MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.02

Total Repeats: 128

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019744	TC	3	6	2235	2240	0 %	50 %	0 %	50 %	434389958
2	NC_019744	GT	3	6	5094	5099	0 %	50 %	50 %	0 %	434389959
3	NC_019744	TC	4	8	6255	6262	0 %	50 %	0 %	50 %	434389961
4	NC_019744	TA	3	6	6440	6445	50 %	50 %	0 %	0 %	434389961
5	NC_019744	AT	3	6	7556	7561	50 %	50 %	0 %	0 %	434389961
6	NC_019744	GT	3	6	7671	7676	0 %	50 %	50 %	0 %	434389961
7	NC_019744	AG	3	6	8022	8027	50 %	0 %	50 %	0 %	434389961
8	NC_019744	AT	4	8	8096	8103	50 %	50 %	0 %	0 %	434389961
9	NC_019744	AC	3	6	9778	9783	50 %	0 %	0 %	50 %	434389963
10	NC_019744	CT	3	6	10554	10559	0 %	50 %	0 %	50 %	434389963
11	NC_019744	TC	3	6	11649	11654	0 %	50 %	0 %	50 %	434389964
12	NC_019744	GA	3	6	17078	17083	50 %	0 %	50 %	0 %	434389969
13	NC_019744	TC	3	6	17727	17732	0 %	50 %	0 %	50 %	434389969
14	NC_019744	AT	3	6	18966	18971	50 %	50 %	0 %	0 %	434389972
15	NC_019744	AT	3	6	21525	21530	50 %	50 %	0 %	0 %	434389973
16	NC_019744	GA	3	6	22344	22349	50 %	0 %	50 %	0 %	434389974
17	NC_019744	CT	3	6	22802	22807	0 %	50 %	0 %	50 %	434389974
18	NC_019744	TC	3	6	23320	23325	0 %	50 %	0 %	50 %	434389974
19	NC_019744	AC	3	6	24041	24046	50 %	0 %	0 %	50 %	434389974
20	NC_019744	CT	3	6	25896	25901	0 %	50 %	0 %	50 %	434389974
21	NC_019744	CA	3	6	26396	26401	50 %	0 %	0 %	50 %	434389974
22	NC_019744	AG	3	6	27813	27818	50 %	0 %	50 %	0 %	434389975
23	NC_019744	CG	3	6	29824	29829	0 %	0 %	50 %	50 %	434389977
24	NC_019744	GC	3	6	30301	30306	0 %	0 %	50 %	50 %	434389977
25	NC_019744	CG	3	6	31570	31575	0 %	0 %	50 %	50 %	434389978
26	NC_019744	CA	3	6	33907	33912	50 %	0 %	0 %	50 %	434389981
27	NC_019744	TC	3	6	37249	37254	0 %	50 %	0 %	50 %	434389984
28	NC_019744	CG	3	6	38117	38122	0 %	0 %	50 %	50 %	434389984
29	NC_019744	GA	3	6	39482	39487	50 %	0 %	50 %	0 %	434389986
30	NC_019744	GA	3	6	39725	39730	50 %	0 %	50 %	0 %	434389986
31	NC_019744	AC	3	6	40081	40086	50 %	0 %	0 %	50 %	434389987
32	NC_019744	TA	4	8	41082	41089	50 %	50 %	0 %	0 %	434389987
33	NC_019744	AT	4	8	42042	42049	50 %	50 %	0 %	0 %	434389987
34	NC_019744	AT	3	6	42214	42219	50 %	50 %	0 %	0 %	434389987
35	NC_019744	AG	3	6	43307	43312	50 %	0 %	50 %	0 %	434389987
36	NC_019744	TC	3	6	43809	43814	0 %	50 %	0 %	50 %	434389987
37	NC_019744	AC	3	6	46113	46118	50 %	0 %	0 %	50 %	434389987
38	NC_019744	AC	3	6	46155	46160	50 %	0 %	0 %	50 %	434389987
39	NC_019744	GA	3	6	48466	48471	50 %	0 %	50 %	0 %	434389989
40	NC_019744	TC	3	6	48523	48528	0 %	50 %	0 %	50 %	434389989
41	NC_019744	AT	3	6	48906	48911	50 %	50 %	0 %	0 %	434389989
42	NC_019744	GT	3	6	50633	50638	0 %	50 %	50 %	0 %	434389991
43	NC_019744	AC	3	6	50719	50724	50 %	0 %	0 %	50 %	434389991
