MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.01

Total Repeats: 92

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019739	ATCTG	2	10	4081	4090	20 %	40 %	20 %	20 %	428314409
2	NC_019739	ATGAC	2	10	4379	4388	40 %	20 %	20 %	20 %	428314409
3	NC_019739	AGTTG	2	10	4642	4651	20 %	40 %	40 %	0 %	428314409
4	NC_019739	ACCAA	2	10	5077	5086	60 %	0 %	0 %	40 %	428314409
5	NC_019739	TAATT	2	10	8138	8147	40 %	60 %	0 %	0 %	428314412
6	NC_019739	TATTG	2	10	13600	13609	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019739	CATCC	2	10	17842	17851	20 %	20 %	0 %	60 %	428314422
8	NC_019739	CTCTT	2	10	18593	18602	0 %	60 %	0 %	40 %	428314423
9	NC_019739	ATGTC	2	10	20682	20691	20 %	40 %	20 %	20 %	428314427
10	NC_019739	ACTCG	2	10	22863	22872	20 %	20 %	20 %	40 %	428314428
11	NC_019739	ACCTA	2	10	26204	26213	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_019739	AGTTC	2	10	34069	34078	20 %	40 %	20 %	20 %	428314432
13	NC_019739	TTCGC	2	10	36166	36175	0 %	40 %	20 %	40 %	428314434
14	NC_019739	GCTTT	2	10	42049	42058	0 %	60 %	20 %	20 %	428314436
15	NC_019739	GATGG	2	10	42833	42842	20 %	20 %	60 %	0 %	428314436
16	NC_019739	GCTTC	2	10	43032	43041	0 %	40 %	20 %	40 %	428314436
17	NC_019739	AAACT	2	10	47248	47257	60 %	20 %	0 %	20 %	428314438
18	NC_019739	AACAG	2	10	48510	48519	60 %	0 %	20 %	20 %	428314439
19	NC_019739	TTTTC	2	10	49530	49539	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_019739	AAAAC	2	10	50560	50569	80 %	0 %	0 %	20 %	428314442
21	NC_019739	GCTCT	2	10	51393	51402	0 %	40 %	20 %	40 %	428314443
22	NC_019739	TTAAT	2	10	53003	53012	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019739	CGACT	2	10	53959	53968	20 %	20 %	20 %	40 %	428314446
24	NC_019739	GAGTT	2	10	54747	54756	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019739	CGATA	2	10	55556	55565	40 %	20 %	20 %	20 %	428314447
26	NC_019739	CTCAA	2	10	55919	55928	40 %	20 %	0 %	40 %	428314448
27	NC_019739	TTTGG	2	10	56954	56963	0 %	60 %	40 %	0 %	428314448
28	NC_019739	AAGCG	2	10	57116	57125	40 %	0 %	40 %	20 %	428314448
29	NC_019739	TCCTT	2	10	58654	58663	0 %	60 %	0 %	40 %	428314449
30	NC_019739	CGCTG	2	10	60396	60405	0 %	20 %	40 %	40 %	428314450
31	NC_019739	TTCAG	2	10	61674	61683	20 %	40 %	20 %	20 %	428314450
32	NC_019739	TTACC	2	10	61990	61999	20 %	40 %	0 %	40 %	428314450
33	NC_019739	TGAAA	2	10	62524	62533	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019739	TAGTT	2	10	66332	66341	20 %	60 %	20 %	0 %	428314455
35	NC_019739	ACCCT	2	10	67988	67997	20 %	20 %	0 %	60 %	428314457
36	NC_019739	CAACC	2	10	68969	68978	40 %	0 %	0 %	60 %	428314458
37	NC_019739	TACGG	2	10	70340	70349	20 %	20 %	40 %	20 %	428314460
38	NC_019739	GCCAC	2	10	71300	71309	20 %	0 %	20 %	60 %	428314461
39	NC_019739	CGACT	2	10	72590	72599	20 %	20 %	20 %	40 %	428314462
40	NC_019739	AGCCA	2	10	73441	73450	40 %	0 %	20 %	40 %	428314463
41	NC_019739	TCAAA	2	10	73975	73984	60 %	20 %	0 %	20 %	428314463
42	NC_019739	CAACT	2	10	74195	74204	40 %	20 %	0 %	40 %	428314464
43	NC_019739	TGCTT	2	10	80907	80916	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_019739	AAACG	2	10	81011	81020	60 %	0 %	20 %	20 %	428314472
45	NC_019739	TGATG	2	10	82992	83001	20 %	40 %	40 %	0 %	428314474
46	NC_019739	AATGC	2	10	85877	85886	40 %	20 %	20 %	20 %	428314475
