MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.01

Total Repeats: 397

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019739	GCTT	2	8	207	214	0 %	50 %	25 %	25 %	428314406
2	NC_019739	CAGC	2	8	332	339	25 %	0 %	25 %	50 %	428314406
3	NC_019739	GGGT	2	8	430	437	0 %	25 %	75 %	0 %	428314406
4	NC_019739	CCCT	2	8	1098	1105	0 %	25 %	0 %	75 %	428314407
5	NC_019739	TGGG	2	8	1153	1160	0 %	25 %	75 %	0 %	428314407
6	NC_019739	GATT	2	8	1205	1212	25 %	50 %	25 %	0 %	428314407
7	NC_019739	AAGG	2	8	1472	1479	50 %	0 %	50 %	0 %	428314407
8	NC_019739	TGAT	2	8	2116	2123	25 %	50 %	25 %	0 %	428314407
9	NC_019739	TAGA	2	8	2126	2133	50 %	25 %	25 %	0 %	428314407
10	NC_019739	AAGG	2	8	3049	3056	50 %	0 %	50 %	0 %	428314408
11	NC_019739	CCAA	2	8	3062	3069	50 %	0 %	0 %	50 %	428314408
12	NC_019739	AAAG	2	8	3361	3368	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019739	GCAC	2	8	3418	3425	25 %	0 %	25 %	50 %	428314409
14	NC_019739	CCAC	2	8	4520	4527	25 %	0 %	0 %	75 %	428314409
15	NC_019739	GTTG	2	8	4621	4628	0 %	50 %	50 %	0 %	428314409
16	NC_019739	CCTT	2	8	5785	5792	0 %	50 %	0 %	50 %	428314410
17	NC_019739	GAGG	2	8	6208	6215	25 %	0 %	75 %	0 %	428314411
18	NC_019739	CAGC	2	8	6569	6576	25 %	0 %	25 %	50 %	428314411
19	NC_019739	TGAT	2	8	6690	6697	25 %	50 %	25 %	0 %	428314411
20	NC_019739	CTGT	2	8	6760	6767	0 %	50 %	25 %	25 %	428314411
21	NC_019739	CACC	2	8	6769	6776	25 %	0 %	0 %	75 %	428314411
22	NC_019739	TTGA	2	8	6851	6858	25 %	50 %	25 %	0 %	428314411
23	NC_019739	TTGA	2	8	7208	7215	25 %	50 %	25 %	0 %	428314411
24	NC_019739	GAAA	2	8	7675	7682	75 %	0 %	25 %	0 %	428314412
25	NC_019739	GTTG	2	8	7752	7759	0 %	50 %	50 %	0 %	428314412
26	NC_019739	CCAA	2	8	7893	7900	50 %	0 %	0 %	50 %	428314412
27	NC_019739	AGAA	2	8	8006	8013	75 %	0 %	25 %	0 %	428314412
28	NC_019739	GTGA	2	8	8267	8274	25 %	25 %	50 %	0 %	428314412
29	NC_019739	AAAG	2	8	8312	8319	75 %	0 %	25 %	0 %	428314412
30	NC_019739	TTCC	2	8	9272	9279	0 %	50 %	0 %	50 %	428314412
31	NC_019739	AACG	2	8	9302	9309	50 %	0 %	25 %	25 %	428314412
32	NC_019739	TGAA	2	8	9992	9999	50 %	25 %	25 %	0 %	428314412
33	NC_019739	AACT	2	8	10328	10335	50 %	25 %	0 %	25 %	428314413
34	NC_019739	CAGT	2	8	10363	10370	25 %	25 %	25 %	25 %	428314413
35	NC_019739	CCAA	2	8	10895	10902	50 %	0 %	0 %	50 %	428314414
36	NC_019739	AGAA	2	8	10903	10910	75 %	0 %	25 %	0 %	428314414
37	NC_019739	ACTT	2	8	11130	11137	25 %	50 %	0 %	25 %	428314414
38	NC_019739	GATA	2	8	11288	11295	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019739	CCAG	2	8	11789	11796	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_019739	ACTG	2	8	11986	11993	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_019739	ACTT	2	8	12148	12155	25 %	50 %	0 %	25 %	428314415
42	NC_019739	CGAC	2	8	12541	12548	25 %	0 %	25 %	50 %	428314415
43	NC_019739	CAGC	2	8	13096	13103	25 %	0 %	25 %	50 %	428314416
44	NC_019739	GGGA	2	8	13204	13211	25 %	0 %	75 %	0 %	428314416
45	NC_019739	CGTG	2	8	13928	13935	0 %	25 %	50 %	25 %	428314417
46	NC_019739	AAGA	2	8	14737	14744	75 %	0 %	25 %	0 %	428314419
47	NC_019739	CTTG	2	8	15198	15205	0 %	50 %	25 %	25 %	428314419
48	NC_019739	CACC	2	8	15326	15333	25 %	0 %	0 %	75 %	428314419