44	NC_019744	GA	4	8	50789	50796	50 %	0 %	50 %	0 %	434389991
45	NC_019744	CT	3	6	50844	50849	0 %	50 %	0 %	50 %	434389991
46	NC_019744	CG	3	6	51471	51476	0 %	0 %	50 %	50 %	434389992
47	NC_019744	AG	3	6	54924	54929	50 %	0 %	50 %	0 %	434389994
48	NC_019744	TA	3	6	55871	55876	50 %	50 %	0 %	0 %	434389996
49	NC_019744	TC	3	6	56071	56076	0 %	50 %	0 %	50 %	434389996
50	NC_019744	AT	3	6	57296	57301	50 %	50 %	0 %	0 %	434389997
51	NC_019744	TC	3	6	61946	61951	0 %	50 %	0 %	50 %	434389999
52	NC_019744	TG	3	6	64221	64226	0 %	50 %	50 %	0 %	434389999
53	NC_019744	CT	3	6	66060	66065	0 %	50 %	0 %	50 %	434390000
54	NC_019744	TA	3	6	66747	66752	50 %	50 %	0 %	0 %	434390001
55	NC_019744	GT	3	6	68359	68364	0 %	50 %	50 %	0 %	434390003
56	NC_019744	GA	3	6	69886	69891	50 %	0 %	50 %	0 %	434390004
57	NC_019744	AT	3	6	69958	69963	50 %	50 %	0 %	0 %	434390004
58	NC_019744	GT	3	6	71673	71678	0 %	50 %	50 %	0 %	434390006
59	NC_019744	AT	3	6	74120	74125	50 %	50 %	0 %	0 %	434390008
60	NC_019744	TG	3	6	74235	74240	0 %	50 %	50 %	0 %	434390008
61	NC_019744	TG	3	6	74326	74331	0 %	50 %	50 %	0 %	434390008
62	NC_019744	GT	4	8	74419	74426	0 %	50 %	50 %	0 %	434390008
63	NC_019744	CA	3	6	76866	76871	50 %	0 %	0 %	50 %	434390010
64	NC_019744	AT	3	6	77305	77310	50 %	50 %	0 %	0 %	434390010
65	NC_019744	CT	3	6	78148	78153	0 %	50 %	0 %	50 %	434390010
66	NC_019744	TG	3	6	78248	78253	0 %	50 %	50 %	0 %	434390010
67	NC_019744	TC	3	6	79193	79198	0 %	50 %	0 %	50 %	434390010
68	NC_019744	AC	3	6	88837	88842	50 %	0 %	0 %	50 %	434390019
69	NC_019744	TA	3	6	91269	91274	50 %	50 %	0 %	0 %	434390021
70	NC_019744	GA	3	6	91295	91300	50 %	0 %	50 %	0 %	434390021
71	NC_019744	AT	3	6	93996	94001	50 %	50 %	0 %	0 %	434390022
72	NC_019744	GA	3	6	96064	96069	50 %	0 %	50 %	0 %	434390025
73	NC_019744	TC	3	6	96213	96218	0 %	50 %	0 %	50 %	434390025
74	NC_019744	AT	3	6	96893	96898	50 %	50 %	0 %	0 %	434390025
75	NC_019744	TG	3	6	97919	97924	0 %	50 %	50 %	0 %	434390026
76	NC_019744	TG	3	6	100569	100574	0 %	50 %	50 %	0 %	434390029
77	NC_019744	GA	3	6	100783	100788	50 %	0 %	50 %	0 %	434390029
78	NC_019744	AC	3	6	101527	101532	50 %	0 %	0 %	50 %	434390029
79	NC_019744	CA	3	6	102733	102738	50 %	0 %	0 %	50 %	434390031
80	NC_019744	TA	3	6	103446	103451	50 %	50 %	0 %	0 %	434390031
81	NC_019744	AG	3	6	104284	104289	50 %	0 %	50 %	0 %	434390033
82	NC_019744	TC	3	6	106221	106226	0 %	50 %	0 %	50 %	434390034
83	NC_019744	CA	3	6	106346	106351	50 %	0 %	0 %	50 %	434390034
84	NC_019744	CT	3	6	109100	109105	0 %	50 %	0 %	50 %	434390035
85	NC_019744	AG	3	6	110016	110021	50 %	0 %	50 %	0 %	434390037
86	NC_019744	CG	3	6	113187	113192	0 %	0 %	50 %	50 %	434390039
87	NC_019744	CG	3	6	113230	113235	0 %	0 %	50 %	50 %	434390039
