MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.03

Total Repeats: 175

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019740	GCAG	2	8	412	419	25 %	0 %	50 %	25 %	428314594
2	NC_019740	ACCG	2	8	1729	1736	25 %	0 %	25 %	50 %	428314597
3	NC_019740	TGAT	2	8	2375	2382	25 %	50 %	25 %	0 %	428314598
4	NC_019740	CGAT	2	8	2841	2848	25 %	25 %	25 %	25 %	428314599
5	NC_019740	TTGA	2	8	3613	3620	25 %	50 %	25 %	0 %	428314602
6	NC_019740	TAGT	2	8	3770	3777	25 %	50 %	25 %	0 %	428314602
7	NC_019740	GCTT	2	8	3953	3960	0 %	50 %	25 %	25 %	428314602
8	NC_019740	AATT	2	8	5315	5322	50 %	50 %	0 %	0 %	428314603
9	NC_019740	TAAA	2	8	5870	5877	75 %	25 %	0 %	0 %	428314603
10	NC_019740	GAAC	2	8	5892	5899	50 %	0 %	25 %	25 %	428314603
11	NC_019740	AGCG	2	8	6541	6548	25 %	0 %	50 %	25 %	428314603
12	NC_019740	AAAT	2	8	6869	6876	75 %	25 %	0 %	0 %	428314603
13	NC_019740	TTTG	2	8	6994	7001	0 %	75 %	25 %	0 %	428314603
14	NC_019740	GTTG	2	8	7267	7274	0 %	50 %	50 %	0 %	428314603
15	NC_019740	ACTG	2	8	7643	7650	25 %	25 %	25 %	25 %	428314603
16	NC_019740	TCAC	2	8	9091	9098	25 %	25 %	0 %	50 %	428314604
17	NC_019740	GTGG	2	8	9232	9239	0 %	25 %	75 %	0 %	428314604
18	NC_019740	TGCC	2	8	9483	9490	0 %	25 %	25 %	50 %	428314604
19	NC_019740	TTCC	2	8	9798	9805	0 %	50 %	0 %	50 %	428314604
20	NC_019740	TCAA	2	8	10303	10310	50 %	25 %	0 %	25 %	428314604
21	NC_019740	CAAT	2	8	12085	12092	50 %	25 %	0 %	25 %	428314605
22	NC_019740	ACCA	2	8	12526	12533	50 %	0 %	0 %	50 %	428314605
23	NC_019740	TTGC	3	12	12934	12945	0 %	50 %	25 %	25 %	428314605
24	NC_019740	TCAA	2	8	13192	13199	50 %	25 %	0 %	25 %	428314606
25	NC_019740	CTTT	2	8	13783	13790	0 %	75 %	0 %	25 %	428314607
26	NC_019740	ACTG	2	8	13843	13850	25 %	25 %	25 %	25 %	428314607
27	NC_019740	TTGG	2	8	13920	13927	0 %	50 %	50 %	0 %	428314607
28	NC_019740	GTGA	2	8	14833	14840	25 %	25 %	50 %	0 %	428314609
29	NC_019740	CAAC	2	8	16657	16664	50 %	0 %	0 %	50 %	428314610
30	NC_019740	CCAC	2	8	17771	17778	25 %	0 %	0 %	75 %	428314611
31	NC_019740	CCAA	2	8	18041	18048	50 %	0 %	0 %	50 %	428314611
32	NC_019740	AGAA	2	8	18111	18118	75 %	0 %	25 %	0 %	428314611
33	NC_019740	GGAG	2	8	18200	18207	25 %	0 %	75 %	0 %	428314611
34	NC_019740	TTCA	2	8	19107	19114	25 %	50 %	0 %	25 %	428314612
35	NC_019740	CTTT	2	8	19689	19696	0 %	75 %	0 %	25 %	428314613
36	NC_019740	TTAA	2	8	20008	20015	50 %	50 %	0 %	0 %	428314613
37	NC_019740	TGGG	2	8	20176	20183	0 %	25 %	75 %	0 %	428314613
38	NC_019740	AACT	2	8	20190	20197	50 %	25 %	0 %	25 %	428314613
39	NC_019740	GAAG	2	8	21355	21362	50 %	0 %	50 %	0 %	428314615
40	NC_019740	AAAT	2	8	21539	21546	75 %	25 %	0 %	0 %	428314615
41	NC_019740	ATGA	2	8	22911	22918	50 %	25 %	25 %	0 %	428314617
42	NC_019740	GAAA	2	8	24231	24238	75 %	0 %	25 %	0 %	428314619
43	NC_019740	ATCC	2	8	24766	24773	25 %	25 %	0 %	50 %	428314619
