MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.06

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019742	TCGAG	2	10	578	587	20 %	20 %	40 %	20 %	428314513
2	NC_019742	ACCAA	2	10	2683	2692	60 %	0 %	0 %	40 %	428314515
3	NC_019742	AAAGA	2	10	3147	3156	80 %	0 %	20 %	0 %	428314515
4	NC_019742	GAACC	2	10	3645	3654	40 %	0 %	20 %	40 %	428314515
5	NC_019742	CAATG	2	10	6032	6041	40 %	20 %	20 %	20 %	428314517
6	NC_019742	TTGAC	2	10	7588	7597	20 %	40 %	20 %	20 %	428314519
7	NC_019742	TGGCT	2	10	10671	10680	0 %	40 %	40 %	20 %	428314524
8	NC_019742	AGACA	2	10	13334	13343	60 %	0 %	20 %	20 %	428314529
9	NC_019742	GGCAG	2	10	13980	13989	20 %	0 %	60 %	20 %	428314530
10	NC_019742	ATTCA	2	10	14455	14464	40 %	40 %	0 %	20 %	428314531
11	NC_019742	TGAAA	2	10	15792	15801	60 %	20 %	20 %	0 %	428314531
12	NC_019742	GAAGC	2	10	16795	16804	40 %	0 %	40 %	20 %	428314531
13	NC_019742	ACCCA	2	10	17926	17935	40 %	0 %	0 %	60 %	428314533
14	NC_019742	TTCCG	2	10	17968	17977	0 %	40 %	20 %	40 %	428314533
15	NC_019742	TTTTC	2	10	18381	18390	0 %	80 %	0 %	20 %	428314533
16	NC_019742	CGTTT	2	10	18448	18457	0 %	60 %	20 %	20 %	428314533
17	NC_019742	ACCTG	2	10	18607	18616	20 %	20 %	20 %	40 %	428314533
18	NC_019742	AACCG	2	10	20520	20529	40 %	0 %	20 %	40 %	428314537
19	NC_019742	TGACT	2	10	21105	21114	20 %	40 %	20 %	20 %	428314538
20	NC_019742	TGCAG	2	10	21129	21138	20 %	20 %	40 %	20 %	428314538
21	NC_019742	CAAGA	2	10	21560	21569	60 %	0 %	20 %	20 %	428314538
22	NC_019742	TAGAT	2	10	25140	25149	40 %	40 %	20 %	0 %	428314541
23	NC_019742	GTTTG	2	10	25200	25209	0 %	60 %	40 %	0 %	428314541
24	NC_019742	CCAAG	2	10	27312	27321	40 %	0 %	20 %	40 %	428314542

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.