MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Gloeocapsa sp. PCC 7428

Total Repeats: 832

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019745	GCAAG	2	10	8841	8850	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_019745	TTCAT	2	10	11520	11529	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_019745	TCAAT	2	10	14536	14545	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_019745	AAATG	2	10	35610	35619	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019745	ACTCA	2	10	37637	37646	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_019745	AAGTA	2	10	46630	46639	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019745	ATCCT	2	10	60854	60863	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_019745	ATAAA	2	10	75278	75287	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019745	TTGCC	2	10	83142	83151	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_019745	TCTCT	2	10	88809	88818	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_019745	CCTAA	2	10	88900	88909	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_019745	AAATT	2	10	89642	89651	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019745	ATAAA	2	10	97633	97642	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019745	TAGCT	2	10	108203	108212	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_019745	ACTCA	2	10	108639	108648	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_019745	TTTTA	2	10	120184	120193	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019745	TAGCA	2	10	127853	127862	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_019745	ACTCA	2	10	135088	135097	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_019745	GACTC	2	10	135131	135140	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_019745	TTTGC	2	10	139289	139298	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_019745	CTGTG	2	10	150891	150900	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_019745	CAGTG	2	10	151037	151046	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_019745	TTTAA	2	10	154882	154891	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019745	CTTTA	2	10	163315	163324	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_019745	CCTTT	2	10	164098	164107	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_019745	ACAAA	2	10	164186	164195	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_019745	ACGTA	2	10	171365	171374	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_019745	GTTAA	2	10	171389	171398	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019745	CCAAT	2	10	183500	183509	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_019745	GAAGC	2	10	187896	187905	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_019745	CCTAA	2	10	193043	193052	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_019745	TTCAA	2	10	202382	202391	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_019745	AGATG	2	10	202541	202550	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019745	CTAGC	2	10	202618	202627	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_019745	GCGCT	2	10	208804	208813	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_019745	TCACT	2	10	213972	213981	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_019745	TCGCC	2	10	233428	233437	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
38	NC_019745	CGTTA	2	10	235667	235676	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_019745	CAATT	2	10	246439	246448	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_019745	ATCGC	2	10	249181	249190	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_019745	TAAGT	2	10	262922	262931	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019745	TTAAA	2	10	268296	268305	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019745	TGTTT	2	10	278990	278999	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019745	CATTA	2	10	283556	283565	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_019745	CGCTT	2	10	286767	286776	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_019745	AATTT	2	10	287107	287116	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019745	TTAAC	2	10	287315	287324	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_019745	CGCAG	2	10	295541	295550	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_019745	TTAAT	2	10	302582	302591	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019745	AATTA	2	10	304798	304807	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019745	CTAAT	2	10	308025	308034	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_019745	GTAGA	2	10	328181	328190	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019745	TCAAC	2	10	341699	341708	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_019745	TTCGT	2	10	342637	342646	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_019745	TAGCG	2	10	344326	344335	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_019745	GTAGG	2	10	344341	344350	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019745	AATGA	2	10	349955	349964	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019745	AAAGA	2	10	354860	354869	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019745	TTGAT	2	10	355513	355522	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019745	TAAAG	2	10	356554	356563	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019745	AACTT	2	10	360608	360617	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_019745	TACTT	2	10	363427	363436	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_019745	CAAAG	2	10	365786	365795	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_019745	AAATT	2	10	376451	376460	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019745	GTTTT	2	10	376584	376593	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019745	TTTAA	2	10	392513	392522	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019745	CTGTA	2	10	392747	392756	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_019745	AAGTT	2	10	393717	393726	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019745	TAAAA	2	10	393809	393818	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019745	CGTCT	2	10	394660	394669	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_019745	AATAA	2	10	411648	411657	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019745	ATAGT	2	10	438494	438503	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019745	ATTAC	2	10	454248	454257	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_019745	CTTTC	2	10	462232	462241	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_019745	ATTTA	2	10	473202	473211	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019745	AGCGT	2	10	488499	488508	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_019745	TACTT	2	10	489400	489409	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_019745	ATCTT	2	10	493167	493176	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_019745	CAAAA	2	10	494130	494139	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_019745	TAAAG	2	10	495380	495389	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019745	AGTGG	2	10	506801	506810	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019745	CAAGG	2	10	509456	509465	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_019745	TAGAA	2	10	510688	510697	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019745	AAATT	2	10	514745	514754	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019745	TTAAT	2	10	519825	519834	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019745	CTGTG	2	10	536958	536967	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_019745	CAGTG	2	10	537104	537113	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_019745	GCCCT	2	10	537694	537703	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
