MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.02

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019744	CA	3	6	11	16	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_019744	TC	3	6	53	58	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_019744	AT	3	6	277	282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019744	TA	3	6	3477	3482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019744	TG	3	6	15757	15762	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019744	AG	3	6	16018	16023	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019744	TA	3	6	16144	16149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019744	GA	3	6	17854	17859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019744	GA	3	6	26837	26842	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019744	TC	3	6	27245	27250	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_019744	AT	3	6	32013	32018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019744	GA	3	6	32057	32062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019744	AT	3	6	32510	32515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019744	CA	3	6	36171	36176	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_019744	TA	3	6	36209	36214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019744	AT	3	6	39262	39267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019744	CT	3	6	47716	47721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_019744	AT	3	6	50192	50197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019744	AT	3	6	53474	53479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019744	GT	4	8	58957	58964	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019744	CA	3	6	69455	69460	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_019744	TC	3	6	69610	69615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_019744	TG	3	6	73708	73713	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019744	AT	3	6	75379	75384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019744	GA	3	6	76563	76568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019744	AT	3	6	81999	82004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019744	AG	3	6	83020	83025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019744	AG	3	6	84181	84186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019744	GA	3	6	84331	84336	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019744	CT	3	6	84357	84362	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_019744	TA	3	6	87536	87541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019744	GA	3	6	91020	91025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019744	AG	3	6	91568	91573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019744	TC	4	8	92032	92039	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_019744	GA	3	6	92162	92167	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019744	CG	3	6	93578	93583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_019744	TG	3	6	95701	95706	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019744	AG	4	8	97238	97245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019744	TA	3	6	97394	97399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019744	TG	3	6	99504	99509	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019744	AC	3	6	102531	102536	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_019744	AT	3	6	102620	102625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019744	CA	3	6	107890	107895	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_019744	TG	3	6	108054	108059	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019744	CA	3	6	112632	112637	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_019744	GA	3	6	113624	113629	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019744	AT	4	8	113916	113923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019744	AG	3	6	118286	118291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019744	AG	3	6	126403	126408	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019744	AT	3	6	126410	126415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019744	AT	3	6	127363	127368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019744	AG	3	6	129956	129961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019744	CA	3	6	130080	130085	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_019744	TA	3	6	135849	135854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019744	GC	3	6	138725	138730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_019744	AG	3	6	153913	153918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019744	GT	3	6	153919	153924	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.