MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 chromosome

Total Repeats: 442

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019738	AATGAA	2	12	12094	12105	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019738	GTCAAC	2	12	20723	20734	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019738	CAAAAC	2	12	25674	25685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019738	GTTGAA	2	12	30683	30694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019738	TCGCTT	2	12	32967	32978	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019738	GAAAGG	2	12	37088	37099	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019738	GGTCTT	2	12	89460	89471	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_019738	AGATAT	2	12	121812	121823	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019738	TGGACT	2	12	127189	127200	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_019738	TTTCAA	2	12	156098	156109	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_019738	CCAAAA	2	12	156610	156621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019738	TTAACG	2	12	173071	173082	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_019738	CGACTT	2	12	195200	195211	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019738	TACCTC	2	12	221705	221716	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_019738	GTAGGG	2	12	243628	243639	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019738	AGCAAC	2	12	258926	258937	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019738	CAATTA	2	12	314470	314481	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_019738	AGGCAA	2	12	366606	366617	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_019738	TATTTT	2	12	404136	404147	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019738	TCTATG	2	12	413777	413788	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_019738	AGATTA	2	12	417069	417080	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019738	GTATGG	2	12	432835	432846	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019738	GATATT	2	12	451266	451277	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019738	TTATAG	2	12	451305	451316	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019738	AACCAG	2	12	507588	507599	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019738	TAGCAA	2	12	540214	540225	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_019738	ACTCGT	2	12	541636	541647	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019738	TTTGGG	2	12	541695	541706	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019738	CGGCGA	2	12	543151	543162	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019738	GTACGT	2	12	543226	543237	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_019738	TAAGAC	2	12	555116	555127	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_019738	TCCTTA	2	12	556176	556187	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019738	GCGATT	2	12	578329	578340	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_019738	GTAGAT	2	12	586267	586278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019738	CTATAT	2	12	602801	602812	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_019738	GATGCA	2	12	613343	613354	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_019738	TGAACT	2	12	621769	621780	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_019738	CTTTTG	2	12	633412	633423	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_019738	CGGATA	2	12	638268	638279	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_019738	GATTCG	2	12	654701	654712	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_019738	TGAGAG	2	12	669612	669623	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019738	TAGCGT	2	12	685479	685490	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_019738	AACCTA	2	12	689657	689668	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019738	AAACAG	2	12	701024	701035	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_019738	GCTCGT	2	12	724506	724517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019738	ACCTAT	2	12	729226	729237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019738	GAATAT	2	12	779804	779815	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019738	ATGTTT	2	12	782269	782280	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019738	GAAGAG	2	12	797126	797137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019738	AGGGAA	2	12	808893	808904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019738	TCATAA	2	12	820367	820378	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_019738	GAAAAC	2	12	867295	867306	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_019738	TATTTG	2	12	900942	900953	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019738	GTCGGA	2	12	905833	905844	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_019738	GTCAAG	2	12	907445	907456	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_019738	TGAGTT	2	12	907906	907917	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019738	GAGAAT	2	12	927984	927995	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019738	GTACAA	2	12	940203	940214	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_019738	TCAATA	2	12	971745	971756	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_019738	CATCTC	2	12	974555	974566	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_019738	CAGTTT	2	12	1018845	1018856	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_019738	TGAATT	2	12	1020107	1020118	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019738	GCTACC	2	12	1020390	1020401	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_019738	TCCGTC	3	18	1021183	1021200	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
65	NC_019738	CTTCAA	2	12	1032154	1032165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019738	ACTGAT	2	12	1089517	1089528	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_019738	AACAGA	2	12	1090845	1090856	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_019738	TACTTA	2	12	1122282	1122293	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_019738	TATAGA	3	18	1150612	1150629	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019738	TTGGTT	2	12	1171838	1171849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019738	ACCTTG	2	12	1204232	1204243	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019738	AATAAA	2	12	1205938	1205949	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019738	TAGTTT	2	12	1205992	1206003	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019738	TCCTCA	2	12	1226728	1226739	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_019738	CAGGAT	2	12	1243502	1243513	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_019738	ATTTTT	2	12	1324953	1324964	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019738	AAAAAG	2	12	1340834	1340845	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019738	CATCTA	2	12	1350856	1350867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019738	TGGGGG	2	12	1381518	1381529	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019738	TGGGGG	3	18	1439233	1439250	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019738	TTGGGG	2	12	1443652	1443663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019738	CAGTTC	2	12	1463962	1463973	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_019738	AGTTAA	2	12	1477161	1477172	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019738	CTTTCT	2	12	1482811	1482822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019738	ATTTGA	2	12	1495458	1495469	