MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 chromosome

Total Repeats: 18616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019738	GTAA	2	8	129	136	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019738	CAGC	2	8	409	416	25 %	0 %	25 %	50 %	428308378
3	NC_019738	GCTG	2	8	740	747	0 %	25 %	50 %	25 %	428308378
4	NC_019738	CACT	2	8	1256	1263	25 %	25 %	0 %	50 %	428308378
5	NC_019738	AGTA	2	8	1825	1832	50 %	25 %	25 %	0 %	428308379
6	NC_019738	GATT	2	8	1899	1906	25 %	50 %	25 %	0 %	428308379
7	NC_019738	TGAC	2	8	2049	2056	25 %	25 %	25 %	25 %	428308379
8	NC_019738	CAAG	2	8	2628	2635	50 %	0 %	25 %	25 %	428308380
9	NC_019738	CTTT	2	8	3139	3146	0 %	75 %	0 %	25 %	428308380
10	NC_019738	TGAT	2	8	3242	3249	25 %	50 %	25 %	0 %	428308380
11	NC_019738	AATG	2	8	3288	3295	50 %	25 %	25 %	0 %	428308380
12	NC_019738	TCCC	2	8	4970	4977	0 %	25 %	0 %	75 %	428308381
13	NC_019738	CAAT	2	8	5122	5129	50 %	25 %	0 %	25 %	428308381
14	NC_019738	GGCT	2	8	5746	5753	0 %	25 %	50 %	25 %	428308382
15	NC_019738	TTTA	2	8	6362	6369	25 %	75 %	0 %	0 %	428308383
16	NC_019738	GTTG	2	8	6514	6521	0 %	50 %	50 %	0 %	428308383
17	NC_019738	ATCT	2	8	7010	7017	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_019738	ACAA	2	8	7372	7379	75 %	0 %	0 %	25 %	428308384
19	NC_019738	TCAA	2	8	7469	7476	50 %	25 %	0 %	25 %	428308384
20	NC_019738	GACA	2	8	7584	7591	50 %	0 %	25 %	25 %	428308384
21	NC_019738	GCTC	2	8	7673	7680	0 %	25 %	25 %	50 %	428308384
22	NC_019738	CAGA	2	8	7899	7906	50 %	0 %	25 %	25 %	428308384
23	NC_019738	TCGC	2	8	9423	9430	0 %	25 %	25 %	50 %	428308385
24	NC_019738	GTTT	2	8	9610	9617	0 %	75 %	25 %	0 %	428308385
25	NC_019738	GCAG	2	8	9658	9665	25 %	0 %	50 %	25 %	428308385
26	NC_019738	GTCT	2	8	9772	9779	0 %	50 %	25 %	25 %	428308385
27	NC_019738	ATTG	2	8	10093	10100	25 %	50 %	25 %	0 %	428308385
28	NC_019738	AATT	2	8	10221	10228	50 %	50 %	0 %	0 %	428308385
29	NC_019738	GAGC	2	8	10326	10333	25 %	0 %	50 %	25 %	428308385
30	NC_019738	GGCA	2	8	10521	10528	25 %	0 %	50 %	25 %	428308385
31	NC_019738	GAGT	2	8	10794	10801	25 %	25 %	50 %	0 %	428308385
32	NC_019738	GAGC	2	8	10931	10938	25 %	0 %	50 %	25 %	428308385
33	NC_019738	CAAA	2	8	11333	11340	75 %	0 %	0 %	25 %	428308385
34	NC_019738	TTGA	2	8	11495	11502	25 %	50 %	25 %	0 %	428308385
35	NC_019738	CCAA	2	8	11658	11665	50 %	0 %	0 %	50 %	428308385
36	NC_019738	CTAT	2	8	12054	12061	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019738	ATAG	2	8	12062	12069	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019738	ATCA	2	8	12562	12569	50 %	25 %	0 %	25 %	428308386
39	NC_019738	CCAA	2	8	12590	12597	50 %	0 %	0 %	50 %	428308386
40	NC_019738	TTAA	2	8	13036	13043	50 %	50 %	0 %	0 %	428308386
41	NC_019738	TCTT	2	8	14456	14463	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_019738	TAGT	2	8	14921	14928	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019738	AGGA	2	8	15115	15122	50 %	0 %	50 %	0 %	428308389
44	NC_019738	GGAA	2	8	15347	15354	50 %	0 %	50 %	0 %	428308389
45	NC_019738	ATGT	2	8	15751	15758	25 %	50 %	25 %	0 %	428308389
46	NC_019738	ATCG	2	8	16058	16065	25 %	25 %	25 %	25 %	428308389
47	NC_019738	AATT	2	8	16248	16255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019738	TCCA	2	8	17294	17301	25 %	25 %	0 %	50 %	428308390
49	NC_019738	CGGA	2	8	17476	17483	25 %	0 %	50 %	25 %	428308390