88	NC_019744	CG	3	6	113287	113292	0 %	0 %	50 %	50 %	434390039
89	NC_019744	TG	3	6	113367	113372	0 %	50 %	50 %	0 %	434390039
90	NC_019744	GA	4	8	114591	114598	50 %	0 %	50 %	0 %	434390040
91	NC_019744	TA	3	6	115600	115605	50 %	50 %	0 %	0 %	434390041
92	NC_019744	AT	3	6	116626	116631	50 %	50 %	0 %	0 %	434390041
93	NC_019744	AT	3	6	119434	119439	50 %	50 %	0 %	0 %	434390044
94	NC_019744	GA	3	6	119553	119558	50 %	0 %	50 %	0 %	434390044
95	NC_019744	TG	3	6	120784	120789	0 %	50 %	50 %	0 %	434390044
96	NC_019744	CA	3	6	122308	122313	50 %	0 %	0 %	50 %	434390047
97	NC_019744	AT	3	6	122455	122460	50 %	50 %	0 %	0 %	434390047
98	NC_019744	GC	3	6	122668	122673	0 %	0 %	50 %	50 %	434390047
99	NC_019744	TC	4	8	125685	125692	0 %	50 %	0 %	50 %	434390049
100	NC_019744	CT	3	6	127998	128003	0 %	50 %	0 %	50 %	434390051
101	NC_019744	AT	3	6	128034	128039	50 %	50 %	0 %	0 %	434390051
102	NC_019744	TA	3	6	128056	128061	50 %	50 %	0 %	0 %	434390051
103	NC_019744	TC	3	6	128975	128980	0 %	50 %	0 %	50 %	434390052
104	NC_019744	GA	3	6	131176	131181	50 %	0 %	50 %	0 %	434390053
105	NC_019744	AG	4	8	132672	132679	50 %	0 %	50 %	0 %	434390054
106	NC_019744	AT	3	6	132952	132957	50 %	50 %	0 %	0 %	434390055
107	NC_019744	TG	3	6	133831	133836	0 %	50 %	50 %	0 %	434390055
108	NC_019744	TC	3	6	134151	134156	0 %	50 %	0 %	50 %	434390056
109	NC_019744	CT	3	6	134328	134333	0 %	50 %	0 %	50 %	434390056
110	NC_019744	GA	3	6	137429	137434	50 %	0 %	50 %	0 %	434390057
111	NC_019744	AG	3	6	138272	138277	50 %	0 %	50 %	0 %	434390057
112	NC_019744	GA	4	8	138348	138355	50 %	0 %	50 %	0 %	434390057
113	NC_019744	TC	3	6	140188	140193	0 %	50 %	0 %	50 %	434390059
114	NC_019744	AT	3	6	140245	140250	50 %	50 %	0 %	0 %	434390059
115	NC_019744	GA	3	6	140922	140927	50 %	0 %	50 %	0 %	434390060
116	NC_019744	CA	3	6	141820	141825	50 %	0 %	0 %	50 %	434390061
117	NC_019744	GT	3	6	142783	142788	0 %	50 %	50 %	0 %	434390062
118	NC_019744	CG	3	6	144283	144288	0 %	0 %	50 %	50 %	434390062
119	NC_019744	CA	3	6	144361	144366	50 %	0 %	0 %	50 %	434390062
120	NC_019744	CT	3	6	144765	144770	0 %	50 %	0 %	50 %	434390062
121	NC_019744	GA	3	6	144775	144780	50 %	0 %	50 %	0 %	434390062
122	NC_019744	TC	3	6	146648	146653	0 %	50 %	0 %	50 %	434390064
123	NC_019744	CA	3	6	146780	146785	50 %	0 %	0 %	50 %	434390064
124	NC_019744	TA	3	6	147105	147110	50 %	50 %	0 %	0 %	434390064
125	NC_019744	GA	3	6	150419	150424	50 %	0 %	50 %	0 %	434390067
126	NC_019744	CA	3	6	152049	152054	50 %	0 %	0 %	50 %	434390070
127	NC_019744	AT	3	6	152716	152721	50 %	50 %	0 %	0 %	434390070
128	NC_019744	TC	3	6	152816	152821	0 %	50 %	0 %	50 %	434390070

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.