MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Gloeocapsa sp. PCC 7428 plasmid pGLO7428.01

Total Repeats: 119

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019746	TCGTG	2	10	2970	2979	0 %	40 %	40 %	20 %	434395722
2	NC_019746	TTTGG	2	10	3775	3784	0 %	60 %	40 %	0 %	434395722
3	NC_019746	TCATA	2	10	5021	5030	40 %	40 %	0 %	20 %	434395723
4	NC_019746	CGTTA	2	10	7609	7618	20 %	40 %	20 %	20 %	434395723
5	NC_019746	AATTA	2	10	7691	7700	60 %	40 %	0 %	0 %	434395723
6	NC_019746	ATTGG	2	10	7759	7768	20 %	40 %	40 %	0 %	434395723
7	NC_019746	AGGTT	2	10	9483	9492	20 %	40 %	40 %	0 %	434395723
8	NC_019746	TCAAG	2	10	10346	10355	40 %	20 %	20 %	20 %	434395723
9	NC_019746	ATCGC	2	10	10759	10768	20 %	20 %	20 %	40 %	434395723
10	NC_019746	CATCA	2	10	12188	12197	40 %	20 %	0 %	40 %	434395724
11	NC_019746	ACACA	2	10	12835	12844	60 %	0 %	0 %	40 %	434395724
12	NC_019746	AGCAA	2	10	13948	13957	60 %	0 %	20 %	20 %	434395724
13	NC_019746	CACAA	2	10	19887	19896	60 %	0 %	0 %	40 %	434395724
14	NC_019746	GCGAT	2	10	20862	20871	20 %	20 %	40 %	20 %	434395724
15	NC_019746	GATTT	2	10	21290	21299	20 %	60 %	20 %	0 %	434395724
16	NC_019746	GTCAA	2	10	22221	22230	40 %	20 %	20 %	20 %	434395724
17	NC_019746	TTATT	2	10	23432	23441	20 %	80 %	0 %	0 %	434395725
18	NC_019746	CAAGG	2	10	23599	23608	40 %	0 %	40 %	20 %	434395725
19	NC_019746	GGATC	2	10	23731	23740	20 %	20 %	40 %	20 %	434395725
20	NC_019746	GAATT	2	10	24508	24517	40 %	40 %	20 %	0 %	434395725
21	NC_019746	TTCCA	2	10	25008	25017	20 %	40 %	0 %	40 %	434395725
22	NC_019746	AAAAC	2	10	26141	26150	80 %	0 %	0 %	20 %	434395725
23	NC_019746	ATGCA	2	10	27975	27984	40 %	20 %	20 %	20 %	434395726
24	NC_019746	AATCA	2	10	28595	28604	60 %	20 %	0 %	20 %	434395726
25	NC_019746	CAAGC	2	10	28853	28862	40 %	0 %	20 %	40 %	434395726
26	NC_019746	ACGCT	2	10	30285	30294	20 %	20 %	20 %	40 %	434395728
27	NC_019746	TGAGA	2	10	37896	37905	40 %	20 %	40 %	0 %	434395737
28	NC_019746	CTCAA	2	10	41399	41408	40 %	20 %	0 %	40 %	434395739
29	NC_019746	AAATG	2	10	43430	43439	60 %	20 %	20 %	0 %	434395742
30	NC_019746	ACCAT	2	10	44627	44636	40 %	20 %	0 %	40 %	434395743
31	NC_019746	AGTAT	2	10	45946	45955	40 %	40 %	20 %	0 %	434395744
32	NC_019746	GTTGG	2	10	46872	46881	0 %	40 %	60 %	0 %	434395745
33	NC_019746	CGCTT	2	10	47790	47799	0 %	40 %	20 %	40 %	434395747
34	NC_019746	CGCAA	2	10	51088	51097	40 %	0 %	20 %	40 %	434395748
35	NC_019746	CAAGT	2	10	51446	51455	40 %	20 %	20 %	20 %	434395748
36	NC_019746	CCACT	2	10	58410	58419	20 %	20 %	0 %	60 %	434395753
37	NC_019746	TTCTT	2	10	59395	59404	0 %	80 %	0 %	20 %	434395755
38	NC_019746	AAAAT	2	10	60507	60516	80 %	20 %	0 %	0 %	434395756
39	NC_019746	CCCCA	2	10	60821	60830	20 %	0 %	0 %	80 %	434395756