49	NC_019739	TGCT	2	8	15390	15397	0 %	50 %	25 %	25 %	428314419
50	NC_019739	TCAA	2	8	15982	15989	50 %	25 %	0 %	25 %	428314420
51	NC_019739	AGAA	2	8	16320	16327	75 %	0 %	25 %	0 %	428314420
52	NC_019739	GGCA	2	8	16434	16441	25 %	0 %	50 %	25 %	428314420
53	NC_019739	TCCA	2	8	16594	16601	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_019739	CGTC	2	8	17126	17133	0 %	25 %	25 %	50 %	428314421
55	NC_019739	CGCA	2	8	17871	17878	25 %	0 %	25 %	50 %	428314422
56	NC_019739	GTCA	2	8	18795	18802	25 %	25 %	25 %	25 %	428314424
57	NC_019739	TAAC	2	8	20133	20140	50 %	25 %	0 %	25 %	428314427
58	NC_019739	TGAC	2	8	20180	20187	25 %	25 %	25 %	25 %	428314427
59	NC_019739	ACTC	2	8	20398	20405	25 %	25 %	0 %	50 %	428314427
60	NC_019739	GATC	2	8	20797	20804	25 %	25 %	25 %	25 %	428314427
61	NC_019739	AGGA	2	8	21193	21200	50 %	0 %	50 %	0 %	428314428
62	NC_019739	CCAT	2	8	21510	21517	25 %	25 %	0 %	50 %	428314428
63	NC_019739	AGGT	2	8	22197	22204	25 %	25 %	50 %	0 %	428314428
64	NC_019739	AACC	2	8	23589	23596	50 %	0 %	0 %	50 %	428314428
65	NC_019739	CAAC	2	8	23728	23735	50 %	0 %	0 %	50 %	428314428
66	NC_019739	CTGA	2	8	23796	23803	25 %	25 %	25 %	25 %	428314428
67	NC_019739	GTTT	2	8	23827	23834	0 %	75 %	25 %	0 %	428314428
68	NC_019739	ACAA	2	8	24156	24163	75 %	0 %	0 %	25 %	428314428
69	NC_019739	TTAG	2	8	24401	24408	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019739	GGAC	2	8	25041	25048	25 %	0 %	50 %	25 %	428314429
71	NC_019739	AATC	2	8	26061	26068	50 %	25 %	0 %	25 %	428314429
72	NC_019739	AGCA	2	8	26717	26724	50 %	0 %	25 %	25 %	428314430
73	NC_019739	GTGG	2	8	26786	26793	0 %	25 %	75 %	0 %	428314430
74	NC_019739	TGCC	2	8	26981	26988	0 %	25 %	25 %	50 %	428314430
75	NC_019739	GATT	2	8	27208	27215	25 %	50 %	25 %	0 %	428314430
76	NC_019739	GTCA	2	8	27685	27692	25 %	25 %	25 %	25 %	428314430
77	NC_019739	GGCA	2	8	28102	28109	25 %	0 %	50 %	25 %	428314430
78	NC_019739	TCCA	2	8	28558	28565	25 %	25 %	0 %	50 %	428314430
79	NC_019739	AATC	2	8	28835	28842	50 %	25 %	0 %	25 %	428314430
80	NC_019739	TCCT	2	8	28921	28928	0 %	50 %	0 %	50 %	428314430
81	NC_019739	GCTG	2	8	29063	29070	0 %	25 %	50 %	25 %	428314430
82	NC_019739	CAAT	2	8	29683	29690	50 %	25 %	0 %	25 %	428314430
83	NC_019739	AAGC	2	8	30096	30103	50 %	0 %	25 %	25 %	428314430
84	NC_019739	TGCT	2	8	30171	30178	0 %	50 %	25 %	25 %	428314430
85	NC_019739	AATG	2	8	31146	31153	50 %	25 %	25 %	0 %	428314430
86	NC_019739	TAGA	2	8	31459	31466	50 %	25 %	25 %	0 %	428314430
87	NC_019739	TGAT	2	8	31507	31514	25 %	50 %	25 %	0 %	428314430
88	NC_019739	CATC	2	8	32979	32986	25 %	25 %	0 %	50 %	428314431
89	NC_019739	CTGA	2	8	33046	33053	25 %	25 %	25 %	25 %	428314431
90	NC_019739	CAAC	2	8	33543	33550	50 %	0 %	0 %	50 %	428314431
91	NC_019739	CAAA	2	8	33723	33730	75 %	0 %	0 %	25 %	428314431
92	NC_019739	GAGC	2	8	34897	34904	25 %	0 %	50 %	25 %	428314433
93	NC_019739	TTGC	2	8	35207	35214	0 %	50 %	25 %	25 %	428314433
94	NC_019739	CTCC	2	8	35641	35648	0 %	25 %	0 %	75 %	428314434
95	NC_019739	ACAA	2	8	35711	35718	75 %	0 %	0 %	25 %	428314434
96	NC_019739	AACC	2	8	36004	36011	50 %	0 %	0 %	50 %	428314434
97	NC_019739	TAGT	2	8	37622	37629	25 %	50 %	25 %	0 %	428314435
