MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.02

Total Repeats: 2061

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019744	TAA	2	6	25	30	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019744	TCC	2	6	146	151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_019744	CTT	2	6	223	228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019744	CTT	2	6	488	493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019744	TCA	2	6	613	618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389957
6	NC_019744	CAA	2	6	628	633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389957
7	NC_019744	TTG	2	6	638	643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434389957
8	NC_019744	AAC	2	6	660	665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389957
9	NC_019744	ATT	2	6	760	765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389957
10	NC_019744	GCC	2	6	824	829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434389957
11	NC_019744	GTT	2	6	937	942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434389957
12	NC_019744	ATT	2	6	961	966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389957
13	NC_019744	TGC	2	6	967	972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389957
14	NC_019744	ATG	2	6	978	983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389957
15	NC_019744	AGC	3	9	1039	1047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389957
16	NC_019744	TAC	2	6	1273	1278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389957
17	NC_019744	ATT	2	6	1282	1287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389957
18	NC_019744	TTG	2	6	1392	1397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434389957
19	NC_019744	CAA	2	6	1445	1450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389957
20	NC_019744	GGT	2	6	1481	1486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434389957
21	NC_019744	ATT	2	6	1634	1639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389957
22	NC_019744	GCT	2	6	1730	1735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389957
23	NC_019744	GAA	2	6	1751	1756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434389957
24	NC_019744	AGC	2	6	1783	1788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389957
25	NC_019744	CTT	2	6	1794	1799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389957
26	NC_019744	CCT	2	6	1838	1843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434389957
27	NC_019744	ACT	2	6	1982	1987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019744	TTG	2	6	2003	2008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019744	CTA	2	6	2128	2133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389958
30	NC_019744	TGC	2	6	2342	2347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389958
31	NC_019744	ATT	2	6	2379	2384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389958
32	NC_019744	CAT	2	6	2396	2401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389958
33	NC_019744	GAA	2	6	2490	2495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434389958
34	NC_019744	CCA	2	6	2496	2501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389958
35	NC_019744	CAC	2	6	2525	2530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389958
36	NC_019744	CGA	2	6	2551	2556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389958
37	NC_019744	GGA	2	6	2600	2605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434389958
38	NC_019744	ACA	2	6	2612	2617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389958
39	NC_019744	TCT	2	6	2688	2693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389958
40	NC_019744	GTT	2	6	2695	2700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434389958
41	NC_019744	TGG	2	6	2776	2781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434389958
42	NC_019744	TGG	2	6	2812	2817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434389958
43	NC_019744	AAT	2	6	2846	2851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434389958
44	NC_019744	TAT	2	6	2855	2860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389958
45	NC_019744	CAA	2	6	2994	2999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389958
46	NC_019744	GCA	2	6	3042	3047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389958
47	NC_019744	TAC	2	6	3130	3135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389958
48	NC_019744	CTA	2	6	3139	3144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389958
49	NC_019744	CTG	2	6	3211	3216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389958
50	NC_019744	ACA	2	6	3335	3340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389958
51	NC_019744	ATC	2	6	3344	3349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389958
52	NC_019744	ATT	2	6	3462	3467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019744	ATT	2	6	3628	3633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019744	ATT	2	6	3698	3703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019744	ATC	2	6	3843	3848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389959
56	NC_019744	GAT	2	6	3917	3922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389959
57	NC_019744	TCA	2	6	4302	4307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389959
58	NC_019744	TTG	2	6	4459	4464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434389959
59	NC_019744	AGA	2	6	4525	4530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434389959
60	NC_019744	ACA	2	6	4603	4608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389959
61	NC_019744	CGA	2	6	4820	4825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389959
62	NC_019744	AGC	2	6	4900	4905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389959
63	NC_019744	GTT	2	6	4945	4950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434389959
64	NC_019744	GCT	2	6	4994	4999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389959
65	NC_019744	TCT	2	6	5100	5105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389959
66	NC_019744	CTG	2	6	5120	5125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389959
67	NC_019744	TAT	2	6	5227	5232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389959
68	NC_019744	TAC	2	6	5254	5259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389959
69	NC_019744	ACT	2	6	5316	5321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389959
70	NC_019744	TCT	2	6	5332	5337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389959
71	NC_019744	TGT	2	6	5479	5484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434389959
