MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.02

Total Repeats: 306

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019744	TCAC	2	8	834	841	25 %	25 %	0 %	50 %	434389957
2	NC_019744	CAAC	3	12	1612	1623	50 %	0 %	0 %	50 %	434389957
3	NC_019744	TCAA	2	8	1659	1666	50 %	25 %	0 %	25 %	434389957
4	NC_019744	GTTT	2	8	2426	2433	0 %	75 %	25 %	0 %	434389958
5	NC_019744	AATT	2	8	2641	2648	50 %	50 %	0 %	0 %	434389958
6	NC_019744	ATTA	2	8	3833	3840	50 %	50 %	0 %	0 %	434389959
7	NC_019744	ATGA	2	8	4049	4056	50 %	25 %	25 %	0 %	434389959
8	NC_019744	ATTT	2	8	4111	4118	25 %	75 %	0 %	0 %	434389959
9	NC_019744	AATC	2	8	4238	4245	50 %	25 %	0 %	25 %	434389959
10	NC_019744	AATT	2	8	4536	4543	50 %	50 %	0 %	0 %	434389959
11	NC_019744	TTCC	2	8	4557	4564	0 %	50 %	0 %	50 %	434389959
12	NC_019744	TGAT	2	8	5040	5047	25 %	50 %	25 %	0 %	434389959
13	NC_019744	TGTT	2	8	5196	5203	0 %	75 %	25 %	0 %	434389959
14	NC_019744	GACT	2	8	5508	5515	25 %	25 %	25 %	25 %	434389959
15	NC_019744	TAAC	2	8	5902	5909	50 %	25 %	0 %	25 %	434389961
16	NC_019744	TAAT	2	8	6070	6077	50 %	50 %	0 %	0 %	434389961
17	NC_019744	TGTA	2	8	6100	6107	25 %	50 %	25 %	0 %	434389961
18	NC_019744	TAAT	2	8	6459	6466	50 %	50 %	0 %	0 %	434389961
19	NC_019744	ATTG	2	8	6796	6803	25 %	50 %	25 %	0 %	434389961
20	NC_019744	TTGT	2	8	6901	6908	0 %	75 %	25 %	0 %	434389961
21	NC_019744	ATTT	2	8	6919	6926	25 %	75 %	0 %	0 %	434389961
22	NC_019744	TTGT	2	8	7265	7272	0 %	75 %	25 %	0 %	434389961
23	NC_019744	TTAA	2	8	7632	7639	50 %	50 %	0 %	0 %	434389961
24	NC_019744	TTAT	2	8	7869	7876	25 %	75 %	0 %	0 %	434389961
25	NC_019744	GACA	2	8	8107	8114	50 %	0 %	25 %	25 %	434389961
26	NC_019744	TTGA	2	8	8146	8153	25 %	50 %	25 %	0 %	434389961
27	NC_019744	TTTC	2	8	8251	8258	0 %	75 %	0 %	25 %	434389961
28	NC_019744	TCTA	2	8	8291	8298	25 %	50 %	0 %	25 %	434389961
29	NC_019744	TTCT	2	8	8569	8576	0 %	75 %	0 %	25 %	434389962
30	NC_019744	AAAT	2	8	8859	8866	75 %	25 %	0 %	0 %	434389962
31	NC_019744	ATTG	2	8	9006	9013	25 %	50 %	25 %	0 %	434389962
32	NC_019744	TTAA	2	8	9202	9209	50 %	50 %	0 %	0 %	434389962
33	NC_019744	TTTG	2	8	9804	9811	0 %	75 %	25 %	0 %	434389963
34	NC_019744	ACAT	2	8	9919	9926	50 %	25 %	0 %	25 %	434389963
35	NC_019744	CCAC	2	8	10096	10103	25 %	0 %	0 %	75 %	434389963
36	NC_019744	GTGA	2	8	11159	11166	25 %	25 %	50 %	0 %	434389964
37	NC_019744	CAAC	2	8	12773	12780	50 %	0 %	0 %	50 %	434389966
38	NC_019744	TTGA	2	8	13281	13288	25 %	50 %	25 %	0 %	434389967
39	NC_019744	CAAG	2	8	13299	13306	50 %	0 %	25 %	25 %	434389967
40	NC_019744	CAGT	2	8	13963	13970	25 %	25 %	25 %	25 %	434389968
41	NC_019744	GTCC	2	8	14159	14166	0 %	25 %	25 %	50 %	434389968
42	NC_019744	AGTT	2	8	14187	14194	25 %	50 %	25 %	0 %	434389968
43	NC_019744	AACA	2	8	17353	17360	75 %	0 %	0 %	25 %	434389969
44	NC_019744	TCAT	2	8	18159	18166	25 %	50 %	0 %	25 %	434389970
45	NC_019744	CCAA	2	8	19586	19593	50 %	0 %	0 %	50 %	434389972
46	NC_019744	ATTA	2	8	20977	20984	50 %	50 %	0 %	0 %	434389973
