MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Stanieria cyanosphaera PCC 7437 plasmid pSTA7437.03

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019750	TC	3	6	2162	2167	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_019750	AT	3	6	2825	2830	50 %	50 %	0 %	0 %	434401197
3	NC_019750	CT	3	6	2967	2972	0 %	50 %	0 %	50 %	434401197
4	NC_019750	AT	3	6	3319	3324	50 %	50 %	0 %	0 %	434401198
5	NC_019750	TC	3	6	3942	3947	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_019750	AT	3	6	3986	3991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019750	CT	3	6	5309	5314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_019750	GA	3	6	9578	9583	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019750	TA	3	6	10315	10320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019750	AG	4	8	12015	12022	50 %	0 %	50 %	0 %	434401204
11	NC_019750	TG	3	6	12039	12044	0 %	50 %	50 %	0 %	434401204
12	NC_019750	AG	4	8	14100	14107	50 %	0 %	50 %	0 %	434401205
13	NC_019750	AG	3	6	14663	14668	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019750	AC	3	6	14671	14676	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_019750	TC	3	6	15741	15746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_019750	CT	3	6	16132	16137	0 %	50 %	0 %	50 %	434401208
17	NC_019750	GA	3	6	17380	17385	50 %	0 %	50 %	0 %	434401210
18	NC_019750	GT	3	6	20600	20605	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019750	AT	3	6	20972	20977	50 %	50 %	0 %	0 %	434401215
20	NC_019750	GA	3	6	20991	20996	50 %	0 %	50 %	0 %	434401215
21	NC_019750	GA	4	8	21445	21452	50 %	0 %	50 %	0 %	434401215
22	NC_019750	TC	3	6	21896	21901	0 %	50 %	0 %	50 %	434401216
23	NC_019750	TC	3	6	22403	22408	0 %	50 %	0 %	50 %	434401216
24	NC_019750	AG	3	6	24393	24398	50 %	0 %	50 %	0 %	434401217
25	NC_019750	AG	3	6	24520	24525	50 %	0 %	50 %	0 %	434401217
26	NC_019750	AC	3	6	24940	24945	50 %	0 %	0 %	50 %	434401218
27	NC_019750	TA	3	6	25510	25515	50 %	50 %	0 %	0 %	434401219
28	NC_019750	TA	3	6	26295	26300	50 %	50 %	0 %	0 %	434401219
29	NC_019750	TA	3	6	27041	27046	50 %	50 %	0 %	0 %	434401220
30	NC_019750	AT	3	6	27353	27358	50 %	50 %	0 %	0 %	434401220
31	NC_019750	AT	3	6	27451	27456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019750	AG	4	8	27653	27660	50 %	0 %	50 %	0 %	434401221
33	NC_019750	TC	3	6	27804	27809	0 %	50 %	0 %	50 %	434401221
34	NC_019750	AG	3	6	27904	27909	50 %	0 %	50 %	0 %	434401221
35	NC_019750	TC	3	6	29968	29973	0 %	50 %	0 %	50 %	434401223
36	NC_019750	CT	3	6	30284	30289	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_019750	TA	3	6	30335	30340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019750	CT	3	6	30404	30409	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_019750	AC	3	6	31081	31086	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_019750	GA	3	6	32441	32446	50 %	0 %	50 %	0 %	434401225
41	NC_019750	GA	3	6	33765	33770	50 %	0 %	50 %	0 %	434401226
42	NC_019750	AC	3	6	34279	34284	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_019750	TC	3	6	34537	34542	0 %	50 %	0 %	50 %	434401227
44	NC_019750	AC	3	6	37172	37177	50 %	0 %	0 %	50 %	434401232
45	NC_019750	AT	3	6	37304	37309	50 %	50 %	0 %	0 %	434401232
46	NC_019750	GT	3	6	38699	38704	0 %	50 %	50 %	0 %	434401233
47	NC_019750	AG	3	6	43864	43869	50 %	0 %	50 %	0 %	434401238
48	NC_019750	TC	3	6	44748	44753	0 %	50 %	0 %	50 %	434401238
49	NC_019750	AT	3	6	47303	47308	50 %	50 %	0 %	0 %	434401239
50	NC_019750	AG	3	6	49444	49449	50 %	0 %	50 %	0 %	434401242
51	NC_019750	GA	4	8	49899	49906	50 %	0 %	50 %	0 %	434401242
52	NC_019750	CT	3	6	50845	50850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_019750	TA	3	6	50876	50881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019750	TA	3	6	50886	50891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019750	GA	3	6	53880	53885	50 %	0 %	50 %	0 %	434401244
56	NC_019750	AG	3	6	53896	53901	50 %	0 %	50 %	0 %	434401244
57	NC_019750	GA	3	6	55594	55599	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019750	TA	3	6	57726	57731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019750	TC	3	6	58042	58047	0 %	50 %	0 %	50 %	434401249
60	NC_019750	TC	3	6	59190	59195	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_019750	TC	3	6	59241	59246	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_019750	TA	3	6	59913	59918	50 %	50 %	0 %	0 %	434401251
63	NC_019750	AG	3	6	60015	60020	50 %	0 %	50 %	0 %	434401251
64	NC_019750	AG	3	6	60293	60298	50 %	0 %	50 %	0 %	434401251
65	NC_019750	AT	3	6	60769	60774	50 %	50 %	0 %	0 %	434401252
66	NC_019750	TC	3	6	61519	61524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_019750	TC	3	6	61554	61559	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_019750	TC	3	6	62307	62312	0 %	50 %	0 %	50 %	434401253
69	NC_019750	AG	4	8	62654	62661	50 %	0 %	50 %	0 %	434401253
70	NC_019750	AT	3	6	65221	65226	50 %	50 %	0 %	0 %	434401256
71	NC_019750	AG	4	8	65788	65795	50 %	0 %	50 %	0 %	434401256
72	NC_019750	CT	3	6	66129	66134	0 %	50 %	0 %	50 %	434401256
73	NC_019750	AC	3	6	66374	66379	50 %	0 %	0 %	50 %	434401256
74	NC_019750	TC	3	6	66509	66514	0 %	50 %	0 %	50 %	434401256
75	NC_019750	AG	3	6	66915	66920	50 %	0 %	50 %	0 %	434401257

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.