MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.03

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019740	TAGA	2	8	104	111	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019740	AGAA	2	8	3029	3036	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019740	TTGC	2	8	4286	4293	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_019740	ATTG	2	8	7979	7986	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019740	CTGA	2	8	8187	8194	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_019740	AATG	2	8	8459	8466	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019740	AAAT	2	8	8487	8494	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019740	CTTT	2	8	11509	11516	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_019740	TAAC	2	8	13434	13441	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_019740	TATT	2	8	15395	15402	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019740	ACTA	2	8	15905	15912	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_019740	GTTG	2	8	16332	16339	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019740	ATTT	2	8	18446	18453	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019740	CTAC	2	8	29911	29918	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_019740	TAAG	2	8	30054	30061	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019740	GTAT	2	8	30226	30233	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019740	CTGG	2	8	30269	30276	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_019740	GTTG	2	8	30365	30372	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019740	TTTG	2	8	33329	33336	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019740	TGCC	2	8	33920	33927	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_019740	CGAG	2	8	36085	36092	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_019740	AGGG	2	8	38992	38999	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019740	AGTT	2	8	39000	39007	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019740	AGGA	2	8	39905	39912	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019740	AAAT	2	8	40232	40239	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019740	AACA	2	8	40501	40508	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_019740	ACAT	2	8	44365	44372	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_019740	GTCG	2	8	45652	45659	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_019740	TGGT	2	8	45876	45883	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019740	CAAT	2	8	45942	45949	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_019740	TCAA	2	8	46157	46164	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_019740	GAAA	2	8	46239	46246	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019740	CGGG	2	8	46384	46391	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34	NC_019740	TATG	2	8	46577	46584	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019740	ATTG	2	8	47166	47173	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019740	TGGA	2	8	47820	47827	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019740	ATTT	2	8	50533	50540	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019740	CCTT	2	8	50600	50607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_019740	AACT	2	8	50709	50716	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_019740	TTTG	2	8	57945	57952	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019740	TGCC	2	8	58536	58543	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_019740	ACGG	2	8	60531	60538	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_019740	GCTT	2	8	62944	62951	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_019740	CAAT	2	8	64574	64581	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_019740	AAAT	2	8	64962	64969	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019740	AAGA	2	8	65319	65326	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019740	GCTA	2	8	65528	65535	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_019740	CTTT	2	8	71081	71088	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_019740	TCCC	2	8	71176	71183	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
50	NC_019740	AATC	2	8	72748	72755	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_019740	AATT	2	8	72786	72793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019740	AAGA	2	8	72863	72870	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019740	ATCC	2	8	76492	76499	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_019740	TTGA	2	8	77507	77514	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019740	TCAT	2	8	88526	88533	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_019740	CTTC	2	8	88924	88931	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_019740	TGAT	2	8	89011	89018	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019740	ACCA	2	8	89060	89067	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_019740	TGTT	2	8	91272	91279	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019740	AAAT	2	8	91311	91318	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019740	TGGA	2	8	91354	91361	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019740	AATT	2	8	91480	91487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.