MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.05

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019741	CAAAA	2	10	494	503	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_019741	CTGTT	2	10	2276	2285	0 %	60 %	20 %	20 %	428314672
3	NC_019741	GTTCA	2	10	2399	2408	20 %	40 %	20 %	20 %	428314672
4	NC_019741	GGTTG	2	10	5378	5387	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019741	CACAC	2	10	7632	7641	40 %	0 %	0 %	60 %	428314676
6	NC_019741	ATTTC	2	10	8153	8162	20 %	60 %	0 %	20 %	428314677
7	NC_019741	GGGTT	2	10	8549	8558	0 %	40 %	60 %	0 %	428314677
8	NC_019741	GATTC	2	10	8795	8804	20 %	40 %	20 %	20 %	428314678
9	NC_019741	ACTGG	2	10	9017	9026	20 %	20 %	40 %	20 %	428314678
10	NC_019741	GAACG	2	10	12798	12807	40 %	0 %	40 %	20 %	428314681
11	NC_019741	TCCCT	2	10	13233	13242	0 %	40 %	0 %	60 %	428314682
12	NC_019741	TGTTT	2	10	13336	13345	0 %	80 %	20 %	0 %	428314682
13	NC_019741	AAAAT	2	10	13584	13593	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019741	AACTC	2	10	13707	13716	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_019741	TTGAC	2	10	15254	15263	20 %	40 %	20 %	20 %	428314684
16	NC_019741	CAACT	2	10	16390	16399	40 %	20 %	0 %	40 %	428314684
17	NC_019741	CCAAT	2	10	20182	20191	40 %	20 %	0 %	40 %	428314689
18	NC_019741	CCAAC	2	10	20834	20843	40 %	0 %	0 %	60 %	428314691
19	NC_019741	CCCAA	2	10	21643	21652	40 %	0 %	0 %	60 %	428314694
20	NC_019741	CTTGG	2	10	24690	24699	0 %	40 %	40 %	20 %	428314697
21	NC_019741	TATGT	2	10	25533	25542	20 %	60 %	20 %	0 %	428314698
22	NC_019741	GAATG	2	10	27872	27881	40 %	20 %	40 %	0 %	428314701
23	NC_019741	GTAAC	2	10	28050	28059	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_019741	GTGCG	2	10	28680	28689	0 %	20 %	60 %	20 %	428314702
25	NC_019741	TGAGT	2	10	30494	30503	20 %	40 %	40 %	0 %	428314705
26	NC_019741	AGCCA	2	10	31648	31657	40 %	0 %	20 %	40 %	428314706
27	NC_019741	AGAAA	2	10	32393	32402	80 %	0 %	20 %	0 %	428314707
28	NC_019741	ATTTT	2	10	32653	32662	20 %	80 %	0 %	0 %	428314707
29	NC_019741	ACTGG	2	10	35743	35752	20 %	20 %	40 %	20 %	428314708
30	NC_019741	ATTTT	2	10	35939	35948	20 %	80 %	0 %	0 %	428314709
31	NC_019741	GTGAT	2	10	36873	36882	20 %	40 %	40 %	0 %	428314709

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.