MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.06

Total Repeats: 310

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019742	GAT	3	9	340	348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314512
2	NC_019742	TGA	2	6	417	422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314512
3	NC_019742	ATT	2	6	473	478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314513
4	NC_019742	ATC	2	6	487	492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314513
5	NC_019742	GCA	2	6	734	739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314513
6	NC_019742	TAA	2	6	772	777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314513
7	NC_019742	AGA	3	9	996	1004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314514
8	NC_019742	CAT	2	6	1054	1059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314514
9	NC_019742	ACA	2	6	1336	1341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314514
10	NC_019742	AGA	2	6	1353	1358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314514
11	NC_019742	TTA	2	6	1502	1507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314514
12	NC_019742	TTC	2	6	1563	1568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314514
13	NC_019742	GAT	2	6	1585	1590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314514
14	NC_019742	TTA	2	6	1668	1673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314514
15	NC_019742	CTT	2	6	1796	1801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314515
16	NC_019742	TGC	2	6	1846	1851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314515
17	NC_019742	CAA	2	6	1917	1922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314515
18	NC_019742	GAA	2	6	2085	2090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314515
19	NC_019742	CAA	2	6	2183	2188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314515
20	NC_019742	AAC	2	6	2296	2301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314515
21	NC_019742	GCT	2	6	2363	2368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314515
22	NC_019742	AAG	2	6	2473	2478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314515
23	NC_019742	GCT	2	6	2635	2640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314515
24	NC_019742	CCG	2	6	2699	2704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314515
25	NC_019742	CTG	2	6	2793	2798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314515
26	NC_019742	GAA	2	6	2862	2867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314515
27	NC_019742	CGC	2	6	3003	3008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314515
28	NC_019742	AAC	2	6	3010	3015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314515
29	NC_019742	GTG	2	6	3054	3059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314515
30	NC_019742	CAC	2	6	3072	3077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314515
31	NC_019742	ACG	2	6	3080	3085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314515
32	NC_019742	TGC	2	6	3169	3174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314515
33	NC_019742	ATT	2	6	3274	3279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314515
34	NC_019742	GCA	2	6	3326	3331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314515
35	NC_019742	GCG	2	6	3355	3360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314515
36	NC_019742	GCA	2	6	3380	3385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314515
37	NC_019742	CGA	2	6	3479	3484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314515
38	NC_019742	ACC	2	6	3495	3500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314515
39	NC_019742	CTC	2	6	3526	3531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314515
40	NC_019742	TAT	2	6	3576	3581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314515
41	NC_019742	CTT	2	6	3740	3745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314515
42	NC_019742	CGC	2	6	3807	3812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314515
43	NC_019742	CTA	2	6	3822	3827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314515
44	NC_019742	GCA	2	6	3838	3843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314515
45	NC_019742	GAT	2	6	3855	3860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314515
46	NC_019742	GAT	2	6	3882	3887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314515
47	NC_019742	TAC	2	6	3958	3963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314515
48	NC_019742	ATT	2	6	4050	4055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314515
49	NC_019742	CGG	2	6	4142	4147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314515
50	NC_019742	GTG	2	6	4169	4174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314515
51	NC_019742	CTG	2	6	4230	4235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314515
52	NC_019742	AGC	2	6	4324	4329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314515
53	NC_019742	CTA	2	6	4388	4393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314515
54	NC_019742	GTC	2	6	4458	4463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314515
55	NC_019742	AAG	2	6	4534	4539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314515
56	NC_019742	CGA	2	6	4562	4567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314515
57	NC_019742	AGA	2	6	4601	4606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314515
58	NC_019742	TGG	2	6	4609	4614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314515
59	NC_019742	CAA	2	6	4708	4713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314515
60	NC_019742	TGA	2	6	4817	4822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314515
61	NC_019742	TGA	2	6	4840	4845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314515
62	NC_019742	ATT	2	6	4859	4864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314515
63	NC_019742	GAG	2	6	4866	4871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314515
64	NC_019742	ATT	2	6	5349	5354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314516
65	NC_019742	ACC	2	6	5488	5493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314516
66	NC_019742	CTT	2	6	5580	5585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314516
67	NC_019742	GGT	2	6	5664	5669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314516
