MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Gloeocapsa sp. PCC 7428

Total Repeats: 260

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019745	ACGAAA	2	12	3775	3786	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_019745	TTGATA	2	12	14499	14510	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019745	AAATTT	2	12	48711	48722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019745	CTCATA	2	12	54660	54671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019745	AAAATG	2	12	125553	125564	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019745	TGGTCA	2	12	126619	126630	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_019745	TCGCGA	2	12	199453	199464	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019745	TGCAAT	2	12	228882	228893	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_019745	TACCTT	2	12	233039	233050	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019745	CCTTGC	2	12	247245	247256	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_019745	ACGCTA	2	12	247301	247312	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019745	ATCGCG	2	12	248806	248817	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019745	TAGCTG	2	12	259265	259276	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_019745	TTTAAA	2	12	304049	304060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019745	TCAAAA	2	12	310158	310169	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_019745	ATCGCG	2	12	325550	325561	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019745	TTTATA	2	12	326407	326418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019745	AAGTGA	2	12	344400	344411	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019745	ATAGTG	2	12	403261	403272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019745	TTTATT	2	12	462655	462666	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019745	TCGCAG	2	12	465863	465874	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019745	TACAAA	2	12	469593	469604	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_019745	TTTGGG	2	12	506698	506709	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019745	CAAACT	2	12	514701	514712	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019745	CGGCTG	2	12	540563	540574	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019745	TCTTAA	2	12	591609	591620	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_019745	TACTAA	2	12	594232	594243	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_019745	ATACTA	2	12	594417	594428	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_019745	CAAAGA	2	12	620765	620776	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_019745	AAATTA	2	12	621873	621884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019745	TAGGAT	2	12	629138	629149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019745	CTGGAA	2	12	660214	660225	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_019745	GTTTGT	2	12	666682	666693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019745	TAGCTT	2	12	751769	751780	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_019745	ATTAGC	2	12	758198	758209	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_019745	CAAAAA	2	12	758282	758293	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_019745	AAAATT	2	12	785830	785841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019745	TTGTAA	2	12	816747	816758	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019745	ATATTT	2	12	831075	831086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019745	TTATCG	2	12	857883	857894	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_019745	TTAAAC	2	12	893763	893774	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_019745	GCTAAT	2	12	922909	922920	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_019745	TATTTT	2	12	934975	934986	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019745	AGATTT	2	12	947359	947370	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019745	CTGAAC	2	12	999503	999514	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019745	AAGCAA	2	12	1010522	1010533	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_019745	ATAAAT	2	12	1016991	1017002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019745	TTATAC	2	12	1051025	1051036	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_019745	CTTTTA	2	12	1053092	1053103	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_019745	CTTCAT	2	12	1061851	1061862	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019745	CTAGGG	2	12	1091151	1091162	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_019745	CAGTAA	2	12	1101424	1101435	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_019745	TCCAAA	2	12	1142974	1142985	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019745	TAAAAG	2	12	1144111	1144122	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019745	TTAAAT	2	12	1149802	1149813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019745	TTTAAA	2	12	1216323	1216334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019745	TTCTAA	2	12	1235322	1235333	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_019745	GTTAAG	2	12	1265974	1265985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019745	ATAAAA	2	12	1272581	1272592	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019745	ATTTAT	2	12	1272659	1272670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019745	TTAAAT	2	12	1296668	1296679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019745	ATCGCC	2	12	1313462	1313473	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_019745	TGTGAG	2	12	1316944	1316955	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019745	TCACCC	2	12	1346047	1346058	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_019745	GCCTGT	2	12	1355160	1355171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019745	CTGAAG	2	12	1355422	1355433	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_019745	GCGATC	2	12	1363753	1363764	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019745	ACAAAA	2	12	1421007	1421018	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_019745	AAATTA	2	12	1425955	1425966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019745	TTCTAA	2	12	1428815	1428826	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_019745	AGTCAA	2	12	1430351	1430362	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_019745	CTAATT	2	12	1441421	1441432	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_019745	TATCAA	2	12	1441619	1441630	