89	NC_019745	AAGTA	2	10	537784	537793	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019745	TAATA	2	10	554469	554478	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019745	GGCAA	2	10	557394	557403	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_019745	GAATT	2	10	573383	573392	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019745	CAAAA	2	10	577804	577813	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_019745	TTGTA	2	10	578092	578101	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019745	TCTAC	2	10	582479	582488	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_019745	CGTGG	2	10	587761	587770	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
97	NC_019745	CAAAA	2	10	601907	601916	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_019745	CCACA	2	10	615575	615584	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
99	NC_019745	TAGAT	2	10	621845	621854	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019745	TTAAT	2	10	629890	629899	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019745	TTTAG	2	10	629912	629921	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019745	ATCTT	2	10	633555	633564	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_019745	ACGAG	2	10	646038	646047	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_019745	AAATG	2	10	646139	646148	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019745	TGAAT	2	10	663194	663203	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019745	AAGAA	2	10	669812	669821	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019745	TCAGT	2	10	677166	677175	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_019745	ATTTT	2	10	683931	683940	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019745	TAGCT	2	10	684380	684389	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_019745	ACTAC	2	10	686162	686171	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_019745	AATAG	2	10	689901	689910	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019745	AGTTT	2	10	690866	690875	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019745	TCGTG	2	10	697739	697748	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_019745	CATTA	2	10	699520	699529	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_019745	TAAAG	2	10	699629	699638	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019745	AGAAA	2	10	703663	703672	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019745	AAAGT	2	10	706504	706513	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019745	TGTTA	2	10	708419	708428	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019745	CATTG	2	10	708666	708675	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_019745	AATGC	2	10	715493	715502	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_019745	TAAAC	2	10	718853	718862	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_019745	AATTT	2	10	727087	727096	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019745	AAGCA	2	10	732133	732142	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_019745	AAACC	2	10	739051	739060	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_019745	AATAT	2	10	744211	744220	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019745	TAAAT	2	10	748334	748343	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019745	TAAAG	2	10	751811	751820	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019745	TCTTT	2	10	752044	752053	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_019745	AGTCA	2	10	758960	758969	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_019745	AGTAA	2	10	761541	761550	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019745	TTAAA	2	10	761561	761570	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019745	TGAAT	2	10	768147	768156	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019745	AAAGC	2	10	785786	785795	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_019745	CAACT	2	10	785948	785957	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_019745	CAATT	2	10	803365	803374	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_019745	AAAGG	2	10	806067	806076	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019745	AAATG	2	10	807115	807124	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019745	CTGCT	2	10	810456	810465	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_019745	TATGA	2	10	813665	813674	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019745	AAAAT	2	10	820396	820405	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019745	TAAAT	2	10	825277	825286	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019745	TAAAA	2	10	827816	827825	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019745	TCATT	2	10	833767	833776	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_019745	TCTCT	2	10	842744	842753	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_019745	TGCAG	2	10	857740	857749	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
146	NC_019745	AATTA	2	10	879007	879016	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019745	TGCAA	2	10	886992	887001	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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162	NC_019745	TTGCT	2	10	977910	977919	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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283	NC_019745	TGATT	2	10	1751564	1751573	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
284	NC_019745	TAAAA	2	10	1751670	1751679	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_019745	GTTTA	3	15	1756004	1756018	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
287	NC_019745	CACAA	2	10	1763324	1763333	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
288	NC_019745	TTAAT	2	10	1774320	1774329	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_019745	GTTTT	2	10	1777294	1777303	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
290	NC_019745	TTTTG	2	10	1778685	1778694	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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393	NC_019745	ATTTG	2	10	2494957	2494966	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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402	NC_019745	CTCAA	2	10	2569752	2569761	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
403	NC_019745	TAGTG	2	10	2583269	2583278	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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408	NC_019745	TTGCC	2	10	2655728	2655737	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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