68	NC_019742	GAA	2	6	5814	5819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314516
69	NC_019742	ATG	2	6	6264	6269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314518
70	NC_019742	CTT	2	6	6345	6350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314518
71	NC_019742	TTA	2	6	6455	6460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314518
72	NC_019742	TCG	2	6	6783	6788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314519
73	NC_019742	ATC	2	6	6816	6821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314519
74	NC_019742	AGA	2	6	6891	6896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314519
75	NC_019742	GGT	2	6	7109	7114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314519
76	NC_019742	AGG	2	6	7124	7129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314519
77	NC_019742	AGT	2	6	7139	7144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314519
78	NC_019742	GTT	2	6	7279	7284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314519
79	NC_019742	TCG	2	6	7332	7337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314519
80	NC_019742	ATA	2	6	7512	7517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314519
81	NC_019742	TCA	2	6	7522	7527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314519
82	NC_019742	CTA	2	6	7624	7629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314519
83	NC_019742	CTT	3	9	7775	7783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314519
84	NC_019742	GGT	2	6	7838	7843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314519
85	NC_019742	CTG	2	6	7957	7962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314519
86	NC_019742	CCA	2	6	8044	8049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314519
87	NC_019742	GCG	2	6	8087	8092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314519
88	NC_019742	CCT	2	6	8331	8336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314519
89	NC_019742	CAC	2	6	8486	8491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314519
90	NC_019742	AAT	2	6	8893	8898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314520
91	NC_019742	CAG	2	6	8902	8907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314520
92	NC_019742	ACG	2	6	9116	9121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314520
93	NC_019742	GCC	2	6	9125	9130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314520
94	NC_019742	AGG	2	6	9184	9189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314520
95	NC_019742	AAT	2	6	9355	9360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314520
96	NC_019742	TTC	2	6	9409	9414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314520
97	NC_019742	TAG	2	6	9432	9437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314520
98	NC_019742	GTA	2	6	9491	9496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314521
99	NC_019742	TAT	2	6	9610	9615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314521
100	NC_019742	GGC	2	6	9692	9697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314521
101	NC_019742	GCA	2	6	9753	9758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314521
102	NC_019742	GTC	2	6	9966	9971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314522
103	NC_019742	GTC	2	6	10092	10097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314522
104	NC_019742	CGA	2	6	10271	10276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314523
105	NC_019742	CCT	2	6	10363	10368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314524
106	NC_019742	CCA	2	6	10388	10393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314524
107	NC_019742	CCA	2	6	10454	10459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314524
108	NC_019742	TCG	2	6	10553	10558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314524
109	NC_019742	TTC	2	6	10632	10637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314524
110	NC_019742	ATG	2	6	10699	10704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314524
111	NC_019742	CAG	2	6	10819	10824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314525
112	NC_019742	ATG	2	6	10855	10860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314525
113	NC_019742	CAC	2	6	11200	11205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314526
114	NC_019742	TGG	2	6	11206	11211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314526
115	NC_019742	CGG	2	6	11212	11217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314526
116	NC_019742	AAC	2	6	11356	11361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314526
117	NC_019742	CCA	2	6	11493	11498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314527
118	NC_019742	ACC	2	6	11499	11504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314527
119	NC_019742	TGC	2	6	11529	11534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314527
120	NC_019742	ATG	2	6	11658	11663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314527
121	NC_019742	CTT	2	6	11698	11703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314527
122	NC_019742	CTG	2	6	11720	11725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314527
123	NC_019742	TTC	2	6	11835	11840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314527
124	NC_019742	GAA	2	6	11855	11860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314527
125	NC_019742	CCG	2	6	11992	11997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314527
126	NC_019742	TTG	2	6	12057	12062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314527
127	NC_019742	CAA	2	6	12166	12171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314527
128	NC_019742	CTT	2	6	12247	12252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314527
129	NC_019742	GAT	2	6	12266	12271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314527
130	NC_019742	GAA	2	6	12626	12631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314528
131	NC_019742	ACT	2	6	12649	12654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314528
132	NC_019742	GAC	2	6	12674	12679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314528
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155	NC_019742	CTG	2	6	15295	15300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314531
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.