47	NC_019744	GCTG	2	8	21445	21452	0 %	25 %	50 %	25 %	434389973
48	NC_019744	CAAA	2	8	21741	21748	75 %	0 %	0 %	25 %	434389974
49	NC_019744	CCAA	2	8	21803	21810	50 %	0 %	0 %	50 %	434389974
50	NC_019744	ATGG	2	8	21839	21846	25 %	25 %	50 %	0 %	434389974
51	NC_019744	GGTT	2	8	22417	22424	0 %	50 %	50 %	0 %	434389974
52	NC_019744	AGTC	2	8	22540	22547	25 %	25 %	25 %	25 %	434389974
53	NC_019744	TCAT	2	8	23128	23135	25 %	50 %	0 %	25 %	434389974
54	NC_019744	CACC	2	8	23279	23286	25 %	0 %	0 %	75 %	434389974
55	NC_019744	TGCC	2	8	23592	23599	0 %	25 %	25 %	50 %	434389974
56	NC_019744	ATTG	2	8	23614	23621	25 %	50 %	25 %	0 %	434389974
57	NC_019744	CCTT	2	8	24173	24180	0 %	50 %	0 %	50 %	434389974
58	NC_019744	AAGC	2	8	24302	24309	50 %	0 %	25 %	25 %	434389974
59	NC_019744	TATC	2	8	24683	24690	25 %	50 %	0 %	25 %	434389974
60	NC_019744	ACCT	2	8	24954	24961	25 %	25 %	0 %	50 %	434389974
61	NC_019744	CAAA	2	8	25069	25076	75 %	0 %	0 %	25 %	434389974
62	NC_019744	CAGG	2	8	25680	25687	25 %	0 %	50 %	25 %	434389974
63	NC_019744	TTTG	2	8	25720	25727	0 %	75 %	25 %	0 %	434389974
64	NC_019744	GAGT	2	8	25926	25933	25 %	25 %	50 %	0 %	434389974
65	NC_019744	ATAG	2	8	25996	26003	50 %	25 %	25 %	0 %	434389974
66	NC_019744	AGAA	2	8	26451	26458	75 %	0 %	25 %	0 %	434389974
67	NC_019744	TAAG	2	8	26774	26781	50 %	25 %	25 %	0 %	434389974
68	NC_019744	CATC	2	8	27629	27636	25 %	25 %	0 %	50 %	434389975
69	NC_019744	GAGC	2	8	27945	27952	25 %	0 %	50 %	25 %	434389975
70	NC_019744	CCGG	2	8	27977	27984	0 %	0 %	50 %	50 %	434389975
71	NC_019744	AAAG	2	8	28143	28150	75 %	0 %	25 %	0 %	434389975
72	NC_019744	GGGC	2	8	28206	28213	0 %	0 %	75 %	25 %	434389975
73	NC_019744	GACC	2	8	28826	28833	25 %	0 %	25 %	50 %	434389976
74	NC_019744	ACTG	2	8	29349	29356	25 %	25 %	25 %	25 %	434389976
75	NC_019744	TCCG	2	8	29793	29800	0 %	25 %	25 %	50 %	434389977
76	NC_019744	TCCT	2	8	29830	29837	0 %	50 %	0 %	50 %	434389977
77	NC_019744	CGCC	3	12	30274	30285	0 %	0 %	25 %	75 %	434389977
78	NC_019744	CGCT	2	8	30396	30403	0 %	25 %	25 %	50 %	434389977
79	NC_019744	CAGA	2	8	30981	30988	50 %	0 %	25 %	25 %	434389978
80	NC_019744	ACTG	2	8	31009	31016	25 %	25 %	25 %	25 %	434389978
81	NC_019744	ATAA	2	8	32464	32471	75 %	25 %	0 %	0 %	434389979
82	NC_019744	TCTT	2	8	33859	33866	0 %	75 %	0 %	25 %	434389981
83	NC_019744	ACTC	2	8	33876	33883	25 %	25 %	0 %	50 %	434389981
84	NC_019744	ACCC	2	8	34761	34768	25 %	0 %	0 %	75 %	434389981
85	NC_019744	AGTA	2	8	35624	35631	50 %	25 %	25 %	0 %	434389982
86	NC_019744	AATG	2	8	35651	35658	50 %	25 %	25 %	0 %	434389982
87	NC_019744	CAAA	2	8	36816	36823	75 %	0 %	0 %	25 %	434389983
88	NC_019744	CATC	2	8	36894	36901	25 %	25 %	0 %	50 %	434389983
89	NC_019744	ATGG	2	8	37454	37461	25 %	25 %	50 %	0 %	434389984
90	NC_019744	ACCA	2	8	37710	37717	50 %	0 %	0 %	50 %	434389984
91	NC_019744	ATTA	2	8	38650	38657	50 %	50 %	0 %	0 %	434389985
92	NC_019744	ACAG	2	8	38773	38780	50 %	0 %	25 %	25 %	434389985
93	NC_019744	GTTA	2	8	39408	39415	25 %	50 %	25 %	0 %	434389986