98	NC_019739	CCAA	2	8	38225	38232	50 %	0 %	0 %	50 %	428314435
99	NC_019739	CGAT	2	8	38253	38260	25 %	25 %	25 %	25 %	428314435
100	NC_019739	GAGT	2	8	38329	38336	25 %	25 %	50 %	0 %	428314435
101	NC_019739	CTGG	2	8	39117	39124	0 %	25 %	50 %	25 %	428314435
102	NC_019739	AGCG	2	8	40715	40722	25 %	0 %	50 %	25 %	428314435
103	NC_019739	GAAC	2	8	41523	41530	50 %	0 %	25 %	25 %	428314436
104	NC_019739	GCCA	2	8	42135	42142	25 %	0 %	25 %	50 %	428314436
105	NC_019739	TACC	2	8	42982	42989	25 %	25 %	0 %	50 %	428314436
106	NC_019739	TTCG	2	8	43216	43223	0 %	50 %	25 %	25 %	428314436
107	NC_019739	TCTT	2	8	43361	43368	0 %	75 %	0 %	25 %	428314436
108	NC_019739	GATA	2	8	43473	43480	50 %	25 %	25 %	0 %	428314436
109	NC_019739	ATGT	2	8	43805	43812	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019739	AAAG	2	8	44357	44364	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019739	CTTA	2	8	44412	44419	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_019739	AAAT	2	8	44520	44527	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019739	AATT	2	8	44630	44637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019739	CTCG	2	8	44788	44795	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_019739	TAGA	2	8	45251	45258	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019739	AAAG	2	8	45292	45299	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019739	CTGG	2	8	46057	46064	0 %	25 %	50 %	25 %	428314437
118	NC_019739	AATC	2	8	46485	46492	50 %	25 %	0 %	25 %	428314437
119	NC_019739	TAAA	2	8	46627	46634	75 %	25 %	0 %	0 %	428314437
120	NC_019739	TATC	2	8	46892	46899	25 %	50 %	0 %	25 %	428314437
121	NC_019739	TCAA	2	8	46912	46919	50 %	25 %	0 %	25 %	428314437
122	NC_019739	CGAT	2	8	47019	47026	25 %	25 %	25 %	25 %	428314438
123	NC_019739	GATT	2	8	47145	47152	25 %	50 %	25 %	0 %	428314438
124	NC_019739	TGAA	2	8	47171	47178	50 %	25 %	25 %	0 %	428314438
125	NC_019739	AAAC	2	8	47281	47288	75 %	0 %	0 %	25 %	428314438
126	NC_019739	ATTA	2	8	47411	47418	50 %	50 %	0 %	0 %	428314438
127	NC_019739	TTAG	2	8	47505	47512	25 %	50 %	25 %	0 %	428314438
128	NC_019739	CCTG	2	8	47637	47644	0 %	25 %	25 %	50 %	428314438
129	NC_019739	CCTA	2	8	47714	47721	25 %	25 %	0 %	50 %	428314438
130	NC_019739	ATGA	3	12	48999	49010	50 %	25 %	25 %	0 %	428314439
131	NC_019739	GGGA	2	8	49011	49018	25 %	0 %	75 %	0 %	428314439
132	NC_019739	TCAC	2	8	49218	49225	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_019739	AAGT	2	8	49449	49456	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019739	AACC	2	8	49621	49628	50 %	0 %	0 %	50 %	428314440
135	NC_019739	ATCA	2	8	49722	49729	50 %	25 %	0 %	25 %	428314440
136	NC_019739	AATT	2	8	50460	50467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019739	AAAG	2	8	50594	50601	75 %	0 %	25 %	0 %	428314442
138	NC_019739	CTAC	2	8	50624	50631	25 %	25 %	0 %	50 %	428314442
139	NC_019739	GCCA	2	8	51489	51496	25 %	0 %	25 %	50 %	428314443
140	NC_019739	TCAA	2	8	51616	51623	50 %	25 %	0 %	25 %	428314443
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142	NC_019739	GTTA	2	8	52380	52387	25 %	50 %	25 %	0 %	428314444
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.