MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.08

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019743	TTTG	2	8	1	8	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019743	TTGT	2	8	25	32	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019743	GTTG	2	8	272	279	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019743	CTAT	2	8	439	446	25 %	50 %	0 %	25 %	428314711
5	NC_019743	AGCC	2	8	575	582	25 %	0 %	25 %	50 %	428314711
6	NC_019743	TTGA	2	8	729	736	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019743	TCAC	2	8	825	832	25 %	25 %	0 %	50 %	428314712
8	NC_019743	TAAA	2	8	1221	1228	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019743	GCTT	2	8	1500	1507	0 %	50 %	25 %	25 %	428314713
10	NC_019743	TCAA	2	8	1793	1800	50 %	25 %	0 %	25 %	428314714
11	NC_019743	TGGT	2	8	1818	1825	0 %	50 %	50 %	0 %	428314714
12	NC_019743	GAGT	2	8	2355	2362	25 %	25 %	50 %	0 %	428314714
13	NC_019743	TGAT	2	8	2610	2617	25 %	50 %	25 %	0 %	428314715
14	NC_019743	CTCA	2	8	2650	2657	25 %	25 %	0 %	50 %	428314715
15	NC_019743	TGAG	2	8	2767	2774	25 %	25 %	50 %	0 %	428314715
16	NC_019743	TCAA	2	8	3280	3287	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_019743	ACTT	2	8	4135	4142	25 %	50 %	0 %	25 %	428314716
18	NC_019743	ATCA	2	8	4722	4729	50 %	25 %	0 %	25 %	428314717
19	NC_019743	ATTC	2	8	5439	5446	25 %	50 %	0 %	25 %	428314718
20	NC_019743	ATCA	2	8	6561	6568	50 %	25 %	0 %	25 %	428314719
21	NC_019743	CAAC	2	8	7205	7212	50 %	0 %	0 %	50 %	428314719
22	NC_019743	TTAA	2	8	7278	7285	50 %	50 %	0 %	0 %	428314719
23	NC_019743	CAAC	2	8	7405	7412	50 %	0 %	0 %	50 %	428314719
24	NC_019743	GCAA	2	8	7734	7741	50 %	0 %	25 %	25 %	428314720
25	NC_019743	CCAA	2	8	8588	8595	50 %	0 %	0 %	50 %	428314721
26	NC_019743	AGTA	2	8	8787	8794	50 %	25 %	25 %	0 %	428314721
27	NC_019743	AATC	2	8	8869	8876	50 %	25 %	0 %	25 %	428314722
28	NC_019743	TAAA	2	8	9027	9034	75 %	25 %	0 %	0 %	428314722
29	NC_019743	ATGT	2	8	9677	9684	25 %	50 %	25 %	0 %	428314722
30	NC_019743	TTAA	2	8	9785	9792	50 %	50 %	0 %	0 %	428314722
31	NC_019743	TTTG	2	8	9846	9853	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019743	CTAG	2	8	10804	10811	25 %	25 %	25 %	25 %	428314724
33	NC_019743	AACT	2	8	11294	11301	50 %	25 %	0 %	25 %	428314725
34	NC_019743	TTGA	2	8	11885	11892	25 %	50 %	25 %	0 %	428314726
35	NC_019743	TCGG	2	8	12076	12083	0 %	25 %	50 %	25 %	428314726
36	NC_019743	TACT	2	8	12121	12128	25 %	50 %	0 %	25 %	428314726
37	NC_019743	AGCA	2	8	12672	12679	50 %	0 %	25 %	25 %	428314727
38	NC_019743	GTTC	2	8	13142	13149	0 %	50 %	25 %	25 %	428314728
39	NC_019743	GGAG	2	8	13155	13162	25 %	0 %	75 %	0 %	428314728
40	NC_019743	TATT	2	8	13240	13247	25 %	75 %	0 %	0 %	428314728
41	NC_019743	GCAA	2	8	13361	13368	50 %	0 %	25 %	25 %	428314728
42	NC_019743	CGAA	2	8	13542	13549	50 %	0 %	25 %	25 %	428314728
43	NC_019743	TGAT	2	8	13707	13714	25 %	50 %	25 %	0 %	428314728
44	NC_019743	ACTT	2	8	14002	14009	25 %	50 %	0 %	25 %	428314729
45	NC_019743	GGAA	2	8	14027	14034	50 %	0 %	50 %	0 %	428314729
46	NC_019743	CAGA	2	8	14579	14586	50 %	0 %	25 %	25 %	428314730
47	NC_019743	CGAT	2	8	15494	15501	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_019743	CAGT	2	8	15520	15527	25 %	25 %	25 %	25 %	428314731
49	NC_019743	TCGT	2	8	15725	15732	0 %	50 %	25 %	25 %	428314731
50	NC_019743	GGGT	2	8	15963	15970	0 %	25 %	75 %	0 %	428314731
51	NC_019743	ATAG	2	8	16084	16091	50 %	25 %	25 %	0 %	428314732
52	NC_019743	TTCC	2	8	16208	16215	0 %	50 %	0 %	50 %	428314732
53	NC_019743	TGAA	2	8	16813	16820	50 %	25 %	25 %	0 %	428314733
54	NC_019743	CAAC	2	8	16871	16878	50 %	0 %	0 %	50 %	428314733
55	NC_019743	TGGC	2	8	16966	16973	0 %	25 %	50 %	25 %	428314733
56	NC_019743	CTTC	2	8	17008	17015	0 %	50 %	0 %	50 %	428314733
57	NC_019743	TTCC	2	8	17258	17265	0 %	50 %	0 %	50 %	428314733
58	NC_019743	GTTG	2	8	17302	17309	0 %	50 %	50 %	0 %	428314733
59	NC_019743	GAAG	2	8	17775	17782	50 %	0 %	50 %	0 %	428314734
60	NC_019743	AGAA	2	8	18463	18470	75 %	0 %	25 %	0 %	428314735
61	NC_019743	GTCT	2	8	18498	18505	0 %	50 %	25 %	25 %	428314735
62	NC_019743	GTTG	2	8	18681	18688	0 %	50 %	50 %	0 %	428314735
63	NC_019743	GTTG	3	12	19035	19046	0 %	50 %	50 %	0 %	428314735
64	NC_019743	TGTT	2	8	19233	19240	0 %	75 %	25 %	0 %	428314736
65	NC_019743	GTTT	2	8	19351	19358	0 %	75 %	25 %	0 %	428314736
66	NC_019743	CTGA	2	8	19514	19521	25 %	25 %	25 %	25 %	428314736
67	NC_019743	ATCG	2	8	19750	19757	25 %	25 %	25 %	25 %	428314736
68	NC_019743	TGAG	2	8	20093	20100	25 %	25 %	50 %	0 %	428314737
69	NC_019743	CGGT	2	8	20269	20276	0 %	25 %	50 %	25 %	428314737
70	NC_019743	TAAG	2	8	20302	20309	50 %	25 %	25 %	0 %	428314737
71	NC_019743	GATT	2	8	20553	20560	25 %	50 %	25 %	0 %	428314738
72	NC_019743	TTCG	2	8	20748	20755	0 %	50 %	25 %	25 %	428314739

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.