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_019745	TAATTA	2	12	1455991	1456002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019745	GTTTAT	2	12	1469372	1469383	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019745	CTTTTA	2	12	1507422	1507433	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_019745	TTAATT	2	12	1533380	1533391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019745	CGCTAC	2	12	1547714	1547725	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79	NC_019745	TAAATA	2	12	1616089	1616100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019745	GTTCTT	2	12	1616585	1616596	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_019745	GGGTTC	2	12	1642830	1642841	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_019745	AATTTT	2	12	1668065	1668076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019745	TGCCAG	2	12	1709861	1709872	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_019745	TCTTAG	2	12	1724803	1724814	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_019745	AAGCTT	2	12	1752907	1752918	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_019745	TAGTGT	2	12	1767390	1767401	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019745	TCAATT	2	12	1796990	1797001	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_019745	TCAATT	2	12	1801263	1801274	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_019745	TGTACT	2	12	1841458	1841469	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_019745	TTTAAT	2	12	1861212	1861223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019745	ATGTCA	2	12	1867403	1867414	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_019745	CGCCAA	2	12	1876401	1876412	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_019745	TTTGGT	2	12	1885964	1885975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019745	CTGCAA	2	12	1887314	1887325	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_019745	TTATGA	2	12	1891572	1891583	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019745	CCTATT	2	12	1896516	1896527	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019745	TGAGAT	2	12	1908640	1908651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019745	AGTTGT	2	12	1912055	1912066	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019745	AATTTT	2	12	1912107	1912118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019745	AAATAC	2	12	1914120	1914131	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_019745	ATTTTA	2	12	1942070	1942081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019745	TTTATC	2	12	1943869	1943880	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_019745	CGATAT	2	12	1952946	1952957	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_019745	TTTGCG	2	12	2026613	2026624	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_019745	TATTAA	2	12	2028809	2028820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019745	CTTCAA	2	12	2043736	2043747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_019745	AAAATA	2	12	2106010	2106021	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019745	TAGCGC	2	12	2118801	2118812	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_019745	AGCCCA	2	12	2136485	2136496	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
110	NC_019745	AAAGTA	2	12	2179181	2179192	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019745	AACCCC	2	12	2210614	2210625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_019745	AAGATA	2	12	2230238	2230249	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019745	CCTATG	2	12	2270269	2270280	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019745	CAAAAT	2	12	2294758	2294769	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_019745	TCTTTG	2	12	2294806	2294817	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_019745	CTAATT	2	12	2295954	2295965	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_019745	TCACTC	2	12	2350493	2350504	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_019745	AATTCT	2	12	2373920	2373931	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_019745	TTTTCA	2	12	2374481	2374492	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_019745	ACTAGA	2	12	2374493	2374504	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_019745	GCGTGA	2	12	2378220	2378231	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_019745	ATTAAT	2	12	2385037	2385048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019745	GATGCA	2	12	2403827	2403838	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_019745	ATTTAC	2	12	2404958	2404969	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_019745	ACAGAA	2	12	2406111	2406122	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_019745	CCAAGC	2	12	2417673	2417684	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
127	NC_019745	ATTTAT	2	12	2421241	2421252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019745	TACCTT	2	12	2436742	2436753	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_019745	AAAAAC	2	12	2439277	2439288	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_019745	TTTATG	2	12	2439749	2439760	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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132	NC_019745	TTATAA	2	12	2445788	2445799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019745	CACAGA	2	12	2450246	2450257	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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246	NC_019745	ATCTTC	2	12	4965171	4965182	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
247	NC_019745	ACTTCA	2	12	4965637	4965648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
248	NC_019745	TAAAGT	2	12	4993228	4993239	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
249	NC_019745	GAAACC	2	12	5005421	5005432	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
250	NC_019745	TACTAT	2	12	5041246	5041257	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
251	NC_019745	TAAGAG	2	12	5052816	5052827	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
252	NC_019745	AAGTGT	2	12	5065882	5065893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
253	NC_019745	TCTTTA	2	12	5071908	5071919	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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258	NC_019745	TGAAAT	2	12	5404794	5404805	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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260	NC_019745	AAATTG	2	12	5428150	5428161	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.