40	NC_019746	TTGGG	2	10	64261	64270	0 %	40 %	60 %	0 %	434395757
41	NC_019746	GCTGG	2	10	65326	65335	0 %	20 %	60 %	20 %	434395758
42	NC_019746	GCTGG	2	10	66190	66199	0 %	20 %	60 %	20 %	434395758
43	NC_019746	ACAGA	2	10	66303	66312	60 %	0 %	20 %	20 %	434395758
44	NC_019746	TATTT	2	10	81509	81518	20 %	80 %	0 %	0 %	434395768
45	NC_019746	TGCAG	2	10	83244	83253	20 %	20 %	40 %	20 %	434395770
46	NC_019746	CTGCT	2	10	83345	83354	0 %	40 %	20 %	40 %	434395770
47	NC_019746	CTCAC	2	10	86611	86620	20 %	20 %	0 %	60 %	434395773
48	NC_019746	TGAGT	2	10	87503	87512	20 %	40 %	40 %	0 %	434395773
49	NC_019746	ATCGC	2	10	92829	92838	20 %	20 %	20 %	40 %	434395777
50	NC_019746	CAAAA	2	10	94010	94019	80 %	0 %	0 %	20 %	434395778
51	NC_019746	GTGGA	2	10	104882	104891	20 %	20 %	60 %	0 %	434395788
52	NC_019746	TGAAC	2	10	106216	106225	40 %	20 %	20 %	20 %	434395790
53	NC_019746	TGCGC	2	10	107809	107818	0 %	20 %	40 %	40 %	434395791
54	NC_019746	TTGAC	2	10	112182	112191	20 %	40 %	20 %	20 %	434395793
55	NC_019746	GTGAA	2	10	112234	112243	40 %	20 %	40 %	0 %	434395793
56	NC_019746	GCTTG	2	10	113936	113945	0 %	40 %	40 %	20 %	434395793
57	NC_019746	TGCAA	2	10	116005	116014	40 %	20 %	20 %	20 %	434395795
58	NC_019746	AGCCA	2	10	116264	116273	40 %	0 %	20 %	40 %	434395795
59	NC_019746	TTCGT	2	10	116807	116816	0 %	60 %	20 %	20 %	434395796
60	NC_019746	CAACT	2	10	116987	116996	40 %	20 %	0 %	40 %	434395796
61	NC_019746	GCGCA	2	10	118206	118215	20 %	0 %	40 %	40 %	434395798
62	NC_019746	GTTCC	2	10	118744	118753	0 %	40 %	20 %	40 %	434395799
63	NC_019746	AACGA	2	10	119508	119517	60 %	0 %	20 %	20 %	434395799
64	NC_019746	TTCAC	2	10	121745	121754	20 %	40 %	0 %	40 %	434395801
65	NC_019746	TTGCC	2	10	128424	128433	0 %	40 %	20 %	40 %	434395806
66	NC_019746	TGGAT	2	10	129141	129150	20 %	40 %	40 %	0 %	434395807
67	NC_019746	TAAAG	2	10	135415	135424	60 %	20 %	20 %	0 %	434395813
68	NC_019746	ATAGT	2	10	139205	139214	40 %	40 %	20 %	0 %	434395815
69	NC_019746	ATTTA	2	10	139629	139638	40 %	60 %	0 %	0 %	434395815
70	NC_019746	TCGCA	2	10	142750	142759	20 %	20 %	20 %	40 %	434395817
71	NC_019746	GTTGA	2	10	147354	147363	20 %	40 %	40 %	0 %	434395820
72	NC_019746	GCCAC	2	10	147850	147859	20 %	0 %	20 %	60 %	434395820
73	NC_019746	ATTGT	2	10	149926	149935	20 %	60 %	20 %	0 %	434395820
74	NC_019746	ATCGT	2	10	151932	151941	20 %	40 %	20 %	20 %	434395821
75	NC_019746	TTCGC	2	10	151959	151968	0 %	40 %	20 %	40 %	434395821
76	NC_019746	TAAAA	2	10	154357	154366	80 %	20 %	0 %	0 %	434395821
77	NC_019746	ACCAT	2	10	156856	156865	40 %	20 %	0 %	40 %	434395822
78	NC_019746	ATCGC	2	10	157662	157671	20 %	20 %	20 %	40 %	434395823
79	NC_019746	CGAGC	2	10	162358	162367	20 %	0 %	40 %	40 %	434395826
80	NC_019746	TGAAT	2	10	163575	163584	40 %	40 %	20 %	0 %	434395826
