MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.01

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019739	GAAACT	2	12	2794	2805	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428314408
2	NC_019739	TCGGTT	2	12	4547	4558	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428314409
3	NC_019739	GATGGT	2	12	4573	4584	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428314409
4	NC_019739	GAAGGA	2	12	4807	4818	50 %	0 %	50 %	0 %	428314409
5	NC_019739	AGTGGG	2	12	4965	4976	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	428314409
6	NC_019739	GGCTTG	2	12	6902	6913	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	428314411
7	NC_019739	TCGAAC	2	12	7914	7925	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428314412
8	NC_019739	CTAAAA	2	12	9442	9453	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428314412
9	NC_019739	AGCGCT	2	12	11077	11088	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428314414
10	NC_019739	TCAGAG	2	12	13521	13532	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428314416
11	NC_019739	AAGGAA	2	12	16878	16889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314421
12	NC_019739	GCTTCC	2	12	18482	18493	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	428314423
13	NC_019739	GGCTTC	2	12	21392	21403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314428
14	NC_019739	GGAAGC	2	12	26030	26041	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	428314429
15	NC_019739	AAAGCT	2	12	27099	27110	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428314430
16	NC_019739	CGAACA	2	12	28933	28944	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428314430
17	NC_019739	ACTTGA	2	12	36363	36374	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428314434
18	NC_019739	TTTGTT	2	12	42997	43008	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	428314436
19	NC_019739	ATCTAA	2	12	47729	47740	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428314438
20	NC_019739	AAGACA	2	12	51868	51879	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	428314443
21	NC_019739	GCAAAA	2	12	52089	52100	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	428314443
22	NC_019739	AATCGA	2	12	53336	53347	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428314446
23	NC_019739	CAGTGT	2	12	54380	54391	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428314446
24	NC_019739	TTTGAG	2	12	58455	58466	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428314449
25	NC_019739	CTTCCC	2	12	62622	62633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314451
26	NC_019739	TCCCTC	2	12	63502	63513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314452
27	NC_019739	CCTTTA	2	12	63912	63923	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	428314452
28	NC_019739	GCGATG	2	12	69110	69121	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428314458
29	NC_019739	TCCACC	2	12	78037	78048	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	428314467
30	NC_019739	TAGCTC	2	12	85161	85172	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428314474
31	NC_019739	GTAGCT	2	12	89907	89918	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428314478
32	NC_019739	TAAAAT	2	12	90324	90335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314479
33	NC_019739	AGGAAT	2	12	90534	90545	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428314479
34	NC_019739	ATTTTG	2	12	97819	97830	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	428314486
35	NC_019739	AGGAAG	2	12	98539	98550	50 %	0 %	50 %	0 %	428314486
36	NC_019739	AGGCTC	2	12	101186	101197	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428314489
37	NC_019739	TTATCA	2	12	103315	103326	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428314490
38	NC_019739	CGGTTC	2	12	106920	106931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314492
39	NC_019739	TACTGG	2	12	112790	112801	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428314498
40	NC_019739	CTATGA	2	12	117464	117475	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428314498
41	NC_019739	CGCTAC	2	12	119247	119258	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428314498
42	NC_019739	GGTGCT	2	12	119658	119669	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	428314498
43	NC_019739	ACAACG	2	12	121742	121753	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428314500
44	NC_019739	CTGAAC	2	12	124538	124549	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428314500
45	NC_019739	AAAACT	2	12	124864	124875	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428314500
46	NC_019739	ACGCTG	2	12	131254	131265	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428314501
47	NC_019739	AGCAAC	3	18	134011	134028	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428314502
48	NC_019739	GCTGTA	3	18	138365	138382	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428314505
49	NC_019739	AAAAGA	2	12	139510	139521	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	428314505
50	NC_019739	ACATCA	2	12	139635	139646	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428314505
51	NC_019739	CCATCC	2	12	141004	141015	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	428314507
52	NC_019739	TCAAAC	2	12	143890	143901	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428314509
53	NC_019739	ATTGAA	2	12	144574	144585	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428314510
54	NC_019739	GGGTGG	2	12	145676	145687	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	428314510

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.