44	NC_019740	GAAT	2	8	24834	24841	50 %	25 %	25 %	0 %	428314619
45	NC_019740	TTAG	2	8	24951	24958	25 %	50 %	25 %	0 %	428314619
46	NC_019740	AATA	2	8	25634	25641	75 %	25 %	0 %	0 %	428314621
47	NC_019740	CAAC	2	8	26883	26890	50 %	0 %	0 %	50 %	428314622
48	NC_019740	ATCA	2	8	27459	27466	50 %	25 %	0 %	25 %	428314622
49	NC_019740	GTTT	2	8	28693	28700	0 %	75 %	25 %	0 %	428314623
50	NC_019740	TTTG	2	8	28758	28765	0 %	75 %	25 %	0 %	428314623
51	NC_019740	TAAG	2	8	28951	28958	50 %	25 %	25 %	0 %	428314623
52	NC_019740	TTGA	2	8	29029	29036	25 %	50 %	25 %	0 %	428314623
53	NC_019740	GGCA	2	8	30933	30940	25 %	0 %	50 %	25 %	428314624
54	NC_019740	GGCA	2	8	31011	31018	25 %	0 %	50 %	25 %	428314624
55	NC_019740	GAAA	2	8	31230	31237	75 %	0 %	25 %	0 %	428314624
56	NC_019740	CCTA	2	8	31919	31926	25 %	25 %	0 %	50 %	428314624
57	NC_019740	GTTG	2	8	31979	31986	0 %	50 %	50 %	0 %	428314624
58	NC_019740	AGCA	2	8	35078	35085	50 %	0 %	25 %	25 %	428314625
59	NC_019740	GGGA	2	8	36759	36766	25 %	0 %	75 %	0 %	428314627
60	NC_019740	CAAC	2	8	37110	37117	50 %	0 %	0 %	50 %	428314627
61	NC_019740	TGGG	2	8	37276	37283	0 %	25 %	75 %	0 %	428314627
62	NC_019740	CGGG	2	8	37467	37474	0 %	0 %	75 %	25 %	428314627
63	NC_019740	GATA	2	8	38041	38048	50 %	25 %	25 %	0 %	428314629
64	NC_019740	GGAA	2	8	38425	38432	50 %	0 %	50 %	0 %	428314629
65	NC_019740	TTCT	2	8	38510	38517	0 %	75 %	0 %	25 %	428314629
66	NC_019740	CAGT	2	8	38532	38539	25 %	25 %	25 %	25 %	428314629
67	NC_019740	GAAA	2	8	39997	40004	75 %	0 %	25 %	0 %	428314631
68	NC_019740	GAGC	2	8	42514	42521	25 %	0 %	50 %	25 %	428314632
69	NC_019740	CGAC	2	8	42539	42546	25 %	0 %	25 %	50 %	428314632
70	NC_019740	TGAG	2	8	42612	42619	25 %	25 %	50 %	0 %	428314632
71	NC_019740	TGAG	2	8	42813	42820	25 %	25 %	50 %	0 %	428314632
72	NC_019740	AAAT	2	8	43102	43109	75 %	25 %	0 %	0 %	428314632
73	NC_019740	GTTC	2	8	43386	43393	0 %	50 %	25 %	25 %	428314632
74	NC_019740	TCAC	2	8	43978	43985	25 %	25 %	0 %	50 %	428314633
75	NC_019740	TACT	2	8	44068	44075	25 %	50 %	0 %	25 %	428314633
76	NC_019740	TGAA	2	8	44153	44160	50 %	25 %	25 %	0 %	428314633
77	NC_019740	GCAG	2	8	44561	44568	25 %	0 %	50 %	25 %	428314634
78	NC_019740	TTGA	2	8	44764	44771	25 %	50 %	25 %	0 %	428314634
79	NC_019740	TTTC	2	8	48312	48319	0 %	75 %	0 %	25 %	428314635
80	NC_019740	CCTT	2	8	48684	48691	0 %	50 %	0 %	50 %	428314635
81	NC_019740	TTCT	2	8	48735	48742	0 %	75 %	0 %	25 %	428314635
82	NC_019740	ATTA	2	8	48921	48928	50 %	50 %	0 %	0 %	428314635
83	NC_019740	CATC	2	8	49608	49615	25 %	25 %	0 %	50 %	428314636
84	NC_019740	ACCG	2	8	49730	49737	25 %	0 %	25 %	50 %	428314636
85	NC_019740	CTCC	2	8	49745	49752	0 %	25 %	0 %	75 %	428314636
86	NC_019740	CTTA	2	8	49972	49979	25 %	50 %	0 %	25 %	428314636
87	NC_019740	TTTA	2	8	50106	50113	25 %	75 %	0 %	0 %	428314636
88	NC_019740	AAGG	2	8	50979	50986	50 %	0 %	50 %	0 %	428314637