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019738	CAAAAT	2	12	1523528	1523539	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_019738	TAACCT	2	12	1545127	1545138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019738	GTCAGG	2	12	1563939	1563950	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_019738	ACGGAC	2	12	1571406	1571417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019738	AACAAG	2	12	1579551	1579562	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_019738	GATAAT	2	12	1582065	1582076	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019738	GAATGA	2	12	1582625	1582636	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019738	AGCTTT	2	12	1607592	1607603	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_019738	CTATTA	2	12	1644286	1644297	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_019738	GGGTTG	2	12	1644339	1644350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019738	GCAAGA	2	12	1644454	1644465	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_019738	ATTTTG	2	12	1669033	1669044	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019738	CCTTTC	2	12	1695522	1695533	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_019738	AAAGGC	2	12	1726078	1726089	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_019738	GTTTGA	2	12	1801981	1801992	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019738	ATAAAT	2	12	1812642	1812653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019738	TTTTAT	2	12	1843093	1843104	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019738	ACAGCA	2	12	1854829	1854840	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_019738	GTTTTA	2	12	1855729	1855740	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019738	TTCCCC	2	12	1871253	1871264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_019738	ATATAA	2	12	1930736	1930747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019738	TGAAAG	2	12	1938173	1938184	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019738	CCCCTA	2	12	1938578	1938589	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_019738	ATGAAC	2	12	1955656	1955667	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_019738	ATGACA	2	12	1961675	1961686	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_019738	CTTAAA	2	12	1972112	1972123	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_019738	TTGACA	2	12	2049206	2049217	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_019738	ATTTTG	2	12	2070934	2070945	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019738	TGTAGC	2	12	2098400	2098411	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_019738	CTTGTC	2	12	2110300	2110311	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_019738	CAGACA	2	12	2127375	2127386	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019738	AGAGAA	2	12	2145653	2145664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019738	TTATTT	2	12	2162813	2162824	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019738	TGATTT	2	12	2162928	2162939	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019738	ACGGCT	2	12	2246226	2246237	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_019738	TCAGAG	2	12	2267999	2268010	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_019738	AGTTCT	2	12	2278519	2278530	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_019738	ATTTAT	2	12	2290350	2290361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019738	CTTGAC	2	12	2291317	2291328	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_019738	TTGATA	3	18	2326747	2326764	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019738	GACTGC	2	12	2352401	2352412	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_019738	ATGCTG	2	12	2353510	2353521	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_019738	GCGGCA	2	12	2365783	2365794	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_019738	AGGTCA	2	12	2425699	2425710	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_019738	GGCGAT	2	12	2480163	2480174	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_019738	GTTCTG	2	12	2506906	2506917	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_019738	TGGCAG	2	12	2514869	2514880	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_019738	ATCACC	2	12	2534025	2534036	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_019738	GAAAAA	2	12	2538965	2538976	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019738	AAGTTA	2	12	2550645	2550656	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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137	NC_019738	TCAACG	2	12	2593340	2593351	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_019738	CATCCT	2	12	2614266	2614277	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_019738	GTTGAA	2	12	2623942	2623953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019738	TCGCTT	2	12	2626226	2626237	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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144	NC_019738	TCAAGT	2	12	2651147	2651158	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_019738	TTCAAT	2	12	2683494	2683505	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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148	NC_019738	GATGAG	2	12	2719149	2719160	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019738	AACCTA	2	12	2749914	2749925	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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152	NC_019738	TTTGTG	2	12	2797731	2797742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_019738	CTTCTA	2	12	2886654	2886665	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_019738	AAATAA	2	12	2887494	2887505	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_019738	TACAGT	3	18	2887570	2887587	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
159	NC_019738	AAGCTG	2	12	2887658	2887669	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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163	NC_019738	CGATTA	2	12	2932483	2932494	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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243	NC_019738	ATCGAA	2	12	4339784	4339795	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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245	NC_019738	TCCTCA	2	12	4342281	4342292	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
246	NC_019738	GCAAAG	2	12	4382920	4382931	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
247	NC_019738	AAGCTT	2	12	4398977	4398988	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
248	NC_019738	AGGCTA	2	12	4414281	4414292	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
249	NC_019738	AAAATC	2	12	4418690	4418701	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
250	NC_019738	TCTTAA	2	12	4436410	4436421	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
251	NC_019738	CTGGCT	2	12	4436429	4436440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
252	NC_019738	TGCCTA	2	12	4447804	4447815	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
253	NC_019738	TCGGAT	2	12	4453825	4453836	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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363	NC_019738	CCAAAA	2	12	6205339	6205350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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365	NC_019738	TCCCAA	2	12	6241022	6241033	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
366	NC_019738	CCTCAT	2	12	6249141	6249152	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.