MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.03

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019740	AGAGG	2	10	143	152	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019740	CTTCA	2	10	649	658	20 %	40 %	0 %	40 %	428314594
3	NC_019740	CGAGA	2	10	736	745	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_019740	GCGAT	2	10	849	858	20 %	20 %	40 %	20 %	428314595
5	NC_019740	GCTGG	2	10	1244	1253	0 %	20 %	60 %	20 %	428314596
6	NC_019740	TGCTT	2	10	4267	4276	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_019740	ATTGG	2	10	5208	5217	20 %	40 %	40 %	0 %	428314603
8	NC_019740	GTTTT	2	10	7490	7499	0 %	80 %	20 %	0 %	428314603
9	NC_019740	GCGTT	2	10	7605	7614	0 %	40 %	40 %	20 %	428314603
10	NC_019740	CTTGA	2	10	7949	7958	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_019740	ACCCT	2	10	8230	8239	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
12	NC_019740	TTAAG	2	10	8445	8454	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019740	ACTCA	2	10	8619	8628	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_019740	ACCCC	2	10	8980	8989	20 %	0 %	0 %	80 %	428314604
15	NC_019740	TTACC	2	10	12775	12784	20 %	40 %	0 %	40 %	428314605
16	NC_019740	CCAAT	2	10	14055	14064	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_019740	GTTAG	2	10	15194	15203	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019740	GGTTC	2	10	18353	18362	0 %	40 %	40 %	20 %	428314611
19	NC_019740	CTTGA	2	10	18630	18639	20 %	40 %	20 %	20 %	428314612
20	NC_019740	CCCAA	2	10	18890	18899	40 %	0 %	0 %	60 %	428314612
21	NC_019740	AAACC	2	10	21086	21095	60 %	0 %	0 %	40 %	428314615
22	NC_019740	AATTC	2	10	26795	26804	40 %	40 %	0 %	20 %	428314621
23	NC_019740	AGGAT	2	10	27166	27175	40 %	20 %	40 %	0 %	428314622
24	NC_019740	TCTTG	2	10	27741	27750	0 %	60 %	20 %	20 %	428314623
25	NC_019740	TTCTG	2	10	28655	28664	0 %	60 %	20 %	20 %	428314623
26	NC_019740	TAGAC	2	10	29564	29573	40 %	20 %	20 %	20 %	428314623
27	NC_019740	ATTAT	2	10	31290	31299	40 %	60 %	0 %	0 %	428314624
28	NC_019740	TGTGG	2	10	31674	31683	0 %	40 %	60 %	0 %	428314624
29	NC_019740	CAAGT	2	10	35725	35734	40 %	20 %	20 %	20 %	428314626
30	NC_019740	GTTGT	2	10	38123	38132	0 %	60 %	40 %	0 %	428314629
31	NC_019740	ACGGG	2	10	43122	43131	20 %	0 %	60 %	20 %	428314632
32	NC_019740	CGAAT	2	10	43402	43411	40 %	20 %	20 %	20 %	428314632
33	NC_019740	ATTTA	2	10	43907	43916	40 %	60 %	0 %	0 %	428314633
34	NC_019740	CTGAC	2	10	48127	48136	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_019740	ATTAT	2	10	55906	55915	40 %	60 %	0 %	0 %	428314641
36	NC_019740	TGTGG	2	10	56290	56299	0 %	40 %	60 %	0 %	428314641
37	NC_019740	CGCCA	2	10	60688	60697	20 %	0 %	20 %	60 %	428314643
38	NC_019740	ATTGG	2	10	61603	61612	20 %	40 %	40 %	0 %	428314643
39	NC_019740	GGTTT	2	10	62626	62635	0 %	60 %	40 %	0 %	428314643
40	NC_019740	AATGG	2	10	65618	65627	40 %	20 %	40 %	0 %	428314649
41	NC_019740	CCAAC	2	10	66815	66824	40 %	0 %	0 %	60 %	428314649
42	NC_019740	AGCCA	2	10	66926	66935	40 %	0 %	20 %	40 %	428314649
43	NC_019740	TACAA	2	10	69071	69080	60 %	20 %	0 %	20 %	428314650
44	NC_019740	AGCGA	2	10	70677	70686	40 %	0 %	40 %	20 %	428314650
45	NC_019740	TAATC	2	10	70847	70856	40 %	40 %	0 %	20 %	428314650
46	NC_019740	ACTCA	2	10	71476	71485	40 %	20 %	0 %	40 %	428314651
47	NC_019740	AAAGA	2	10	73098	73107	80 %	0 %	20 %	0 %	428314653
48	NC_019740	ATTGG	2	10	73156	73165	20 %	40 %	40 %	0 %	428314653
49	NC_019740	AAACA	2	10	73302	73311	80 %	0 %	0 %	20 %	428314653
50	NC_019740	ACACC	2	10	74169	74178	40 %	0 %	0 %	60 %	428314656
51	NC_019740	CTTTT	2	10	74622	74631	0 %	80 %	0 %	20 %	428314656
52	NC_019740	CCATC	2	10	75704	75713	20 %	20 %	0 %	60 %	428314657
53	NC_019740	CTCTT	2	10	76837	76846	0 %	60 %	0 %	40 %	428314658
54	NC_019740	CCATC	2	10	77431	77440	20 %	20 %	0 %	60 %	428314659
55	NC_019740	TTTAA	2	10	77630	77639	40 %	60 %	0 %	0 %	428314660
56	NC_019740	CTTGG	2	10	82479	82488	0 %	40 %	40 %	20 %	428314663
57	NC_019740	ACGGC	3	15	83423	83437	20 %	0 %	40 %	40 %	428314663
58	NC_019740	ACGGC	3	15	83546	83560	20 %	0 %	40 %	40 %	428314663
59	NC_019740	TTGCC	2	10	83724	83733	0 %	40 %	20 %	40 %	428314663
60	NC_019740	ACAGC	2	10	83870	83879	40 %	0 %	20 %	40 %	428314663
61	NC_019740	TTGAA	2	10	83912	83921	40 %	40 %	20 %	0 %	428314663
62	NC_019740	ACGGC	2	10	83993	84002	20 %	0 %	40 %	40 %	428314663
63	NC_019740	TTTGC	2	10	85676	85685	0 %	60 %	20 %	20 %	428314664
64	NC_019740	GAAAG	2	10	88475	88484	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019740	CAACT	2	10	90904	90913	40 %	20 %	0 %	40 %	428314668
66	NC_019740	GTTCT	2	10	92308	92317	0 %	60 %	20 %	20 %	428314669

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.