47	NC_019739	CTATG	2	10	86421	86430	20 %	40 %	20 %	20 %	428314475
48	NC_019739	AAAAT	2	10	86782	86791	80 %	20 %	0 %	0 %	428314475
49	NC_019739	GTTGA	2	10	91886	91895	20 %	40 %	40 %	0 %	428314480
50	NC_019739	CAATG	2	10	92473	92482	40 %	20 %	20 %	20 %	428314480
51	NC_019739	CTCAC	2	10	93043	93052	20 %	20 %	0 %	60 %	428314481
52	NC_019739	TGGAG	2	10	93263	93272	20 %	20 %	60 %	0 %	428314481
53	NC_019739	ATGCC	2	10	96289	96298	20 %	20 %	20 %	40 %	428314485
54	NC_019739	AACCA	2	10	96401	96410	60 %	0 %	0 %	40 %	428314485
55	NC_019739	CTTGA	2	10	99504	99513	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_019739	ACAAT	2	10	99536	99545	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_019739	AGTTG	2	10	99627	99636	20 %	40 %	40 %	0 %	428314488
58	NC_019739	GGTCG	2	10	101765	101774	0 %	20 %	60 %	20 %	428314490
59	NC_019739	TCTGC	2	10	103555	103564	0 %	40 %	20 %	40 %	428314491
60	NC_019739	TTTAT	2	10	103630	103639	20 %	80 %	0 %	0 %	428314491
61	NC_019739	CTAGC	2	10	103722	103731	20 %	20 %	20 %	40 %	428314491
62	NC_019739	CTCAA	2	10	105555	105564	40 %	20 %	0 %	40 %	428314491
63	NC_019739	GCTCG	2	10	106526	106535	0 %	20 %	40 %	40 %	428314492
64	NC_019739	TTTAA	2	10	107909	107918	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019739	CCGTC	2	10	108463	108472	0 %	20 %	20 %	60 %	428314494
66	NC_019739	ATTGG	2	10	109238	109247	20 %	40 %	40 %	0 %	428314495
67	NC_019739	ACTTT	2	10	109508	109517	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_019739	CAATC	2	10	113732	113741	40 %	20 %	0 %	40 %	428314498
69	NC_019739	GGTTT	2	10	115111	115120	0 %	60 %	40 %	0 %	428314498
70	NC_019739	GTATC	2	10	115304	115313	20 %	40 %	20 %	20 %	428314498
71	NC_019739	ACTCA	2	10	122451	122460	40 %	20 %	0 %	40 %	428314500
72	NC_019739	TGATT	2	10	124042	124051	20 %	60 %	20 %	0 %	428314500
73	NC_019739	CAATT	2	10	125806	125815	40 %	40 %	0 %	20 %	428314500
74	NC_019739	AGTCA	2	10	128636	128645	40 %	20 %	20 %	20 %	428314500
75	NC_019739	GCAAA	2	10	129169	129178	60 %	0 %	20 %	20 %	428314501
76	NC_019739	GAAAA	2	10	129243	129252	80 %	0 %	20 %	0 %	428314501
77	NC_019739	ATCGA	2	10	129403	129412	40 %	20 %	20 %	20 %	428314501
78	NC_019739	GGAAG	2	10	129564	129573	40 %	0 %	60 %	0 %	428314501
79	NC_019739	AGAGC	2	10	131755	131764	40 %	0 %	40 %	20 %	428314501
80	NC_019739	AATTG	2	10	132724	132733	40 %	40 %	20 %	0 %	428314502
81	NC_019739	TCTGG	2	10	134997	135006	0 %	40 %	40 %	20 %	428314503
82	NC_019739	AAACA	2	10	135237	135246	80 %	0 %	0 %	20 %	428314503
83	NC_019739	GAGAG	2	10	135424	135433	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019739	GGATA	2	10	135730	135739	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019739	GTGCT	2	10	138441	138450	0 %	40 %	40 %	20 %	428314505
86	NC_019739	CGAAA	2	10	139139	139148	60 %	0 %	20 %	20 %	428314505
87	NC_019739	CCCAA	2	10	140638	140647	40 %	0 %	0 %	60 %	428314506
88	NC_019739	GAATT	2	10	142126	142135	40 %	40 %	20 %	0 %	428314507
89	NC_019739	ATTCA	2	10	143166	143175	40 %	40 %	0 %	20 %	428314508
90	NC_019739	TGACA	2	10	143832	143841	40 %	20 %	20 %	20 %	428314508
91	NC_019739	TCATC	2	10	144367	144376	20 %	40 %	0 %	40 %	428314510
92	NC_019739	TGACA	2	10	146030	146039	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.