50	NC_019738	AAGA	2	8	17545	17552	75 %	0 %	25 %	0 %	428308390
51	NC_019738	ACCC	2	8	18485	18492	25 %	0 %	0 %	75 %	428308390
52	NC_019738	GGTA	2	8	19061	19068	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019738	CCGA	2	8	19515	19522	25 %	0 %	25 %	50 %	428308392
54	NC_019738	GCAG	2	8	19545	19552	25 %	0 %	50 %	25 %	428308392
55	NC_019738	CAAA	2	8	19715	19722	75 %	0 %	0 %	25 %	428308392
56	NC_019738	GTTG	2	8	20477	20484	0 %	50 %	50 %	0 %	428308393
57	NC_019738	CATT	2	8	20648	20655	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_019738	CTTG	2	8	20702	20709	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_019738	GTCT	2	8	20938	20945	0 %	50 %	25 %	25 %	428308394
60	NC_019738	GCTG	2	8	21064	21071	0 %	25 %	50 %	25 %	428308394
61	NC_019738	CTCA	2	8	21420	21427	25 %	25 %	0 %	50 %	428308394
62	NC_019738	CGAT	2	8	21607	21614	25 %	25 %	25 %	25 %	428308394
63	NC_019738	TGCT	2	8	22260	22267	0 %	50 %	25 %	25 %	428308395
64	NC_019738	TGGT	2	8	22547	22554	0 %	50 %	50 %	0 %	428308395
65	NC_019738	CTTC	2	8	23795	23802	0 %	50 %	0 %	50 %	428308397
66	NC_019738	TTCT	2	8	23900	23907	0 %	75 %	0 %	25 %	428308397
67	NC_019738	CGTG	2	8	24226	24233	0 %	25 %	50 %	25 %	428308397
68	NC_019738	ATTA	2	8	24397	24404	50 %	50 %	0 %	0 %	428308397
69	NC_019738	CAGC	2	8	25379	25386	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_019738	CTTT	2	8	25448	25455	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_019738	TCGT	2	8	25471	25478	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_019738	CTTC	2	8	25882	25889	0 %	50 %	0 %	50 %	428308398
73	NC_019738	CATC	2	8	25958	25965	25 %	25 %	0 %	50 %	428308398
74	NC_019738	TATT	3	12	26295	26306	25 %	75 %	0 %	0 %	428308399
75	NC_019738	GGAT	2	8	26400	26407	25 %	25 %	50 %	0 %	428308399
76	NC_019738	ATTT	2	8	26425	26432	25 %	75 %	0 %	0 %	428308399
77	NC_019738	CCAG	2	8	26717	26724	25 %	0 %	25 %	50 %	428308400
78	NC_019738	CAAA	2	8	26808	26815	75 %	0 %	0 %	25 %	428308400
79	NC_019738	AGGA	2	8	27419	27426	50 %	0 %	50 %	0 %	428308400
80	NC_019738	AATC	2	8	27559	27566	50 %	25 %	0 %	25 %	428308400
81	NC_019738	TTCA	2	8	27599	27606	25 %	50 %	0 %	25 %	428308400
82	NC_019738	ATCA	2	8	27647	27654	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_019738	AGCT	2	8	28843	28850	25 %	25 %	25 %	25 %	428308401
84	NC_019738	GTAA	2	8	30025	30032	50 %	25 %	25 %	0 %	428308402
85	NC_019738	ATGA	2	8	30552	30559	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019738	TCGG	2	8	30747	30754	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_019738	TCCC	2	8	30960	30967	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
88	NC_019738	GCAG	2	8	31588	31595	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_019738	GCTG	2	8	32161	32168	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_019738	AGCT	2	8	32795	32802	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_019738	TCGG	2	8	32859	32866	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_019738	TCGC	2	8	33385	33392	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_019738	TGCT	2	8	33529	33536	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_019738	CGAC	2	8	34051	34058	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_019738	TCGC	3	12	34403	34414	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_019738	TTTG	2	8	35616	35623	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019738	TAAA	2	8	36250	36257	75 %	25 %	0 %	0 %	428308403