94	NC_019744	ATTG	2	8	39622	39629	25 %	50 %	25 %	0 %	434389986
95	NC_019744	TGGA	2	8	40561	40568	25 %	25 %	50 %	0 %	434389987
96	NC_019744	CTTC	2	8	40836	40843	0 %	50 %	0 %	50 %	434389987
97	NC_019744	TATT	2	8	40965	40972	25 %	75 %	0 %	0 %	434389987
98	NC_019744	AATG	2	8	41228	41235	50 %	25 %	25 %	0 %	434389987
99	NC_019744	AAAT	2	8	41611	41618	75 %	25 %	0 %	0 %	434389987
100	NC_019744	GAAA	2	8	42924	42931	75 %	0 %	25 %	0 %	434389987
101	NC_019744	ATAA	2	8	43583	43590	75 %	25 %	0 %	0 %	434389987
102	NC_019744	GCTC	2	8	43791	43798	0 %	25 %	25 %	50 %	434389987
103	NC_019744	GTCT	2	8	44133	44140	0 %	50 %	25 %	25 %	434389987
104	NC_019744	GGTA	2	8	44830	44837	25 %	25 %	50 %	0 %	434389987
105	NC_019744	CCAA	2	8	45012	45019	50 %	0 %	0 %	50 %	434389987
106	NC_019744	TTGA	2	8	45524	45531	25 %	50 %	25 %	0 %	434389987
107	NC_019744	AATC	2	8	46760	46767	50 %	25 %	0 %	25 %	434389987
108	NC_019744	AAAG	2	8	47441	47448	75 %	0 %	25 %	0 %	434389988
109	NC_019744	TGTT	2	8	48473	48480	0 %	75 %	25 %	0 %	434389989
110	NC_019744	GATA	2	8	48499	48506	50 %	25 %	25 %	0 %	434389989
111	NC_019744	ATTG	2	8	48820	48827	25 %	50 %	25 %	0 %	434389989
112	NC_019744	GAGC	2	8	50858	50865	25 %	0 %	50 %	25 %	434389991
113	NC_019744	AGCC	2	8	50906	50913	25 %	0 %	25 %	50 %	434389991
114	NC_019744	TGAT	2	8	51146	51153	25 %	50 %	25 %	0 %	434389991
115	NC_019744	AAAT	2	8	51390	51397	75 %	25 %	0 %	0 %	434389992
116	NC_019744	ATCT	2	8	51809	51816	25 %	50 %	0 %	25 %	434389992
117	NC_019744	ATGA	2	8	52030	52037	50 %	25 %	25 %	0 %	434389992
118	NC_019744	GTTA	2	8	52110	52117	25 %	50 %	25 %	0 %	434389992
119	NC_019744	CAGA	2	8	52266	52273	50 %	0 %	25 %	25 %	434389992
120	NC_019744	AAGA	2	8	54644	54651	75 %	0 %	25 %	0 %	434389994
121	NC_019744	CTTG	2	8	56110	56117	0 %	50 %	25 %	25 %	434389996
122	NC_019744	TACC	2	8	56567	56574	25 %	25 %	0 %	50 %	434389996
123	NC_019744	TTCT	2	8	57145	57152	0 %	75 %	0 %	25 %	434389997
124	NC_019744	CTGT	2	8	57286	57293	0 %	50 %	25 %	25 %	434389997
125	NC_019744	TGTT	2	8	57400	57407	0 %	75 %	25 %	0 %	434389997
126	NC_019744	TGTT	2	8	57422	57429	0 %	75 %	25 %	0 %	434389997
127	NC_019744	CATG	2	8	57468	57475	25 %	25 %	25 %	25 %	434389997
128	NC_019744	GGCT	2	8	60154	60161	0 %	25 %	50 %	25 %	434389998
129	NC_019744	GTTT	2	8	61237	61244	0 %	75 %	25 %	0 %	434389998
130	NC_019744	CAAC	2	8	61557	61564	50 %	0 %	0 %	50 %	434389998
131	NC_019744	CGTT	2	8	62163	62170	0 %	50 %	25 %	25 %	434389999
132	NC_019744	AAGC	2	8	62274	62281	50 %	0 %	25 %	25 %	434389999
133	NC_019744	GTCA	2	8	62464	62471	25 %	25 %	25 %	25 %	434389999
134	NC_019744	AAAC	2	8	62623	62630	75 %	0 %	0 %	25 %	434389999
135	NC_019744	GAAA	2	8	62886	62893	75 %	0 %	25 %	0 %	434389999
136	NC_019744	CGAT	2	8	63146	63153	25 %	25 %	25 %	25 %	434389999
137	NC_019744	AAAT	2	8	63198	63205	75 %	25 %	0 %	0 %	434389999
138	NC_019744	GTCA	2	8	63453	63460	25 %	25 %	25 %	25 %	434389999
139	NC_019744	AATC	2	8	64589	64596	50 %	25 %	0 %	25 %	434389999
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.