81	NC_019746	GTTTG	2	10	163770	163779	0 %	60 %	40 %	0 %	434395826
82	NC_019746	TAGGA	2	10	163980	163989	40 %	20 %	40 %	0 %	434395826
83	NC_019746	AACCG	2	10	164667	164676	40 %	0 %	20 %	40 %	434395826
84	NC_019746	GCTAC	2	10	165057	165066	20 %	20 %	20 %	40 %	434395826
85	NC_019746	ATCGC	2	10	165864	165873	20 %	20 %	20 %	40 %	434395826
86	NC_019746	CGATC	2	10	167360	167369	20 %	20 %	20 %	40 %	434395827
87	NC_019746	AAATC	2	10	169070	169079	60 %	20 %	0 %	20 %	434395827
88	NC_019746	AATTG	2	10	173441	173450	40 %	40 %	20 %	0 %	434395827
89	NC_019746	TTACA	2	10	174905	174914	40 %	40 %	0 %	20 %	434395828
90	NC_019746	TTTAG	2	10	175658	175667	20 %	60 %	20 %	0 %	434395828
91	NC_019746	TCAGA	2	10	176231	176240	40 %	20 %	20 %	20 %	434395828
92	NC_019746	GCTGG	2	10	177418	177427	0 %	20 %	60 %	20 %	434395828
93	NC_019746	TTGAT	2	10	178164	178173	20 %	60 %	20 %	0 %	434395828
94	NC_019746	AGGTG	2	10	178984	178993	20 %	20 %	60 %	0 %	434395828
95	NC_019746	TTGGT	2	10	179071	179080	0 %	60 %	40 %	0 %	434395828
96	NC_019746	TTGAT	2	10	179667	179676	20 %	60 %	20 %	0 %	434395828
97	NC_019746	GCAAC	2	10	180614	180623	40 %	0 %	20 %	40 %	434395828
98	NC_019746	TCAAT	2	10	181200	181209	40 %	40 %	0 %	20 %	434395829
99	NC_019746	CAACG	2	10	183929	183938	40 %	0 %	20 %	40 %	434395829
100	NC_019746	AATCA	2	10	184715	184724	60 %	20 %	0 %	20 %	434395829
101	NC_019746	CGATC	2	10	185874	185883	20 %	20 %	20 %	40 %	434395830
102	NC_019746	AAATT	2	10	186242	186251	60 %	40 %	0 %	0 %	434395830
103	NC_019746	TATCT	2	10	186635	186644	20 %	60 %	0 %	20 %	434395830
104	NC_019746	TTACA	2	10	187310	187319	40 %	40 %	0 %	20 %	434395831
105	NC_019746	CGCAG	2	10	187928	187937	20 %	0 %	40 %	40 %	434395831
106	NC_019746	TACAG	2	10	188134	188143	40 %	20 %	20 %	20 %	434395831
107	NC_019746	CACTC	2	10	188629	188638	20 %	20 %	0 %	60 %	434395831
108	NC_019746	CGATT	2	10	189930	189939	20 %	40 %	20 %	20 %	434395831
109	NC_019746	CAAAT	2	10	189965	189974	60 %	20 %	0 %	20 %	434395831
110	NC_019746	TTGTA	2	10	190305	190314	20 %	60 %	20 %	0 %	434395831
111	NC_019746	ATTGA	2	10	191829	191838	40 %	40 %	20 %	0 %	434395832
112	NC_019746	TGCGC	2	10	191938	191947	0 %	20 %	40 %	40 %	434395832
113	NC_019746	GGTTT	2	10	192979	192988	0 %	60 %	40 %	0 %	434395832
114	NC_019746	CCATC	2	10	194506	194515	20 %	20 %	0 %	60 %	434395832
115	NC_019746	GTTTA	2	10	195206	195215	20 %	60 %	20 %	0 %	434395832
116	NC_019746	ACATC	2	10	195287	195296	40 %	20 %	0 %	40 %	434395832
117	NC_019746	AATTT	2	10	196183	196192	40 %	60 %	0 %	0 %	434395832
118	NC_019746	GTAGA	2	10	198790	198799	40 %	20 %	40 %	0 %	434395832
119	NC_019746	TAATA	2	10	203017	203026	60 %	40 %	0 %	0 %	434395834

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.