98	NC_019738	CTAG	2	8	36510	36517	25 %	25 %	25 %	25 %	428308403
99	NC_019738	AAGT	2	8	37019	37026	50 %	25 %	25 %	0 %	428308403
100	NC_019738	CAAT	2	8	37365	37372	50 %	25 %	0 %	25 %	428308404
101	NC_019738	ACAG	2	8	37698	37705	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_019738	TTCC	2	8	38332	38339	0 %	50 %	0 %	50 %	428308405
103	NC_019738	TACT	2	8	39075	39082	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_019738	AAAT	2	8	39247	39254	75 %	25 %	0 %	0 %	428308406
105	NC_019738	ATTG	2	8	39803	39810	25 %	50 %	25 %	0 %	428308406
106	NC_019738	ATTG	2	8	41220	41227	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019738	AGAT	2	8	41856	41863	50 %	25 %	25 %	0 %	428308408
108	NC_019738	CATG	2	8	41992	41999	25 %	25 %	25 %	25 %	428308408
109	NC_019738	CTTT	2	8	42370	42377	0 %	75 %	0 %	25 %	428308408
110	NC_019738	TGAG	2	8	42809	42816	25 %	25 %	50 %	0 %	428308409
111	NC_019738	GACT	2	8	43520	43527	25 %	25 %	25 %	25 %	428308409
112	NC_019738	AATT	2	8	43629	43636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019738	GGCT	2	8	47038	47045	0 %	25 %	50 %	25 %	428308414
114	NC_019738	ATTG	2	8	47060	47067	25 %	50 %	25 %	0 %	428308414
115	NC_019738	GTCC	2	8	47235	47242	0 %	25 %	25 %	50 %	428308414
116	NC_019738	TCCT	2	8	48913	48920	0 %	50 %	0 %	50 %	428308415
117	NC_019738	CATC	2	8	49088	49095	25 %	25 %	0 %	50 %	428308415
118	NC_019738	CACC	2	8	49445	49452	25 %	0 %	0 %	75 %	428308415
119	NC_019738	ACCA	2	8	50358	50365	50 %	0 %	0 %	50 %	428308416
120	NC_019738	GTCG	2	8	50469	50476	0 %	25 %	50 %	25 %	428308416
121	NC_019738	AATG	2	8	50477	50484	50 %	25 %	25 %	0 %	428308416
122	NC_019738	CCCG	2	8	50807	50814	0 %	0 %	25 %	75 %	428308417
123	NC_019738	ACCA	2	8	51453	51460	50 %	0 %	0 %	50 %	428308417
124	NC_019738	AACG	2	8	51480	51487	50 %	0 %	25 %	25 %	428308417
125	NC_019738	GAAA	2	8	52569	52576	75 %	0 %	25 %	0 %	428308419
126	NC_019738	TCCT	2	8	53189	53196	0 %	50 %	0 %	50 %	428308419
127	NC_019738	AATT	2	8	53212	53219	50 %	50 %	0 %	0 %	428308419
128	NC_019738	CGAT	2	8	53412	53419	25 %	25 %	25 %	25 %	428308420
129	NC_019738	GCTT	2	8	55141	55148	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_019738	TAAG	2	8	55857	55864	50 %	25 %	25 %	0 %	428308422
131	NC_019738	TAAG	2	8	56224	56231	50 %	25 %	25 %	0 %	428308422
132	NC_019738	GGTG	2	8	56379	56386	0 %	25 %	75 %	0 %	428308422
133	NC_019738	CCGT	2	8	56435	56442	0 %	25 %	25 %	50 %	428308422
134	NC_019738	TTGA	2	8	56516	56523	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019738	TCAA	2	8	56641	56648	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_019738	GCTT	2	8	57118	57125	0 %	50 %	25 %	25 %	428308423
137	NC_019738	GATT	2	8	57454	57461	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019738	ATCG	2	8	57569	57576	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_019738	TGAT	2	8	57878	57885	25 %	50 %	25 %	0 %	428308424
140	NC_019738	TCAC	2	8	58048	58055	25 %	25 %	0 %	50 %	428308424
141	NC_019738	TCGG	2	8	58554	58561	0 %	25 %	50 %	25 %	428308425
142	NC_019738	GACA	2	8	58894	58901	50 %	0 %	25 %	25 %	428308425
143	NC_019738	TGAT	2	8	59440	59447	25 %	50 %	25 %	0 %	428308425
144	NC_019738	TTCT	2	8	59620	59627	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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