MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Gloeocapsa sp. PCC 7428 plasmid pGLO7428.01

Total Repeats: 130

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019746	ACTC	2	8	4451	4458	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_019746	TCCC	2	8	26198	26205	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_019746	GTTC	2	8	26240	26247	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_019746	GAAC	2	8	31966	31973	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_019746	TAAA	2	8	32278	32285	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019746	GGAA	2	8	32720	32727	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019746	TCAT	2	8	32771	32778	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_019746	AATT	2	8	34029	34036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019746	AATT	2	8	34189	34196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019746	TTAA	2	8	34198	34205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019746	ACCA	2	8	34276	34283	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_019746	TTAG	2	8	35368	35375	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019746	TTTG	2	8	35487	35494	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019746	AAGA	2	8	35710	35717	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019746	TTTG	2	8	36379	36386	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019746	AAGA	2	8	36658	36665	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019746	ACAA	2	8	36703	36710	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_019746	CAGC	2	8	36750	36757	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_019746	CACT	2	8	37147	37154	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_019746	GGAA	2	8	38589	38596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019746	TAGC	2	8	38916	38923	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_019746	AAAG	2	8	39123	39130	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019746	CGAG	2	8	39624	39631	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_019746	ATTG	2	8	40175	40182	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019746	TCAA	2	8	40274	40281	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_019746	CGTT	2	8	43689	43696	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_019746	AATT	2	8	43828	43835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019746	TTAA	2	8	44008	44015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019746	TACC	2	8	48849	48856	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_019746	AGAT	2	8	52516	52523	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019746	TTTC	2	8	52887	52894	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_019746	TAGG	2	8	53308	53315	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019746	CGGA	2	8	53439	53446	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_019746	AAGT	2	8	53731	53738	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019746	GATA	2	8	53851	53858	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019746	ATAG	2	8	54298	54305	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019746	TCAT	2	8	54401	54408	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_019746	ATGA	2	8	59054	59061	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019746	TTCT	2	8	60930	60937	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_019746	GGAG	2	8	60963	60970	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019746	ATGT	2	8	61145	61152	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019746	ACCT	2	8	61239	61246	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_019746	AGTC	2	8	61784	61791	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_019746	CAAG	2	8	62030	62037	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_019746	CTTG	2	8	63138	63145	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_019746	AATC	2	8	63182	63189	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_019746	AAGT	2	8	63381	63388	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019746	CCAC	2	8	63492	63499	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
49	NC_019746	CTTC	2	8	68579	68586	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_019746	TCAC	2	8	68719	68726	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_019746	AAGC	2	8	68889	68896	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_019746	CAAT	2	8	69408	69415	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_019746	GTAA	2	8	69535	69542	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019746	AATG	2	8	69643	69650	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019746	AGTA	2	8	70727	70734	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019746	CTTG	2	8	70874	70881	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_019746	CTAC	2	8	71502	71509	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_019746	TCAA	2	8	72909	72916	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_019746	AAGT	2	8	74351	74358	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019746	TTCT	2	8	74368	74375	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_019746	GAAA	2	8	74396	74403	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019746	GATT	2	8	75491	75498	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019746	TGAG	2	8	75822	75829	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019746	TGGC	2	8	75854	75861	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_019746	CGAC	2	8	76117	76124	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_019746	AACA	2	8	76703	76710	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_019746	TGCC	2	8	78528	78535	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_019746	TTAT	2	8	78555	78562	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019746	ATGT	2	8	78674	78681	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019746	CAAA	2	8	79566	79573	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_019746	ACAA	2	8	79858	79865	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_019746	GCCT	2	8	80109	80116	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_019746	AGTA	2	8	80338	80345	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019746	TACA	2	8	84334	84341	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_019746	CTTA	2	8	87679	87686	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_019746	ATAG	2	8	93275	93282	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019746	AATC	2	8	95295	95302	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_019746	CTTT	2	8	95335	95342	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_019746	TTGC	2	8	96438	96445	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_019746	TAGC	2	8	97109	97116	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_019746	TCGA	2	8	97702	97709	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_019746	GAAA	2	8	98093	98100	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019746	ACCT	2	8	98320	98327	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_019746	TTTG	2	8	98562	98569	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019746	TTAT	2	8	98584	98591	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019746	CAAA	2	8	98617	98624	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_019746	CCAA	2	8	103147	103154	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_019746	CATT	2	8	104338	104345	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_019746	CAGA	2	8	105437	105444	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_019746	CCTT	2	8	105479	105486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_019746	TTAT	2	8	105622	105629	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019746	GATT	2	8	108850	108857	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019746	TGAG	2	8	109369	109376	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019746	CTTA	2	8	115339	115346	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_019746	CTTT	2	8	117308	117315	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_019746	CAAA	2	8	117413	117420	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_019746	AGTC	2	8	120889	120896	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_019746	ACCC	2	8	121042	121049	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
99	NC_019746	ATCG	2	8	122435	122442	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_019746	TTCT	2	8	123587	123594	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_019746	GCAA	2	8	125339	125346	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_019746	GGTT	2	8	125431	125438	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019746	TAAG	2	8	125705	125712	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019746	GTGA	2	8	126515	126522	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019746	ATTT	2	8	130033	130040	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019746	TGTT	2	8	130209	130216	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019746	GAAC	2	8	130350	130357	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_019746	TAAG	2	8	130439	130446	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019746	ATCT	2	8	132498	132505	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_019746	GGAT	2	8	132552	132559	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019746	TATT	2	8	132757	132764	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019746	GATA	2	8	132769	132776	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019746	TAAA	2	8	133337	133344	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019746	TGAA	2	8	138780	138787	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019746	TTGA	2	8	139652	139659	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019746	TTAA	2	8	140047	140054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019746	TTCA	2	8	140066	140073	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_019746	AAAT	2	8	145081	145088	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019746	ATAA	2	8	146653	146660	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019746	TATT	2	8	155489	155496	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019746	AGTG	2	8	155576	155583	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019746	TAAA	2	8	191480	191487	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019746	TTTA	2	8	201360	201367	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019746	AGCT	2	8	201458	201465	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_019746	CGAA	2	8	201722	201729	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_019746	AAAT	2	8	201746	201753	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019746	TGGT	2	8	201804	201811	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019746	TGGG	2	8	201962	201969	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019746	TGAA	2	8	204283	204290	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019746	TAGT	2	8	204455	204462	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.