89	NC_019740	CAGG	2	8	51168	51175	25 %	0 %	50 %	25 %	428314637
90	NC_019740	ACCA	2	8	51200	51207	50 %	0 %	0 %	50 %	428314637
91	NC_019740	AATT	2	8	51259	51266	50 %	50 %	0 %	0 %	428314637
92	NC_019740	TTGA	2	8	51511	51518	25 %	50 %	25 %	0 %	428314637
93	NC_019740	AGTA	2	8	51756	51763	50 %	25 %	25 %	0 %	428314637
94	NC_019740	TGAA	2	8	51781	51788	50 %	25 %	25 %	0 %	428314637
95	NC_019740	TTAA	2	8	52022	52029	50 %	50 %	0 %	0 %	428314637
96	NC_019740	TGCC	2	8	53219	53226	0 %	25 %	25 %	50 %	428314639
97	NC_019740	TAAG	2	8	53302	53309	50 %	25 %	25 %	0 %	428314640
98	NC_019740	TCCG	2	8	53968	53975	0 %	25 %	25 %	50 %	428314640
99	NC_019740	CCAG	2	8	54023	54030	25 %	0 %	25 %	50 %	428314640
100	NC_019740	GGCA	2	8	55549	55556	25 %	0 %	50 %	25 %	428314641
101	NC_019740	GGCA	2	8	55627	55634	25 %	0 %	50 %	25 %	428314641
102	NC_019740	CCTA	2	8	56535	56542	25 %	25 %	0 %	50 %	428314641
103	NC_019740	GTTG	2	8	56595	56602	0 %	50 %	50 %	0 %	428314641
104	NC_019740	AGCA	2	8	59694	59701	50 %	0 %	25 %	25 %	428314642
105	NC_019740	ACTC	2	8	60866	60873	25 %	25 %	0 %	50 %	428314643
106	NC_019740	TCAG	2	8	61237	61244	25 %	25 %	25 %	25 %	428314643
107	NC_019740	ATTT	2	8	61353	61360	25 %	75 %	0 %	0 %	428314643
108	NC_019740	CCCG	2	8	62206	62213	0 %	0 %	25 %	75 %	428314643
109	NC_019740	TTCC	2	8	62831	62838	0 %	50 %	0 %	50 %	428314643
110	NC_019740	CAGG	2	8	63210	63217	25 %	0 %	50 %	25 %	428314644
111	NC_019740	CTGC	2	8	63343	63350	0 %	25 %	25 %	50 %	428314645
112	NC_019740	AACC	2	8	63540	63547	50 %	0 %	0 %	50 %	428314645
113	NC_019740	CCAG	2	8	63928	63935	25 %	0 %	25 %	50 %	428314646
114	NC_019740	TGAG	2	8	64239	64246	25 %	25 %	50 %	0 %	428314646
115	NC_019740	CCTT	2	8	64716	64723	0 %	50 %	0 %	50 %	428314647
116	NC_019740	ACCC	2	8	65736	65743	25 %	0 %	0 %	75 %	428314649
117	NC_019740	TTGA	2	8	66083	66090	25 %	50 %	25 %	0 %	428314649
118	NC_019740	AGCT	2	8	66453	66460	25 %	25 %	25 %	25 %	428314649
119	NC_019740	TGAC	2	8	67954	67961	25 %	25 %	25 %	25 %	428314650
120	NC_019740	TTGG	2	8	68116	68123	0 %	50 %	50 %	0 %	428314650
121	NC_019740	GCTG	2	8	68472	68479	0 %	25 %	50 %	25 %	428314650
122	NC_019740	GGCT	2	8	68646	68653	0 %	25 %	50 %	25 %	428314650
123	NC_019740	CTTC	2	8	69734	69741	0 %	50 %	0 %	50 %	428314650
124	NC_019740	ACCC	2	8	70735	70742	25 %	0 %	0 %	75 %	428314650
125	NC_019740	CTTT	2	8	71382	71389	0 %	75 %	0 %	25 %	428314651
126	NC_019740	TCCT	2	8	71491	71498	0 %	50 %	0 %	50 %	428314651
127	NC_019740	TTCC	2	8	71617	71624	0 %	50 %	0 %	50 %	428314651
128	NC_019740	AAGA	2	8	71729	71736	75 %	0 %	25 %	0 %	428314651
129	NC_019740	ATGT	2	8	72259	72266	25 %	50 %	25 %	0 %	428314652
130	NC_019740	TTGA	2	8	72299	72306	25 %	50 %	25 %	0 %	428314652
131	NC_019740	TCAG	2	8	72318	72325	25 %	25 %	25 %	25 %	428314652
132	NC_019740	CAAT	2	8	72442	72449	50 %	25 %	0 %	25 %	428314652
