328	6335	50 %	0 %	25 %	25 %	434401201
27	NC_019750	GCAA	2	8	6650	6657	50 %	0 %	25 %	25 %	434401201
28	NC_019750	ATTC	2	8	7580	7587	25 %	50 %	0 %	25 %	434401201
29	NC_019750	ATCT	2	8	7933	7940	25 %	50 %	0 %	25 %	434401201
30	NC_019750	ATCC	2	8	8053	8060	25 %	25 %	0 %	50 %	434401201
31	NC_019750	ACCA	2	8	8229	8236	50 %	0 %	0 %	50 %	434401201
32	NC_019750	AAAG	2	8	8489	8496	75 %	0 %	25 %	0 %	434401201
33	NC_019750	TTTA	2	8	8518	8525	25 %	75 %	0 %	0 %	434401201
34	NC_019750	TAAA	2	8	8674	8681	75 %	25 %	0 %	0 %	434401201
35	NC_019750	TAGA	2	8	8929	8936	50 %	25 %	25 %	0 %	434401201
36	NC_019750	CAAA	2	8	9395	9402	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019750	GTAA	2	8	9598	9605	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019750	TGGT	2	8	9931	9938	0 %	50 %	50 %	0 %	434401202
39	NC_019750	TCAA	2	8	10199	10206	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_019750	AATA	2	8	10358	10365	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019750	AGGT	2	8	10489	10496	25 %	25 %	50 %	0 %	434401203
42	NC_019750	AACT	2	8	11054	11061	50 %	25 %	0 %	25 %	434401204
43	NC_019750	CTTC	2	8	11121	11128	0 %	50 %	0 %	50 %	434401204
44	NC_019750	ACTA	2	8	11819	11826	50 %	25 %	0 %	25 %	434401204
45	NC_019750	ATAG	2	8	12092	12099	50 %	25 %	25 %	0 %	434401204
46	NC_019750	TCCG	2	8	12122	12129	0 %	25 %	25 %	50 %	434401204
47	NC_019750	ACCT	2	8	12478	12485	25 %	25 %	0 %	50 %	434401204
48	NC_019750	CCAG	2	8	12984	12991	25 %	0 %	25 %	50 %	434401204
49	NC_019750	GAAC	2	8	13045	13052	50 %	0 %	25 %	25 %	434401204
50	NC_019750	AACT	2	8	13411	13418	50 %	25 %	0 %	25 %	434401204
51	NC_019750	ATTT	2	8	13745	13752	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019750	CAAT	2	8	13827	13834	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_019750	GAGC	2	8	14250	14257	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_019750	CAAA	2	8	14362	14369	75 %	0 %	0 %	25 %	434401206
55	NC_019750	CCAA	2	8	14371	14378	50 %	0 %	0 %	50 %	434401206
56	NC_019750	AAAG	2	8	14683	14690	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019750	GCGG	2	8	14848	14855	0 %	0 %	75 %	25 %	434401207
58	NC_019750	TTTA	2	8	15024	15031	25 %	75 %	0 %	0 %	434401207
59	NC_019750	CCAC	2	8	15230	15237	25 %	0 %	0 %	75 %	434401207
60	NC_019750	TCCC	2	8	15354	15361	0 %	25 %	0 %	75 %	434401207
61	NC_019750	AAAG	2	8	16545	16552	75 %	0 %	25 %	0 %	434401208
62	NC_019750	ATTT	2	8	16860	16867	25 %	75 %	0 %	0 %	434401209
63	NC_019750	AATA	2	8	17053	17060	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019750	AAGA	2	8	17249	17256	75 %	0 %	25 %	0 %	434401210
65	NC_019750	ATTT	2	8	17311	17318	25 %	75 %	0 %	0 %	434401210
66	NC_019750	AAGC	2	8	17432	17439	50 %	0 %	25 %	25 %	434401210
67	NC_019750	TAAA	2	8	17745	17752	75 %	25 %	0 %	0 %	434401211
68	NC_019750	AGCT	2	8	18644	18651	25 %	25 %	25 %	25 %	434401212
69	NC_019750	TCTG	2	8	18711	18718	0 %	50 %	25 %	25 %	434401213
70	NC_019750	AATT	2	8	18863	18870	50 %	50 %	0 %	0 %	434401213
71	NC_019750	TCTT	2	8	19764	19771	0 %	75 %	0 %	25 %	434401214
72	NC_019750	TCAA	2	8	20041	20048	50 %	25 %	0 %	25 %	434401214
73	NC_019750	TTAC	2	8	20102	20109	25 %	50 %	0 %	25 %	434401214
74	NC_019750	TCAA	2	8	20185	20192	50 %	25 %	0 %	25 %	434401214
75	NC_019750	CCCA	2	8	20427	20434	25 %	0 %	0 %	75 %	434401214
76	NC_019750	CAGC	3	12	20463	20474	25 %	0 %	25 %	50 %	434401214
77	NC_019750	GGAT	2	8	20891	20898	25 %	25 %	50 %	0 %	434401215
78	NC_019750	TTTC	2	8	21048	21055	0 %	75 %	0 %	25 %	434401215
79	NC_019750	GTTA	2	8	21413	21420	25 %	50 %	25 %	0 %	434401215
80	NC_019750	GAAA	2	8	21709	21716	75 %	0 %	25 %	0 %	434401216
81	NC_019750	TATT	2	8	22333	22340	25 %	75 %	0 %	0 %	434401216
82	NC_019750	ATCT	2	8	22524	22531	25 %	50 %	0 %	25 %	434401216
83	NC_019750	AAAG	2	8	22619	22626	75 %	0 %	25 %	0 %	434401216
84	NC_019750	GATC	2	8	22714	22721	25 %	25 %	25 %	25 %	434401216
85	NC_019750	AAGG	2	8	22868	22875	50 %	0 %	50 %	0 %	434401216
86	NC_019750	ATCT	2	8	22953	22960	25 %	50 %	0 %	25 %	434401216
87	NC_019750	AAGA	2	8	23913	23920	75 %	0 %	25 %	0 %	434401217
