MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Gloeocapsa sp. PCC 7428 plasmid pGLO7428.01

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019746	AAGCCG	2	12	215	226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434395722
2	NC_019746	CGTACT	2	12	1110	1121	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	434395722
3	NC_019746	GACTGC	2	12	1461	1472	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	434395722
4	NC_019746	CTTACT	2	12	4499	4510	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019746	CGATGA	2	12	5969	5980	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	434395723
6	NC_019746	CACAAA	2	12	10663	10674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434395723
7	NC_019746	TTGCGG	2	12	18386	18397	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	434395724
8	NC_019746	CAAACG	2	12	18863	18874	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	434395724
9	NC_019746	GTTGTC	2	12	22304	22315	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	434395724
10	NC_019746	ATCACA	2	12	25129	25140	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	434395725
11	NC_019746	CAAACA	2	12	25936	25947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434395725
12	NC_019746	GTTTAT	2	12	27676	27687	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	434395726
13	NC_019746	CGCTAG	2	12	31310	31321	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	434395728
14	NC_019746	ATTGGG	2	12	39563	39574	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019746	AGCAAC	2	12	40832	40843	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019746	GGTAGA	2	12	41508	41519	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	434395739
17	NC_019746	TGAATT	2	12	42645	42656	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	434395740
18	NC_019746	CCACAC	2	12	49500	49511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434395748
19	NC_019746	TATCAA	2	12	50602	50613	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	434395748
20	NC_019746	TTGGGG	2	12	53812	53823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019746	GGAACT	2	12	58072	58083	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	434395752
22	NC_019746	GATGCT	2	12	61247	61258	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_019746	TGCGAG	2	12	62413	62424	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_019746	GCTCAA	2	12	68065	68076	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	434395759
25	NC_019746	TCTACA	2	12	68862	68873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019746	GTTTAA	2	12	70384	70395	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019746	ACCCCT	2	12	72154	72165	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	434395762
28	NC_019746	TAAATC	2	12	72952	72963	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	434395763
29	NC_019746	GTTGAT	2	12	80637	80648	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	434395767
30	NC_019746	CCCTTA	2	12	81973	81984	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	434395769
31	NC_019746	AACGCG	2	12	86234	86245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019746	CTAACT	2	12	90152	90163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434395775
33	NC_019746	ACCTGT	2	12	98703	98714	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	434395781
34	NC_019746	TTTCGG	2	12	105108	105119	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	434395788
35	NC_019746	AAACTG	2	12	111543	111554	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434395793
36	NC_019746	TAGCGG	2	12	111772	111783	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	434395793
37	NC_019746	GCGATC	2	12	113386	113397	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	434395793
38	NC_019746	CGGAGG	2	12	118076	118087	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	434395798
39	NC_019746	ACGCTG	2	12	121342	121353	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	434395801
40	NC_019746	AAGTAG	2	12	126388	126399	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019746	ATCTGC	2	12	130862	130873	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	434395808
42	NC_019746	AAGTTG	2	12	134064	134075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019746	GTTTTT	2	12	134942	134953	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	434395812
44	NC_019746	GTTTGT	2	12	135958	135969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434395813
45	NC_019746	TGATTG	2	12	141597	141608	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	434395817
46	NC_019746	AAGATG	2	12	144942	144953	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019746	CTTGCT	2	12	145125	145136	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019746	CTTTTT	2	12	145486	145497	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_019746	CATCAA	2	12	147089	147100	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	434395820
50	NC_019746	CCGCCT	2	12	147490	147501	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	434395820
51	NC_019746	GTTGAA	2	12	147573	147584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434395820
52	NC_019746	ATCCAT	2	12	148646	148657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434395820
53	NC_019746	GTTGGA	2	12	150373	150384	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	434395820
54	NC_019746	GTTGGA	3	18	150397	150414	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	434395820
55	NC_019746	GTTGGA	2	12	150427	150438	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	434395820
56	NC_019746	GTTGGA	2	12	150451	150462	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	434395820
57	NC_019746	GTTGGA	2	12	150475	150486	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	434395820
58	NC_019746	GTTGGA	2	12	150499	150510	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	434395820
59	NC_019746	GAGTTG	3	18	150842	150859	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	434395820
60	NC_019746	GAGTTG	2	12	150896	150907	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	434395820
61	NC_019746	ACCACT	2	12	153356	153367	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	434395821
62	NC_019746	TACTTT	2	12	161875	161886	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_019746	ACAGGC	2	12	162444	162455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434395826
64	NC_019746	CAAAAG	2	12	163120	163131	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	434395826
65	NC_019746	CAGTTT	2	12	165664	165675	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434395826
66	NC_019746	TCAGCG	2	12	168950	168961	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	434395827
67	NC_019746	CTGCAA	2	12	171630	171641	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	434395827
68	NC_019746	ATTGGG	2	12	176167	176178	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	434395828
69	NC_019746	CAGCGT	2	12	176351	176362	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	434395828
70	NC_019746	AAGGGG	2	12	185477	185488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019746	GCGATC	2	12	189134	189145	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	434395831
72	NC_019746	ACCTCA	2	12	191695	191706	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	434395832
73	NC_019746	GATCGC	2	12	191898	191909	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	434395832
74	NC_019746	AACCGC	2	12	196049	196060	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	434395832
75	NC_019746	GTTCAT	2	12	197028	197039	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434395832
76	NC_019746	ACCGAT	2	12	197150	197161	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	434395832
77	NC_019746	GATTTA	2	12	198810	198821	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	434395832
78	NC_019746	GCTATG	2	12	200632	200643	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	434395833
79	NC_019746	GCGATC	2	12	203065	203076	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	434395834

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.