133	NC_019740	TAAC	2	8	73190	73197	50 %	25 %	0 %	25 %	428314653
134	NC_019740	CATT	2	8	73254	73261	25 %	50 %	0 %	25 %	428314653
135	NC_019740	AACA	2	8	74149	74156	75 %	0 %	0 %	25 %	428314656
136	NC_019740	TTGC	2	8	74280	74287	0 %	50 %	25 %	25 %	428314656
137	NC_019740	GTCG	2	8	75691	75698	0 %	25 %	50 %	25 %	428314657
138	NC_019740	TAAA	2	8	75965	75972	75 %	25 %	0 %	0 %	428314657
139	NC_019740	CGTC	2	8	76084	76091	0 %	25 %	25 %	50 %	428314657
140	NC_019740	CTTT	2	8	76141	76148	0 %	75 %	0 %	25 %	428314657
141	NC_019740	CCAT	2	8	76858	76865	25 %	25 %	0 %	50 %	428314658
142	NC_019740	AATA	2	8	77387	77394	75 %	25 %	0 %	0 %	428314659
143	NC_019740	TCTG	2	8	78429	78436	0 %	50 %	25 %	25 %	428314660
144	NC_019740	GGCA	2	8	79705	79712	25 %	0 %	50 %	25 %	428314662
145	NC_019740	ACGA	2	8	79799	79806	50 %	0 %	25 %	25 %	428314662
146	NC_019740	TTGA	2	8	80007	80014	25 %	50 %	25 %	0 %	428314662
147	NC_019740	GCTA	2	8	80124	80131	25 %	25 %	25 %	25 %	428314662
148	NC_019740	CAAG	2	8	80654	80661	50 %	0 %	25 %	25 %	428314662
149	NC_019740	AGCC	2	8	80885	80892	25 %	0 %	25 %	50 %	428314662
150	NC_019740	GGGA	2	8	81415	81422	25 %	0 %	75 %	0 %	428314662
151	NC_019740	CGTT	2	8	81589	81596	0 %	50 %	25 %	25 %	428314662
152	NC_019740	AGGC	2	8	81628	81635	25 %	0 %	50 %	25 %	428314662
153	NC_019740	TTGA	2	8	82141	82148	25 %	50 %	25 %	0 %	428314663
154	NC_019740	GTTG	2	8	82779	82786	0 %	50 %	50 %	0 %	428314663
155	NC_019740	AGCA	2	8	83105	83112	50 %	0 %	25 %	25 %	428314663
156	NC_019740	AAGG	2	8	83134	83141	50 %	0 %	50 %	0 %	428314663
157	NC_019740	GCAG	2	8	83226	83233	25 %	0 %	50 %	25 %	428314663
158	NC_019740	GTTT	2	8	83824	83831	0 %	75 %	25 %	0 %	428314663
159	NC_019740	GCTC	2	8	84891	84898	0 %	25 %	25 %	50 %	428314663
160	NC_019740	AGCA	2	8	85420	85427	50 %	0 %	25 %	25 %	428314664
161	NC_019740	TTGA	2	8	85511	85518	25 %	50 %	25 %	0 %	428314664
162	NC_019740	TCTG	2	8	86833	86840	0 %	50 %	25 %	25 %	428314664
163	NC_019740	TTAG	2	8	87122	87129	25 %	50 %	25 %	0 %	428314664
164	NC_019740	AGCG	2	8	87292	87299	25 %	0 %	50 %	25 %	428314664
165	NC_019740	AGCT	2	8	88074	88081	25 %	25 %	25 %	25 %	428314664
166	NC_019740	CCAT	2	8	89188	89195	25 %	25 %	0 %	50 %	428314666
167	NC_019740	CCAA	2	8	89203	89210	50 %	0 %	0 %	50 %	428314666
168	NC_019740	CAGT	2	8	89738	89745	25 %	25 %	25 %	25 %	428314667
169	NC_019740	CAAC	2	8	90166	90173	50 %	0 %	0 %	50 %	428314668
170	NC_019740	AATT	2	8	91075	91082	50 %	50 %	0 %	0 %	428314668
171	NC_019740	ACCA	2	8	91615	91622	50 %	0 %	0 %	50 %	428314669
172	NC_019740	GAGG	2	8	91798	91805	25 %	0 %	75 %	0 %	428314669
173	NC_019740	GATG	2	8	91822	91829	25 %	25 %	50 %	0 %	428314669
174	NC_019740	GATG	2	8	91924	91931	25 %	25 %	50 %	0 %	428314669
175	NC_019740	CTGG	2	8	92360	92367	0 %	25 %	50 %	25 %	428314669

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.