88	NC_019750	ACTC	2	8	23952	23959	25 %	25 %	0 %	50 %	434401217
89	NC_019750	AACG	2	8	24034	24041	50 %	0 %	25 %	25 %	434401217
90	NC_019750	CTCA	2	8	24256	24263	25 %	25 %	0 %	50 %	434401217
91	NC_019750	ACGA	2	8	24326	24333	50 %	0 %	25 %	25 %	434401217
92	NC_019750	GCCA	2	8	24502	24509	25 %	0 %	25 %	50 %	434401217
93	NC_019750	ACCC	2	8	24741	24748	25 %	0 %	0 %	75 %	434401217
94	NC_019750	TGAT	2	8	24900	24907	25 %	50 %	25 %	0 %	434401218
95	NC_019750	GATT	2	8	25237	25244	25 %	50 %	25 %	0 %	434401218
96	NC_019750	TAGT	2	8	25347	25354	25 %	50 %	25 %	0 %	434401218
97	NC_019750	TACT	2	8	25787	25794	25 %	50 %	0 %	25 %	434401219
98	NC_019750	TATT	2	8	25827	25834	25 %	75 %	0 %	0 %	434401219
99	NC_019750	TATT	2	8	26456	26463	25 %	75 %	0 %	0 %	434401219
100	NC_019750	AATT	2	8	26871	26878	50 %	50 %	0 %	0 %	434401220
101	NC_019750	ACTC	2	8	27277	27284	25 %	25 %	0 %	50 %	434401220
102	NC_019750	AAAC	2	8	28194	28201	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_019750	CAAC	2	8	28221	28228	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_019750	ACTT	2	8	28250	28257	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_019750	TTGG	2	8	28301	28308	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019750	GACT	2	8	28533	28540	25 %	25 %	25 %	25 %	434401222
107	NC_019750	ATAG	2	8	28700	28707	50 %	25 %	25 %	0 %	434401222
108	NC_019750	GTTT	2	8	28988	28995	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019750	CTTT	2	8	29025	29032	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_019750	TTCT	2	8	29332	29339	0 %	75 %	0 %	25 %	434401223
111	NC_019750	TGTT	2	8	30105	30112	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019750	TGAT	2	8	30202	30209	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019750	TTAT	2	8	30395	30402	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019750	AATC	2	8	30566	30573	50 %	25 %	0 %	25 %	434401224
115	NC_019750	GATA	2	8	30784	30791	50 %	25 %	25 %	0 %	434401224
116	NC_019750	TTTA	2	8	31054	31061	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019750	GTAA	2	8	31134	31141	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019750	TCGC	2	8	31517	31524	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_019750	GATC	2	8	32638	32645	25 %	25 %	25 %	25 %	434401225
120	NC_019750	GTTC	2	8	32790	32797	0 %	50 %	25 %	25 %	434401225
121	NC_019750	CTGA	2	8	32970	32977	25 %	25 %	25 %	25 %	434401226
122	NC_019750	TTAA	2	8	33167	33174	50 %	50 %	0 %	0 %	434401226
123	NC_019750	GAAT	2	8	33554	33561	50 %	25 %	25 %	0 %	434401226
124	NC_019750	ATTA	2	8	34434	34441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019750	AACA	2	8	34635	34642	75 %	0 %	0 %	25 %	434401227
126	NC_019750	CAAA	2	8	34684	34691	75 %	0 %	0 %	25 %	434401227
127	NC_019750	TTCA	2	8	36121	36128	25 %	50 %	0 %	25 %	434401229
128	NC_019750	ATAA	2	8	36625	36632	75 %	25 %	0 %	0 %	434401230
129	NC_019750	TCAA	2	8	37268	37275	50 %	25 %	0 %	25 %	434401232
130	NC_019750	TTCA	2	8	37382	37389	25 %	50 %	0 %	25 %	434401232
131	NC_019750	CTCG	2	8	37763	37770	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_019750	AGCT	2	8	39120	39127	25 %	25 %	25 %	25 %	434401233
133	NC_019750	AAAC	2	8	40198	40205	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_019750	AAAT	2	8	40273	40280	75 %	25 %	0 %	0 %	434401235
135	NC_019750	TATT	2	8	40730	40737	25 %	75 %	0 %	0 %	434401235
136	NC_019750	CAAC	2	8	40861	40868	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_019750	AACC	2	8	41245	41252	50 %	0 %	0 %	50 %	434401236
138	NC_019750	GGAA	2	8	41284	41291	50 %	0 %	50 %	0 %	434401236
139	NC_019750	CCAA	2	8	42319	42326	50 %	0 %	0 %	50 %	434401236
140	NC_019750	AAAC	2	8	42834	42841	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_019750	CCAG	2	8	42846	42853	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_019750	ACCA	2	8	42896	42903	50 %	0 %	0 %	50 %	434401237
143	NC_019750	TAGT	2	8	43045	43052	25 %	50 %	25 %	0 %	434401237
144	NC_019750	TTCT	2	8	43463	43470	0 %	75 %	0 %	25 %	434401238
145	NC_019750	GATG	2	8	43755	43762	25 %	25 %	50 %	0 %	434401238
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.