72	NC_019744	TAT	2	6	5540	5545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389959
73	NC_019744	GTT	2	6	5585	5590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434389959
74	NC_019744	ATG	2	6	5649	5654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019744	AGA	2	6	5720	5725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019744	TAT	2	6	5813	5818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389960
77	NC_019744	TAT	2	6	5835	5840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389961
78	NC_019744	AGA	2	6	5879	5884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434389961
79	NC_019744	ATT	2	6	6015	6020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389961
80	NC_019744	TGA	2	6	6027	6032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389961
81	NC_019744	TAG	2	6	6061	6066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389961
82	NC_019744	ACC	2	6	6115	6120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389961
83	NC_019744	ATT	2	6	6128	6133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389961
84	NC_019744	CAC	2	6	6220	6225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389961
85	NC_019744	CTT	2	6	6320	6325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389961
86	NC_019744	ATC	2	6	6359	6364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389961
87	NC_019744	TCA	2	6	6370	6375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389961
88	NC_019744	TTC	2	6	6380	6385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389961
89	NC_019744	CTT	2	6	6469	6474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389961
90	NC_019744	ATT	4	12	6488	6499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389961
91	NC_019744	TCT	2	6	6597	6602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389961
92	NC_019744	ATT	2	6	6618	6623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389961
93	NC_019744	TCT	2	6	6672	6677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389961
94	NC_019744	TAG	2	6	6733	6738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389961
95	NC_019744	ACA	2	6	6816	6821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389961
96	NC_019744	GTT	3	9	6829	6837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434389961
97	NC_019744	TTC	2	6	6851	6856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389961
98	NC_019744	TAA	2	6	6940	6945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434389961
99	NC_019744	TTC	3	9	7073	7081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389961
100	NC_019744	TAT	2	6	7121	7126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389961
101	NC_019744	CAT	2	6	7162	7167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389961
102	NC_019744	TTA	2	6	7215	7220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389961
103	NC_019744	TTC	2	6	7223	7228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389961
104	NC_019744	TTA	2	6	7300	7305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389961
105	NC_019744	CTG	2	6	7374	7379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389961
106	NC_019744	TTG	2	6	7428	7433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434389961
107	NC_019744	AGT	2	6	7502	7507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389961
108	NC_019744	TTA	2	6	7536	7541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389961
109	NC_019744	CTT	2	6	7657	7662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389961
110	NC_019744	ATC	2	6	7799	7804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389961
111	NC_019744	ATC	2	6	7898	7903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389961
112	NC_019744	TAA	2	6	7904	7909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434389961
113	NC_019744	ACC	2	6	7934	7939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389961
114	NC_019744	CTC	2	6	8012	8017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434389961
115	NC_019744	CTT	2	6	8071	8076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389961
116	NC_019744	GTA	2	6	8089	8094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389961
117	NC_019744	TAA	2	6	8159	8164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434389961
118	NC_019744	TTC	2	6	8221	8226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389961
119	NC_019744	CCA	2	6	8234	8239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389961
120	NC_019744	CAT	2	6	8302	8307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389961
121	NC_019744	TAA	2	6	8385	8390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019744	TTG	2	6	8405	8410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019744	TAC	2	6	8529	8534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019744	AAC	2	6	8591	8596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389962
125	NC_019744	CAA	2	6	8617	8622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389962
126	NC_019744	ACC	2	6	8700	8705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389962
127	NC_019744	GGA	2	6	8716	8721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434389962
128	NC_019744	TTG	2	6	8776	8781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434389962
129	NC_019744	CAA	2	6	8813	8818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389962
130	NC_019744	ACT	2	6	8874	8879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389962
131	NC_019744	TGA	2	6	8964	8969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389962
132	NC_019744	CAC	2	6	8985	8990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389962
133	NC_019744	AAT	2	6	9025	9030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434389962
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261	NC_019744	TGA	2	6	17690	17695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389969
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263	NC_019744	CAC	2	6	17950	17955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389970
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265	NC_019744	CGA	2	6	18052	18057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389970
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291	NC_019744	CCA	2	6	19614	19619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389972
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382	NC_019744	GGC	2	6	26514	26519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434389974
383	NC_019744	ATG	2	6	26546	26551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389974
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